고추냉이에서 분리한 담배 모자이크 바이러스(TMV-W)의 전체 유전자 염기서열 분석

이귀재(Kui-Jae Lee) 한국자원식물학회 2003 한국자원식물학회지 Vol.16 No.1

고추냉이에 모자이크 병징을 나타내는 이병주로부터 고추냉이 모자이크 바이러스를 분리하였다. 고추냉이 모자이크 바이러스의 genomic RNA를 추출하여 전체 유전자 구조를 결정하였다. 유전자 전체길이는 6,298 염기를 가지고 있었으며, 4개 ORF로 구성 되어 있었다. ORF 1은 180KD 단백질, ORF 2는 130KD 단백질 , ORF 3은 30KD 단백질, ORF4는 18KD로 외피단백질로 구성되어 있었다. ORF 유전자간에는 ORF4와 ORF 3 유전자간 130개의 염기, ORF 2와 ORF 3 유전자갈 20개 염기 그리고 ORF 1 과 ORF2 유전자간에는 40개의 염기로 overlaps되어 있었다 3 NCR부분은 238개 염기, 외피단백질은 537개 염기, 30KD 이동단백질은 825개 염기, 130KD 단백질은 1,896개 염기와 180k단백질의 2,958개의 염기로 구성되어 있었다. TMV-WTF전체 염기 서열의 유전자 상동성에서는 비교 유전자에서 미보고된 일본의 TMV-WSF와 러시아의 TMV-crucifer와 각각 98.6%와 82.4%로 매우 높았다. Genomic RNA sequence of a tobamovirus infecting Eutrema wasabi plant(TMV-W) was determined. The RNA is composed 6,298 nucleotide and contains four OREs encoding the protein of 180KD(OREI), 130KD(ORE2),30KD(ORF3) and 18KD(coat protein, ORF4). ORE4, ORF 3, ORF 2 and ORF 1 are overlaped by 130, 20 and 40 nucleotides, and the overapping region can be folded into a stable hairpin styucture. This includes the 3 non-coding region of 238 nucleotides, coat protein gene(537 nucleotides,179 amino acid), 30KD movement protein gene(825 nucleotides, 275 amino acid), 13(IKD protein gene(1,896 nucleotides, 632 amino acid) and 180KD protein gene(2,958 nucleotides, 986 amino acid). The genomic RNA sequence was compared with homologous regions of eleven other tobamoviruses. TMV-WTE was similar to TMV-WSF(98.6%) in nucleotide sequence.

Sequence Analysis of the 3 - Terminal Regions of RNA 1 of Korea lsolates of Barley Yellow Mosaic Virus

이귀재(Kui Jae Lee),박종철(Jong Chul Park),이용훈(Young Hoon Lee),이두구(Doo Ku Lee),최민경(Min Kyung Choi),이왕휴(Wang Hyu Lee) 전북대학교 농업과학기술연구소 2002 농업생명과학연구 Vol.33 No.-

감나무 가지마름병에서 분리한 Pestalotia kaki 의 2 계통

이귀재(Kui Jae Lee),전길형(Gil Hyong Chon),김형무(Hyung Moo Kim),소인영(In Young So),최정식(Jeung Sik Choi) 전북대학교 농업과학기술연구소 1994 농업생명과학연구 Vol.25 No.-

Pseudomonas sp. G19에 의한 배추의 염 스트레스 경감 및 생장 촉진

이건웅,이귀재,채종찬,Lee, Gun Woong,Lee, Kui-Jae,Chae, Jong-Chan 한국미생물학회 2014 미생물학회지 Vol.50 No.4

염 스트레스를 비롯한 다양한 비생물학적 스트레스는 식물의 생장저해와 작물 생산량을 감소시키는 요인으로 작용한다. 계화도 간척지 토양에서 식물생장 촉진 세균을 분리하여 Pseudomonas sp. G19로 명명하였다. G19 균주는 36시간 배양 후 $7.5{\mu}g/ml$의 indole acetic acid를 생산하고 불용성인산을 25% 가용화시켰으며, 식물의 에틸렌 감소와 관련된 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase를 발현하였다. 또한 150 mM NaCl에 침지된 염 조건의 토양에서 재배된 유묘기 배추를 이용한 실증실험에서 G19 균주는 배추의 생체중량을 증가시킴으로써 염 스트레스의 경감 및 생장 촉진에 관여함을 알 수 있었다. A variety of abiotic stresses limit plant growth and crop productivity. Among the abiotic stress, salinity is one of the major harmful stresses to plants. Plant growth-promoting bacterium was isolated from reclaimed land soil of Kyehwa-do and identified as Pseudomonas. Pseudomonas sp. strain G19 produced $7.5{\mu}g/ml$ of indole acetic acid and solubilized 25% of insoluble phosphate after 36 h cultivation. Also, G19 was able to produce a protein that was structurally homologous to 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase of Pseudomonas fluorescens KACC10070 playing a role in reduction of ethylene in plant. The strain G19 increased the biomass of Chinese cabbage seedlings grown in the presence of 150 mM NaCl. The results indicated that the strain G19 promoted the growth of Chinese cabbage seedling under salinity stress through microbe-plant interactions.

감나무 가지마름 ( 지고 (枝枯) ) 병 증상에 관여하는 병원균의 분리

김형무(Hyung Moo Kim),이귀재(Kui Jae Lee),소인영(In Young So),김우철(Ou Cheol Kim),최정식(Jeong Sik Choi) 전북대학교 농업과학기술연구소 1992 농업생명과학연구 Vol.23 No.-

전북지역의 수박 바이러스병 발생 실태

최민경 ( Min Kyung Choi ),이귀재 ( Kui Jae Lee ) 전북대학교 농업과학기술연구소 2009 농업생명과학연구 Vol.40 No.2

2007년부터 2008년까지 전북지역 수박주산지의 바이러스병 포장발생률과 이병주율을 조사하였다. 모자이크와 괴사반점과 같은 전형적인 병징을 보이는 바이러스 감염 포장발생률은 2007년 12.2~35.7%보다 2008년 35.7~55.6%로 좀 더 높은 것으로 나타났다. 수박재배지의 바이러스병은 2007년보다 2008년에 발생이 심한 것으로 나타났다. 바이러스 검정은 과실과 잎에 병징을 보이는 시료를 채취하여 박과작물에 바이러스병을 일으키는 7종의 바이러스에 대해 RT-PCR을 수행하여 검출하였다. 시설재배에서는 CGMMV가 우점하여 발생하는 반면 노지재배에서는 WMV2가 우점하는 것으로 조사되었다. 또한, 이 연구에서 고창지역에서도 MNSV는 수박포장에 발생하는 것으로 나타났다. 그러므로 MNSV는 새롭게 출현하는 바이러스로서 이에 대한 새로운 방제체계가 필요할 것이다. Viral disease occurrence and the incidence were investigated in major watermelon cultivation regions in Jeonbuk province for two years in 2007 and 2008. The average infected fields rate measured by typical viral symptoms such as mosaic and yellowish spots on leaves or fruits were more higher in 2008 with 35.7 to 55.6% disease incidence than in 2007 with 12.2 to 35.7%. The viral detection was done using by RT-PCR method for the collections showing symptoms in leaves and fruits to major seven viruses occurred in cucurbit plants in Korea. Symptoms caused by mainly cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV) was dominant virus in green house cultivation, while watermelon mosaic virus 2 (WMV2) was dominant in field cropping conditions. In this investigation, melon necrotic spot virus (MNSV) was first detected from watermelon in Gochang. Thus, a new system to control the newly emerging virus need to be established.

항진균 세균과 난용성 인산염 가용화 효모의 혼합 배양액을 이용한 고추 병해의 생물학적 방제

이건웅,민병대,박수정,정원화,고은별,이귀재,채종찬,Lee, Gun Woong,Min, Byung-Dae,Park, Sujeong,Jheong, Weonhwa,Go, Eun Byeul,Lee, Kui-Jae,Chae, Jong-Chan 한국미생물학회 2013 미생물학회지 Vol.49 No.4

고추생장 촉진을 위해 병원균에 대한 방제력과 난용성 인산염에 대한 가용화 활성을 보이는 미생물 혼합배양액의 효과를 검증하였다. Saccharomyces sp. L13은 난용성 인산염에 대한 가용화 활성으로 분리되었으며 Bacillus sp. L32는 고추역병과 고추탄저병에 대한 길항력 활성으로 분리되었다. 특히 L32 균주는 대치배양법과 잎을 이용한 실증실험에서 모두 길항능력을 보였으며 시설재배를 이용한 실증실험에서도 병의 발병율을 저감시켰다. 두 균주의 혼합배양은 각 균주들의 생장율에 영향을 주지 않았으며 고추에 대한 혼합배양액 처리는 고추역병과 고추탄저병의 발병율을 저감시키는 동시에 난용성 인산염의 가용화를 통해 고추의 생장율을 증대시키는 효과를 확인할 수 있었다. 본 결과는 두 균주의 혼합배양액이 작물재배를 위한 미생물제제로서 잠재적 효용성이 높다는 것을 제시한다. This study was to investigate beneficial effects of microbial mixture on red pepper which was capable of promoting plant growth by solubilizing insoluble phosphate as well as protecting plants from pathogenic attack. Saccharomyces sp. L13 was isolated for phosphate solubilizing activity on aluminium phosphate, tricalcium phosphate, calcium hydrophosphate, and magnesium hydrophosphate. On the other hand, Bacillus sp. L32 was isolated for antagonistic activity against Phytophthora capsisi and Colletotrichum gloeosporioides, causing Phytophthora blight and Anthracnose disease in pepper, respectively. The strain L32 exhibited antagonistic activities both under dual culture assays and detached leaves assays. The each strain under the condition of mixed cultivation exhibited the same growth rates as one under pure cultivation. In greenhouse study, the mixed culture showed the both effect of plant growth promotion and reduction of disease symptom development against P. capsisi and C. gloeosporioides providing a potential as effective microbial agent for plant husbandry.

지황(Rehmannia glutinosa Libosch)에서 분리한 Tobacco Mosaic Virus의 특성

박준식(Jun Sic Park),최민경(Min Kyung Choi),유강열(Kang-Yeol Yu),이귀재(Kui Jae Lee) 한국자원식물학회 2003 한국자원식물학회지 Vol.16 No.3

전라북도의 진안, 장수, 정읍 등의 3개 지역에서 재배하고 있는 지황에 바이러스 병징이 관찰되어 ELISA 방법으로 TMV의 감염 여부를 확인한 결과 3개 지역 모두에서 ELISA 양성 반응을 나타내었다. N. glutinosa를 이용, 순수분리 및 증식한 이병주의 바이러스 입자를 관찰한 결과, 폭 18nm, 길이 300nm의 막대 모양의 바이러스가 관찰되었다. 또한 epoxy수지를 통해 이병조직의 세포질내에서 많은 바이러스 입자가 군집 또는 산재되어 있음이 관찰되었다. TMV의 병징은 즙액 접종 4주 후부터 담배 잎의 본엽에 부분적으로 반점이 보이다가 4­6주 후에는 황화 현상과 괴사 현상이 나타났다. 이병주로부터 total RNA를 분리하여 RT­PCR을 수행한 결과 531bp DNA 증폭 산물을 얻었으며 genetyx win program을 이용하여 외피단백질의 염기수준에서 비교 분석한 결과, TMV­T, V, To 세 계통에서 각각 94.83%로 가장 높게 나타났고, TMV­P계통에서 67.35%로 가장 낮게 나타났다. 아미노산 수준에서는 TMV­T, V, To 세 계통에서 각각 97.65%로 가장 높게 나타났고, TMV­P계통에서 72.22%로 가장 낮게 나타났다. 기타 계통들간에는 TMV­152, F 계통에서 94.05%, TMV­C 계통에서 68.63% 유사도를 나타냈다. This study was conducted to investigate the occurrence and characterization of tobacco mosaic virus(TMV) in Chinese foxglove isolated from the field of the Chonbuk province(Jinan, Jangsu, Jeongeup). TMV was detected in all three regions and confirmed positive reaction by ELISA test. In the host range test, Chenopodium amaranticola, Nicotiana glutinosa, N. tabacum cv. Bright yellow , N. tabacum cv. KY­57, Datura stramonium were locally infected with the virus. The virus produced mosaic symptom on inoculated leaves of N. tabacum cv. Samson . However, Chenopodium quinoa, Glycine max, Raphanus sativus, Cucumis sativus, Cucurbita moschata, Brassica rape and Lycopersion esculentum did not show any symptoms. TMV particles were revealed as a stiff rod shape by transmission electron microscopic(TEM) and measured as 300 nm in length with 18 nm in diameter. Total RNA was extracted from showing symptom loaves infected with TMV and the reverse transcription­polymerase chain reaction (RT­PCR) obtained 531 bp DNA product of RNA with specific primer used. The capsid protein of TMV­RE showed higher amino acid sequence homology(97.7%) with TMV­To than with TMV­P(72.2%). The capsid protein of TMV­152 showed same amino acid sequence homology with TMV­F. The result of comparison of nucleotides sequence homology between TMV­RE strain and other TMV strain showed 94% homology with others except TMV­P(67.3%) and TMV ­ C(68.6%).

Mycoplasma 에 나병된 고구마와 붉나무엽의 전기영동에 의한 단백질 비교

소인영(In Young So),김영호(Young Ho Kim),김형무(Hyung Moo Kim),이귀재(Kui Jae Lee),채정기(Jyung Ki Chai) 전북대학교 농업과학기술연구소 1987 농업생명과학연구 Vol.18 No.-

형태적 특징 및 다좌위 염기서열 분석에 의한 산철쭉 모무늬병균 Sphaerulina azaleae 동정

최인영 ( In-young Choi ),최영준 ( Young-joon Choi ),이귀재 ( Kui-jae Lee ),주호종 ( Ho-jong Ju ),조성완 ( Seong-wan Cho ),신현동 ( Hyeon-dong Shin ) 한국균학회 2020 韓國菌學會誌 Vol.48 No.3

From 2008 to 2017, Korean azalea (Rhododendron yedoense f. poukhanense) showing angular, necrotic leaf spots were found in Jeju and Hongcheon, Korea. The lesions occurred frequently, detracting from the beauty of the glossy green leaves of the plant and causing premature defoliation. Therefore, to identify the fungus associated with the lesions, morphological characterization and molecular phylogenetic analysis of actin (Act), translation elongation factor 1-alpha (EF), internal transcribed spacer (ITS), 28S nrDNA (LSU), and RNA polymerase II encoding the second largest subunit (RPB2) of the two representative isolates were performed. The phylogenetic tree inferred from the neighbor-joining method showed the isolates clustering in the Sphaerulina azaleae group. Therefore, the fungus associated with the angular leaf spots on the Korean azalea was identified as Sphaerulina azaleae.