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- 저자 : 류상미 ( Sang Mi Ryou ) (검색결과 3 건)
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RraB의 발현에 따른 대장균의 성장 저해의 원인 규명
류상미,염지현,고하영,신은경,이강석,Ryou, Sang-Mi,Yeom, Ji-Hyun,Go, Ha-Young,Shin, Eun-Kyoung,Lee, Kang-Seok 한국미생물학회 2010 미생물학회지 Vol.46 No.2
RNase E는 대장균 내에 있는 수많은 RNA의 분해와 가공에 관여하며, 또한 RNA 대사 작용에 관련된 거대한 단백질 복합체인 데그라도좀을 구성하는 중요한 효소로 알려져 있다. RraA와 RraB는 최근에 밝혀진 RNase E의 단백질 저해제이며, 진화적으로 잘 보존되어 있다. 이 연구에서는 RraA를 발현 시킬 때와는 달리 세포 내에서 RraB를 발현 시키면, RNase E의 과발현에 따른 세포의 성장 저해를 회복시키지 못하고 더 저해하는 것을 확인하였다. 이 현상이 RraA와 RraB가 세포내 RNase E의 기질들에 대해 특이적으로 영향을 미치기 때문인지를 알아보기 위해 세 개의 RNase E 기질을 분석하였다. 그 결과, ColE1-타입 플라스미드의 복제수를 조절하는 RNA I과 라이보좀 단백질 S15를 코딩하는 rpsO mRNA의 경우 RraA가 RraB 보다 효과적으로 RNase E의 활성을 저해하며, RNase P의 RNA 구성요소의 전구체인 pM1 RNA에 대한 RNase E의 효소 활성은 RraB가 저해하지 못하는 것을 관찰하였다. 이 결과는 RraB가 RraA보다는 높은 기질 특이적으로 RNase E의 효소활성을 저해하며, 이러한 이유로 RNase E의 과발현에 의한 세포의 성장 저해를 RraB의 과발현으로 극복할 수 없었다고 추론할 수 있다. RNase E plays a major role in the degradation and processing of a large number of RNA transcripts in Escherichia coli and forms the core component of the degradosome, a large protein complex involved in RNA metabolism. RraA and RraB are recently discovered protein inhibitors of RNase E and are evolutionarily conserved. In this study, we observed that, unlike RraA, overexpression of RraB did not rescue growth arrest of E. coli cells overexpressing RNase E. To examine whether this phenomenon stems from differential inhibitory effects of RraA and RraB on RNase E substrates, we analyzed three in vivo RNase E substrates. The results showed that RraA inhibited RNase E activity more efficiently than RraB on the degradation of RNA I, which controls the copy number of ColE1-type plasmid, and rpsO mRNA encoding ribosomal protein S15, while RraB was unable to inhibit the processing of pM1 RNA, a precursor of the RNA component of RNase P, by RNase E. Our results imply that RraB inhibits RNase E activity in a more substrate-dependent manner than RraA and this property of RraB may explain why overexpression of RraB could not rescue cells overexpressing RNase E from growth arrest.
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Escherichia coli 16S rRNA의 789 염기의 기능분석 및 이차복귀돌연변이체 발췌를 위한 방법 개발
김종명,고하영,송우석,류상미,이강석,Kim Jong-Myung,Go Ha-Young,Song Woo-Seok,Ryou Sang-Mi,Lee Kang-Seok 한국미생물학회 2006 미생물학회지 Vol.42 No.2
Escherichia coli 16S rRNA의 잘 보존된 부분인 790 loop의 즉흥진화를 통한 분석에서 리보솜의 단백질 수행기능을 위해서 필수불가결한 것으로 추측되는 789번 위치에 염기치환을 유발하여 제작한 변이체 리보솜의 기능을 chloramphenicol acetyltransfernse mRNA의 단백질로의 번역능력 차이에 따른 chloramphenicol에 대한 저항성의 정도를 측정함으로써 분석하였다. 예상했던 바와 같이 모든 변이체 리보솜의 단백질 합성능력은 현저히 저하되었으며, 789 염기의 단백질합성에서의 기능을 규명하기 위하여 16S rRNA 변이체의 기능을 회복시키는 이차복귀돌연변이(second-site revertant)를 발췌하는 효과적인 유전학적 실험방법을 개발하였다. A base substitution was introduced at the position 789 in Escherichia coli 16S rRNA, which was previously identified as an invariant residue for ribosome function and the ability of the mutant ribosomes to translate chloramphenicol acetyltransfernse mRNA was measured by determining the degree of resistance to chloramphenicol of cells expressing these mutant ribosomes. As expected, mutant ribosomes containing a base sub-stitution at the position 789 showed significantly reduced protein-synthesis ability and to identify a functional role played by this residue in protein synthesis, we developed an efficient genetic method to select second-site revertants in 16S rRNA that restore protein-synthesis function to these mutant ribosomes.
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Escherichia coli 16S rRNA 상의 770 위치에 염기치환을 가진 변이체 리보솜의 단백질 합성 능력을 회복시키는 이차복귀돌연변이체의 발췌
하혜정 ( Hye Jeong Ha ),류상미 ( Sang Mi Ryou ),이강석 ( Kang Seok Lee ),전체옥 ( Che Ok Jeon ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2011 한국미생물·생명공학회지 Vol.39 No.1
대장균의 16S rRNA 염기 중 진화적으로 매우 보존되어 있는 B2c 인터브리지의 구성요소 중 하나인 C770염기에 치환을 일으키면 단백질 합성이 저하되는 것으로 알려져 있다. 이 연구에서는 770 위치에 C에서 G로 염기치환(C770G)된 16S rRNA의 기능을 회복시키는 이차복귀돌연변이(secondsite revertant)를 얻기 위해 16S rRNA를 암호화하는 DNA부분에 무작위로 염기치환을 유발시켜, 재조합 리보솜이 번역하는 CAT mRNA로부터의 단백질 합성능력이 향상된 클론을 선별하였다. 이 실험으로 C770G 염기치환을 가진 변이체 리보솜의 단백질 합성능력을 일부 회복시키는 하나의 이차복귀돌연변이체를 획득하였으며, DNA 염기분석을 통하여 C569G와 U904C 염기치환을 가진 것을 확인하였다. 이러한 연구결과를 이용하여 770 염기가 단백질 합성 과정에서 16S rRNA의 어떤 다른 부분과 결합을 하는지, 또한 그러한 결합으로 이루어지는 구조가 가지게 되는 기능은 무엇인지 등에 대한 리보솜의 구체적인 단백질 합성기작 연구에 도움이 될 것으로 기대한다. It has been shown that a nucleotide substitution at position 770 in Escherichia coli 16S rRNA, which is implicated in forming the evolutionary conserved B2c intersubunit bridge, has a detrimental effect on ribosome function. In order to isolate second-site revertants that complement ribosomes containing C770G, we performed a random mutagenesis of the 16S rRNA gene and selected clones that could produce more CAT protein translated by specialized ribosome. One of the clones contained two nucleotide substitutions at positions 569 and 904 (C569G and U904C) and these mutations partially complemented the loss of protein-synthesis ability caused by C770G. Further studies using the isolated revertant will provide information about which part of 16S rRNA is interacting with C770 and the consequence of the structure formed by these interactions in the process of protein synthesis.
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