딸기 조직배양 시 BA (benzyladenine) 처리에 따른 변이 발생 및 변이 연속성 검정

김혜진,최미자,이종남,서종택,김기덕,김율호,홍수영,김수정,손황배,남정환,Kim, Hye Jin,Choi, Mi Ja,Lee, Jong Nam,Suh, Jong Taek,Kim, Ki Deog,Kim, Yul Ho,Hong, Su Young,Kim, Su Jeong,Sohn, Hwang Bae,Nam, Jeong Hwan 한국식물생명공학회 2020 식물생명공학회지 Vol.47 No.1

본 실험은 딸기 조직배양 시 BA 처리에 따른 변이 발생 및 변이 연속성을 확인하고자 실시하였다. 본 실험에 사용된 공시 품종은 '고하'이며, 본 실험에 사용한 BA 농도는 0.0, 0.5, 1.0, 2.0 mg·L^-1로 처리하였다. 변이는 형태적, 유전적 검정을 실시하였으며, 변이 연속성 검정은 3년간 실시하였다. BA 처리 시 형태적 변이는 10.5 ~ 20.0%로 매우 높게 나타났으나, 유전적 변이는 재배 1년차에 7.0 ~ 15.0%, 재배 2년차에는 1.8 ~ 10.0%, 재배 3년차에는 5.0%로 재배연수가 길어짐에 따라 유전적 변이 발생율이 낮아졌다. 뿐만 아니라 재배1년차와 2년차에는 BA 1.0 mg·L^-1과 BA 2.0 mg·L^-1에서 유전적 변이가 발생한 반면, 재배 3년차에는 BA 2.0 mg·L^-1에서만 유전적 변이가 발생하였다. 따라서 딸기 조직배양묘의 증식을 위해서 BA는 1.0 mg·L^-1미만으로 처리하고, 반드시 변이 검정 후 보급하는 것이 바람직하다고 판단되었다. This experiment study aimed to identify the continuous genetic variation caused by benzyladenine (BA) treatment in strawberry tissue culture. The 'Goha' cultivar was used and treated with different concentrations of BA (0.0, 0.5, 1.0, 2.0 mg·L^-1). Morphological and genetic variation tests were performed, and genetic continuity tests were performed for three years. The morphological variation induced by BA was distinctively high (10.5 ~ 20.0%) and the genetic variation was 7.0 ~ 15.0%, 1.8 ~ 10.0%, and 5.0% in the first, second, and third year of cultivation, respectively. The rate of genetic variation decreased with increasing cultivation years. In addition, genetic variation caused by BA 1.0 mg·L^-1 and BA 2.0 mg·L^-1 occurred in the first and second years of cultivation, whereas only BA 2.0 mg·L^-1 caused genetic variation in the third year of cultivation. Therefore, a concentration of less than 1.0 mg·L^-1 BA was used for the propagation of strawberry tissue culture plants, and it was necessary to identify their variation.

Analysis of Microsatellite Loci for Swimming Crab Portunus trituberculatus Populations in the Korean Side of the Yellow Sea

Hye Jin Lee(이혜진),Seong Jong Yoon(윤성종),Young Se Hyun(현영세),Hye Jin Kim(김혜진),Sung-Il Hwang(황성일),Joo-Seung Bae(배주승),Ki Wha Chung(정기화) 한국생명과학회 2013 생명과학회지 Vol.23 No.9

꽃게(Portunus trituberculatus)는 세계적으로 넓게 분포하는 갑각류로 모래나 돌멩이가 있는 해저에 서식한다. 본 연구는 서해의 4개 지점(영광, 태안, 소래, 연평도)에서 채집된 P. trituberculatus 281 개체에 대해 10 종류 microsatellite 좌위의 유전적 다형성을 조사하였다. 좌위당 대립유전자 수는 50-129개로 평균 69.5개였으며, 관측 및 예상 이형접합도는 각각 0.111-1.000 및 0.609-0.979 범위에 있었다. 좌위별 근친계수((Fis)는 -0.0207에서 0.8175 범위였다. 유전적 분화도(Fst)는 0.05보다 낮게 나타났는데, 이것은 4 꽃게 간의 유전적 분화(genetic differentiation)가 매우 낮은 이루어진 것으로 추정하게 한다. UPGMA을 이용한 계통도 작성에서도 4 그룹 간의 유전적 거리는 매우 가깝다는 결과를 얻을 수 있었다. 매우 높은 다형성과 집단간의 낮은 유전적 분화는 서해안의 꽃게 집단은 활발한 유전적 흐름(gene flow)이 일어나며, 그룹간 지리적 경계가 없음을 제시한다. The swimming crab, Portunus trituberculatus, inhabits seafloor habitats containing sand or pebbles and is widely distributed throughout the world. The present study investigated genetic polymorphisms of 10 microsatellites in 281 samples of P. trituberculatus collected from four locations along the coastal water of the Korean side of the Yellow Sea (Yeonggwang, Taean, Sorea, and Yeonpyeong-do Island). The number of alleles per locus ranged from 50 to 129, with a mean of 69.5. The observed and expected hetrozygosity varied from 0.111 to 1.000 and from 0.609 to 0.979, respectively. The inbreeding coefficients (Fis) varied among the loci from -0.0207 to 0.8175. The genetic differentiation (Fst) was less than 0.05 (range 0.0020-0.0124). Therefore, the four groups of P. trituberculatus appeared to exhibit little genetic differentiation. The lack of differentiation was confirmed in a phylogenetic tree constructed by the unweighted pair group method with the arithmetic average (UPGMA). The hypervariation between the populations and the lack of genetic differentiation may reflect active gene flow among the Yellow Sea populations and the absence of geographical boundaries. The highly polymorphic microsatellite loci will be useful for molecular and phylogenetic studies, as well as stock management, of swimming crab, which is an important fishery resource.

블로그 이용자의 네트워크 구조적 특성과 관계적 행위간의 상호 작용 메커니즘에 대한 정성적 연구

김혜진(Hye Jin Kim),정승기(Seung Ki Jung),이기호(Ki Ho Lee),김진우(Jin Woo Kim) 한국HCI학회 2006 한국HCI학회 학술대회 Vol.2006 No.2

블로그를 통한 사회 연결망의 구조적 특성과 개인의 관계적 행위간의 상호 작용에 대한 정성적 연구

김혜진(Hye Jin Kim),정승기(Seung Ki Jung),이기호(Ki Ho Lee),김진우(Jin Woo Kim) 한국경영학회 2006 經營學硏究 Vol.35 No.6

딸기 조직배양 시 BA와 IBA의 혼합처리가 체세포영양계 변이 발생에 미치는 영향

김혜진(Hye Jin Kim),이종남(Jong Nam Lee),김기덕(Ki Deog Kim),임학태(Hak Tae Lim),용영록(Young Rok Yeoung) 한국원예학회 2015 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2015 No.5

딸기 조직배양묘의 생물반응기 배양 시 Polyethylene Glycol 처리에 따른 기내 생육억제 효과 및 순화율 향상

김혜진(Hye Jin Kim),이종남(Jong Nam Lee),김기덕(Ki Deog Kim),임학태(Hak Tae Lim),용영록(Young Rok Yeoung) 한국원예학회 2015 원예과학기술지 Vol.33 No.6

본 실험은 생물반응기를 이용한 딸기 조직배양묘의 대량증식 시 순화 생존율 향상을 위하여 polyethylene glycol(PEG 6000)을 농도별, 처리시기별로 실험하였고 기내생육조사는 배양 6주 후에 실시하였다. 모든 PEG처리구의 생장량은 대조구에 비해 매우 감소하였고, 농도가 높아질수록 생장억제효과가 급격히 나타났다. PEG 5g·L<SUP>-1</SUP> 처리 시 초장은 대조구의 7.9㎝보다 매우 짧아졌고, 특히 생체중은 1.60g으로 대조구보다 감소하였다. PEG 5g·L<SUP>-1</SUP>의 배양1주차에서 4주차까지의 처리시 초장이 3.0-3.9㎝ 범위로 대조구보다 매우 짧았으나, 배양5주차 처리의 초장은 5.3㎝로 큰 차이를 보이지 않았다. PEG 5g·L<SUP>-1</SUP>의 처리시기별 순화 생존율은 대조구에 비해 배양4주 처리에 5.4%, 배양5주차 처리에 8.7% 향상되었다. 따라서 생물반응기를 통해 대량증식된 딸기 조직배양묘의 순화율 향상을 위해 PEG는 5g·L<SUP>-1</SUP>의 농도로 배양 5주차에 처리하는 것이 적당하였다. This study was carried out treatment of polyethylene glycol (PEG) in order to increase of survival rate of acclimated plants of strawberry’s in vitro plantlets through bioreactor culture. We used PEG with molecular weight 6000 (PEG 6000) in this study. Concentration of PEG is non-treatment, 5, 10, 15, and 20 g·L<SUP>-1</SUP> each bioreactor. 5 g·L<SUP>-1</SUP> of PEG was treated at 1<SUP>st</SUP>, 2<SUP>nd</SUP>, 3<SUP>rd</SUP>, 4<SUP>th</SUP>, and 5<SUP>th</SUP> week during culture. We investigated growth characteristics of in vitro plantlets after 6 weeks cultivation. Growth amount of all PEG treatment decreased as compared to non-treatment. The more concentration increased, the more plant growth decreased. In 5 g·L<SUP>-1</SUP> of PEG, shoot length was shorter than non-treatment that shoot length was 7.9 ㎝ and especially fresh weight that is 1.6 g was more decrease than non-treatment. Shoot length was ranged 3.0-3.9 ㎝ at 1<SUP>st</SUP> week treatment to 4<SUP>th</SUP> week treatment of 5 g·L<SUP>-1</SUP> PEG. The shoot length was not significant by 5.3 ㎝ at 5<SUP>th</SUP> week treatment. The survival rate was improved 5.4% at the treatment of 4<SUP>th</SUP> week and was improved 8.7% at the 5<SUP>th</SUP> week as compared to non-treatment. In order to improve of survival rate of strawberry’ in vitro plantlets through bioreactor culture, the method is suitable that adding 5 g·L<SUP>-1</SUP> of PEG in the medium and 5<SUP>th</SUP> week’s treatment is suitable.

Ni 모노리스 촉매의 Ni 담지 농도에 따른 탄화수소 예비개질반응 활성 평가

김혜진(Hye Jin Kim),정운호(Unho Jung),박용하(Yongha Park),봉기완(Ki Wan Bong),구기영(Kee Young Koo) 한국에너지기후변화학회 2023 한국에너지기후변화학회 학술대회 Vol.2023 No.5

딸기 조직배양묘의 생물반응기 배양 시 Flurprimidol 처리농도에 따른 기내 생장억제 및 순화율 향상

김혜진(Hye Jin Kim),이종남(Jong Nam Lee),김기덕(Ki Deog Kim),권기범(Gi Bum Kwon),유동림(Dong Lim Yoo),임학태(Hak Tae Lim),용영록(Young Rok Yeoung) 한국원예학회 2015 원예과학기술지 Vol.33 No.4

본 실험은 생물반응기를 이용한 딸기 조직배양묘 대량증식 시 flurprimidol 을 처리하여 순화율을 향상시키고자 실시하였다. Flurprimidol 을 0, 0.1, 0.5, 1.0 및 2.0㎎·L<SUP>-1</SUP>의 농도로 6주동안 처리하여 생육조사한 결과, flurprimidol을 첨가한 처리구의 생장량이 대조에 비해 감소하였고, 처리농도가 증가할수록 생장억제효과가 크게 나타났다. 초장은 대조가 7.9㎝인 것에 비해 flurprimidol 처리는 2.2-3.7㎝ 범위로 매우 짧아졌다. 뿌리수는 대조가 51.8개/주에 비해 flurprimidol 처리가 11.6-34.2개/주 범위로 감소하였다. 뿌리길이는 대조가 4.36㎝에 비해 flurprimidol 처리는 0.88-3.08㎝ 범위로 크게 짧아졌다. 그러나 액아수는 flurprimidol 2.0㎎·L<SUP>-1</SUP> 처리를 제외하고 모든 처리구에서 대조의 8.6개/주에 비해 많이 발생하였을 뿐만 아니라 액아수가 증가할수록 그에 따라 잎수도 증가하였다. Flurprimidol 1.0㎎·L<SUP>-1</SUP> 처리 시 뿌리가 부패하여 지하부 발달이 불량하였다. Flurprimidol 1.0㎎·L<SUP>-1</SUP>와 2.0㎎·L<SUP>-1</SUP> 처리를 제외한 모든 처리의 순화율은 100%로 대조에 비해 23.3% 향상되었다. 순화 4주 후, flurprimidol 0.1㎎·L<SUP>-1</SUP> 처리는 생체중을 제외한 지상부 및 지하부 생육이 대조와 비슷하게 회복되었다. 따라서 생물반응기를 이용한 딸기의 조직배양묘 대량 증식 시 순화율 향상을 위한 적정 flurprimidol 농도는 0.1㎎·L<SUP>-1</SUP>였다 This study was conducted to improve the acclimatization rate of in vitro strawberry plantlets through bioreactor culture using the growth retardant flurprimidol. Different concentrations [0 (Control), 0.1, 0.5, 1.0, and 2.0 ㎎·L<SUP>-1</SUP>] of flurprimidol were added during bioreactor culture. After six weeks of treatments, various growth characteristics were investigated and in vitro plantlets were acclimated in the greenhouse. The growth rate of treated plantlets was much lower than that of control, and as the treatment concentration increased, the growth rate was much decreased. Shoots of plantlets treated with flurprimidol were shorter (2.2-3.7 ㎝) than those of control (7.9 ㎝). The number of roots per treated plant was around 11.6-34.2, compared with 51.8 in the control. Root length was also lower (0.88-3.08 ㎝) than control (4.36 ㎝). However, the number of new shoots and leaves increased in all treatments except for 2.0 ㎎·L<SUP>-1</SUP> concentration. The root was partially decayed in 1.0 ㎎·L<SUP>-1</SUP> concentration and was completely decayed in 2.0 ㎎·L<SUP>-1</SUP>. The survival rate in 0.1 ㎎·L-1 and 0.5 ㎎·L<SUP>-1</SUP> concentrations was 100% and 23.3% respectively. After four weeks of acclimatization, the plantlets restarted growth, and growth characteristics of shoots and roots recovered to the levels of control, except for fresh weight. Based on our results, a concentration of 0.1 ㎎·L<SUP>-1</SUP> flurprimidol is appropriate for improvement of acclimatization rate of in vitro strawberry plantlets in bioreactor culture.

A Novel PHKA1 Mutation in a Patient with Glycogen Storage Disease Type IXD

Hye Jin Kim(김혜진),Soo Hyun Nam(남수현),Sang Beom Kim(김상범),Ki Wha Chung(정기화),Byung-Ok Choi(최병옥) 한국생명과학회 2020 생명과학회지 Vol.30 No.8

원위 근병증은 원위 근육의 퇴행성 질환이며 임상적, 유전적으로 이질적인 그룹이다. 당원 축적병 9D (GSD9D)는 원위 근병증 중 하나이며, 근육의 포스포릴라아제키나아제(phosphorylase kinase) 결핍을 특징으로 하는 대사 근병증이다. GSD9D 환자는 운동 후 근육 약화, 근육 변성, 경련과 비정상적인 근육통 및 근육 경직이 발생될 수 있다. GSD9D는 글리코겐 대사의 주요 조절 효소 인 근육 포스포릴라아제키나아제의 알파 소단위를 암호화하는 PHKA1 유전자의 돌연변이로 유발된다. 이 연구에서 우리는 한국인 GSD9D 가족에 대해 PHKA1 유전자에서 c.3314T> C (p.I1105T) 돌연변이를 동정하였다. 이 돌연변이는 이전에 어떠한 돌연변이 데이터베이스에서도 보고되지 않았으며 500명의 건강한 대조군에서도 발견되지 않았다. 이 돌연변이 영역은 다양한 다른 종 내에서 잘 보존되었으며 in silico 분석에서 돌연변이가 병원성일 가능성이 있다고 예측했다. 현재까지 PHKA1 유전자에는 보고된 병원성 돌연변이가 7개뿐이며 한국에서는 보고된 사례가 없다. 따라서 이 연구는 한국 GSD9D 환자의 첫 번째 사례이다. 또한 이 연구는 이전에 보고된 환자와 한국 환자의 임상 증상과 병리 상태를 비교하고 설명하고자 하였다. 아울러 우리는 본 연구가 GSD9D의 분자 진단에 유용하게 활용될 것으로 기대한다. Distal myopathy is a clinically and genetically heterogeneous group of degenerative diseases of the distal muscle. Glycogen storage disease type IXD (GSD9D) is a metabolic distal myopathy characterized by muscle deficiency of phosphorylase kinase, a key regulatory enzyme in glycogen metabolism. Affected individuals may develop muscle weakness, degeneration, and cramps, as well as abnormal muscle pain and stiffness after exercise. It has been reported that mutations in the PHKA1 gene which encodes the alpha subunit of muscle phosphorylase kinase cause GSD9D. In this study, we examined a Korean GSD9D family with a c.3314T>C (p.I1105T) mutation in the PHKA1 gene. This mutation has not been previously reported in any mutation database nor was it found in 500 healthy controls. The mutation region is well conserved in various other species, and in silico analysis predicts that it is likely to be pathogenic. To date, only seven mutations in the PHKA1 gene have been documented, and this is the first report of Korean GSD9D patients. This study also describes and compares the clinical symptoms and pathological conditions of previously reported cases and these Korean patients. We believe that our findings will be useful for the molecular diagnosis of GSD9D.

Bioreactor를 이용한 딸기 조직배양묘 대량증식 시 Flurprimidol 처리시기에 따른 순화율 향상

김혜진(Hye Jin Kim),이종남(Jong Nam Lee),김기덕(Ki Deog Kim),유동림(Dong Lim Yoo),임학태(Hak Tae Lim),용영록(Young Rok Yeoung) 한국원예학회 2012 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2012 No.10