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        Prediction and Annotation of ABC Transporter Genes from Magnaporthe oryzae Genome Sequence

        Yongnam Kim(김용남),Jinsoo Kim(김진수),Suyoung Kim(김수영),Jeong-Hwan Kim(김정환),Jong-Hwan Lee(이종환),Woobong Choi(최우봉) 한국생명과학회 2010 생명과학회지 Vol.20 No.2

        벼의 생산에 있어 가장 큰 문제 요인 중 하나인 벼도열병의 발생 원인균인 벼도열병균은 다양한 기작에 의해 방제 약제에 대한 내성을 가지는 것으로 알려져 있다. 막 운반단백질인 ABC transporter의 경우 환경으로부터의 다양한 독성 물질들을 배출하는 것으로 알려져 있다. 이미 알려진 벼도열병균의 게놈 서열로부터 생물정보학적 분석을 통하여 ABC transporter 단백질의 도메인 특성을 보이는 33개의 유전자군 서열을 예측하였다. 이중 3개의 경우는 이미 알려진 유전자로 판명되었다. Southern Hybridization 분석에 적용한 20개의 유전자들이 모두 게놈상에 단일 copy로 존재함을 확인하였다. 새로 예측된 30개의 유전자중 11개는 RT-PCR을 통하여 전사단계에서의 유전자 발현이 확인되었다. Magnaporthe oryzae is destructive plant-pathogenic fungus and causes rice blast. The pathogen uses several mechanisms to circumvent the inhibitory actions of fungicides. ATP-binding cassette (ABC) transporters are known to provide protection against toxic compounds in the environment. PC facilitated bioinformatic analysis, particularly with respect to accessing and extracting database information and domain identification. We predicted ABC transporter genes from the M. oryzae genome sequence with computation and bioinformatics tools. A total of thirty three genes were predicted to encode ABC transporters. Three of thirty three putative genes corresponded to three known ABC transporter genes (ABC1, ABC2 and ABC3). Copy numbers of the ABC transporter genes were proven by Southern blot analysis, which revealed that twenty genes tested exist as a single copy. We amplified the DNA complementary to RNA corresponding to eleven of these by reverse transcriptase polymerase chain reaction.

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        지역민들의 공연예술 참여에 대한 이해관계자 인식 연구 -안동예술제 사례-

        김용남 ( Yongnam Kim ) 사단법인 아시아문화학술원 2021 인문사회 21 Vol.12 No.6

        본 연구는 지역민들의 공연예술 참여에 대한 이해관계자의 인식을 분석하기 위해 살펴보았다. 첫째, 지역민들의 공연 참여와 안동예술제에 관한 관심과 인식을 증대시켜 주며, 둘째, 이해관계자들은 안동예술제가 지역공동체와 개인의 정체성을 형성하며, 확인시켜 주는 것으로 인식하고 있다. 안동예술제를 통해 지역민들의 공연 참여를 확대하고 준비하고 실행하는 과정에서 이해관계들이 참여와 협력이 필요하다는 인식과 정기적으로 지역에 다양한 공연과 전시 등이 열릴 수 있도록 하는 것이 필요하다고 인식하였다. 이상과 같이 밝혀진 이해관계자의 인식이 향후 안동예술제 발전과 지역민들의 공연예술 참여가 지역의 공연예술 발전과 활용을 위한 운영 방안을 고민할 때 의미 있는 자료로 활용될 것으로 판단한다. This study was conducted to analyze the stakeholder’s perception of local residents’ participation in performing arts. First, it increases local people’s participation in performances and interest and awareness of the Andong Art Festival. Second, stakeholders perceive the Andong Art Festival as forming and confirming the identity of the local community and individual. In the process of expanding, preparing, and implementing the performances of local residents through the Andong Art Festival, it was recognized that it was necessary to ensure that various performances and exhibitions were held regularly in the region and that stakeholders were required to participate and cooperate. It is judged that the stakeholder’s perception revealed as above will be used as meaningful resource when considering the operation plan for the future development of the Andong Arts Festival and the participation of local residents in the performing arts for the development and utilization of the local performing arts.

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        농계(聾溪) 이수언(李秀彦)의 삶과 시 세계

        김용남 ( Yongnam Kim ) 한국한시학회 2015 韓國漢詩硏究 Vol.23 No.-

        이 글은 17세기 당파간의 정쟁이 가장 심했던 숙종 시대에 환국의 소용돌이를 온몸으로 겪었던 聾溪 李秀彦의 삶과 시 세계의 일단을 살펴 학계에 처음 소개하는 것이다. 이수언은 송시열의 제자로 스승과 함께 부침을 함께 하는 생을 살았다고 할 수 있다. 물론 청환직을 두루 거치며 지방관으로 명성을 얻기도 했지만, 당시 山林의 종장으로 정계의 주역이었던 우암 송시열을 적극 변론하는 과정에서 체직과 좌천, 그리고 유배를 경험해야 했다. 어찌 보면 평소 議論과 直諫을 좋아했던 강직한 성격으로 고난을 자처했다고도 할 수 있다. 이러한 그의 성향에 비해 시는 거칠거나 과격하지 않고 高雅하다. 이수언이 본격적으로 시를 배운 것 같지는 않다. 그러나 목릉문단의 최고 시인이었던 이안눌에게 시를 배운 부친 이동직의 영향과 스승 송시열, 그리고 당시 詩才로 이름이 났던 송시열의 師友와 門人들을 가까이 하며 그 또한 자연스럽게 시인의 길로 들어섰다고 할 수 있다. 이수언이 문집에 남긴 500여 수의 시 중 대부분은 5년 동안의 한시적 귀향과 5년 동안의 유배 기간에 지은 것이다. 그리하여 이 글에서는 두 시기에 지은 시를 중심으로 시 세계의 특징을 살펴보았다. 고향 淸州에서 전원생활을 할 때 지은 시는 대체로 閑居를 즐기는 가운데 詩交를 통해 詩興을 추구하는 모습을 드러내었다. 그리하여 다작의 시인은 아니나 곳곳에서 시의 흥취를 엿보기에 충분하다. 理山 유배 기간에 지은 시는 대부분의 유배시가 그러하듯 謫居의 고단함을 詩酒로 달래며 客中의 情懷를 폈다. 유배객의 고달픔과 절망, 그리고 고향에 대한 짙은 향수가 드리워져 있다. This thesis is the first introduction of the life and poetic world of Nonggye Lee, Soo­un. He lived in the age of King Sookjong in 17 century. That time is known for the most confusing political strife among political parties. Thus, he was forced to be caught in the vortex of politics. Lee, Soo­un, a disciple of Song, Si­yeol, went through the ups and downs of life with his teacher. He was assigned to important positions and got fame in society. However, while he was fully advocating Song, Si­yeol who was a learned scholar and leading figure in politics, he had to suffer from position changes, demotion, and even banishment. One of the reasons of his suffering is that he has incorruptible character and likes an argument and direct admonition. Compared to his character, his poems are surprisingly elegant, not rough or extreme. It seems that he did not learn poetry in earnest, but influenced by his father Lee, Dong­jik who had learned poetry from Lee, An­nul, a great poet of Mongneung literary world, his teacher Song, Si­yeol and other friends and writers worthy of respect, he became a poet naturally. He wrote about 500 poems. Most of them were written when he went to his hometown and lived there for five years and when he was banished for another five years. Therefore, this thesis tries to study the characteristics of his poems, focused on the poems written for the above two periods. Poems that he wrote in Cheongju, his hometown, show that he tried to enjoy a life of leisure and poetry writing by poetic exchange with others. Thus, pleasure can be easily seen in them. In contrast, poems that he wrote during the banishment in Yisan show that he tried to drown his exhaustion in poetry and drink. Thus, they are filled with weariness, despair, and nostalgia for his hometown.

      • KCI등재

        다중회귀모형을 활용한 ‘영향요인 연구’의 인과적 타당성에 대한 비판적 검토

        김용남(Yongnam Kim),이상윤(Sangyun Lee),곽나람(Naram Gwak) 한국교육평가학회 2023 교육평가연구 Vol.36 No.1

        대학입학, 학업중단과 같은 교육적으로 중요한 결과에 영향을 미치는 주요 변수들을 탐색하는 이른바 ‘영향요인 연구’는 국내 교육학 문헌에서 빈번하게 발견된다. 연구자들은 다양한 원인변수들 중에서 실제 영향력을 발휘하는 요인들을 경험적으로 확인하고, 이를 통해 효과적인 교육적 개입 프로그램을 설계하기 위한 시사점을 도출한다. 본 논문의 목적은 널리 적용되고 있는 다중회귀모형 중심의 영향요인 연구 접근을 비판적으로 검토하여, 그 인과적 논리와 타당성을 논의하는 것이다. 여러 영향요인 후보군들이 동시에 독립변수로 포함된 다중회귀모형에서 각 독립변수에 대한 회귀계수의 인과적 의미는 동일하지 않을 수 있다. 독립변수들은 상호 간에 영향을 주거나 받을 수 있고, 제3의 공통원인에 의해 영향을 받거나, 공통결과에 영향을 줄 수 있다. 관찰되지 못한 누락변수가 있는 경우, 이러한 구조적 복잡성은 영향요인 후보를 인과적으로 해석하는 데 어려움을 가중시킨다. 본 논문에서는 지금까지 영향요인 연구들에서 보고되고 후속연구들에서 반복 인용되고 있는 ‘영향요인’ 또는 ‘결정요인’의 인과적 해석에 제한이 있는 이유를 인과그래프를 활용하여 설명한다. 이러한 논의는 통계분석 방법과 최신 인과추론 이론의 결합이라는 점에서 이론적 기여가 있으며, 현행 교육학 연구방법론의 타당성과 결과 해석에 관한 논의라는 점에서 실제적인 의미도 갖는다. One of the popular approaches to educational research is to investigate multiple influencing factors on an outcome of interest. Researchers ask, “Why do students drop out of school?” or “Why did the math score decrease?,” and try to find potential factors that lead to such consequences. The findings are then used to develop an appropriate policy to intervene to facilitate a desirable outcome or to inhibit an undesirable one. This approach belongs to a type of question referred to as “causes of effects,” which is contrasted to “effects of causes.” Interestingly, many causal inference researchers believe that the former is much more difficult to answer than the latter. However, the theoretical basis for such a belief has not been well discussed in the Korean educational research field despite the popularity of the approach. Using causal graphs, this article explains why the causal interpretation of the findings from many studies on influencing factors cannot be established with certainty. In fact, multiple regression coefficients from a single equation could have different interpretations, such as one as a direct effect and the other as a confounded noncausal association. It is emphasized that with the lack of knowledge of true data-generating process, it is almost impossible to correctly interpret statistical findings in terms of causal validity. The article concludes with a discussion of the importance of causal inference for educational research.

      • KCI등재후보

        한강 「채식주의자」 속 이미지 연구 - 폭력적 이미지를 중심으로

        김용남 ( Kim Yongnam ) 단국대학교 한국문화기술연구소 2018 한국문화기술 Vol.24 No.-

        If images are powers that drive the changing reality, not their reproduction or copies, and exercise to experience sympathy, the viewpoint of this article is that studies on images must be done to be more than studies by reproduction of things or reappearance of consciousness. For this article, Chapter II examines how images appear and how characters are changed by powers of the images, Chapter III explains characters’ various characteristics with twofold characteristics of images. Through them, the study tries to explain the point that images are power that drives narratives beyond the rhetorical and symbolic levels and main exercise that changes characters’ behaviors in 「The Vegetarian」. Images in the world of 「The Vegetarian」 do not stay at reproduction (represente) of the reality or copy (摹寫). The images are strong power that derives the changing reality and sometimes, the reality itself. It is useless to discuss the reality and its reproduction in the world of this novel. If the images divide, capture, and accept the connected word through instant images, the images do not copy the world but capture slices of the world. Therefore, the images are not illusion, fakes, and copies. So to speak, the images are not the In other words, the images cannot be the entire part of the existence (Substance) but they can be part of it. This article begins from the perception that the point shown in the world of 「The Vegetarian」 is this fact. The methods that we can understand the characters whose real life is dramatically changed by fantastic and unrealistic dreams and images can be created when there is the perception that reality and dreams are not different from each other. 「The Vegetarian」 shows that the images which represent dreams and fantasy can actually drive us by the more powerful force than those of reality. The world of 「The Vegetarian」 crosses the boundary of all types of division into two parts (二分) like Yeong-hye who is between the boundary. The level of fasting (無食) beyond meat eating and vegetable diets, the level of life beyond men (Animals) and women (Plants), the level of images beyond dreams and reality, the level of violence beyond doing harm (Predation) and damage (Being preyed). Going beyond all these levels of division in two parts does not mean deception or concealment of somethings (For example, violence). This article tries to look at it differently through discussions of binarity, for example, patriarchal violence, the fixed perception of animal nature (Meat eating culture) and vegetable property, the definition of typical personality of characters, and the concept that the images are expanded by causes and effects of accidents. And this study tries to examine the system of the images shown at the level of action and reaction among the characters beyond the study on the images that stay at the material/symbolic level through it.

      • KCI등재

        완전매개 결과의 타당성과 통제변수의 활용 : 국내 교육학 분야를 중심으로

        김용남(Yongnam Kim),양혜원(Hye-Won Yang) 한국교육평가학회 2021 교육평가연구 Vol.34 No.4

        완전매개는 주어진 매개변수를 거치지 않고서는 원인변수가 결과변수에 직접적으로 영향을 미칠 수 없는 특수한 구조적 상황을 가리킨다. 본 연구에서 지난 이십년 간 국내 교육학 분야 학술지에 출판된 연구물을 검토한 결과, 전체 901건의 매개분석 적용 논문 중 약 20%에서 완전매개를 보고하고 있었다. 원인-결과 간의 작동기제를 완벽하게 설명했다는 완전매개의 실질적 의미를 감안할 때, 이러한 비율의 타당성에 관한 합리적인 의문이 있다. 본 연구에서는 국내 매개분석 적용 연구에서 확인되는 통제변수의 소극적 활용이 거짓 완전매개 보고로 이어질 수 있다는 이론적 설명을 시도한다. 특히 본 연구는 인과그래프 혹은 인과구조모형 접근을 적용하여, 매개분석에서 교란효과의 통제실패가 초래하는 문제점에 대해 보다 직관적인 설명을 제공한다. 구체적으로 교란효과로 인한 편향의 증폭과 상쇄 현상이 소개된다. 이러한 주장에 대한 시뮬레이션 증거를 제공하고, 통제변수를 고려하지 않은 완전매개 결과의 타당성에 대해 논의한다. Full or complete mediation is a phenomenon embedded in a specific causal structure where a putative cause directly affects a putative outcome. Investigating research papers using mediation analysis in Korean educational research journals published in the last twenty years, this article found that about 20% of them reported the full mediation results. Considering the substantive interpretation of full mediation and our current research practice, this high rate of the full mediation report is somewhat questionable. This article argues that the failure of controlling for confounding in mediation analysis can result in a false full mediation result. A more intuitive explanation of the reason is provided using the causal graphical models approach. In particular, two phenomena of bias-amplification and bias-offsetting are theoretically explained and corresponding simulation evidence is provided. The article concludes with a discussion of the validity of the full mediation reports when the no confounding assumption is violated in mediation analysis.

      • KCI등재

        지역 문화자원으로서 불놀이의 의미와 지역민의 인식 연구

        김용남(Yongnam Kim) 한국문화융합학회 2023 문화와 융합 Vol.45 No.12

        본 연구의 목적은 하회선유줄불놀이가 지역 문화자원으로서 지역민들에게 어떻게 인식되고 있는지 살펴보는 데 있다. 연구방법은 하회선유줄불놀이의 관람 경험이 있는 지역민을 대상으로 질적 연구방법을사용하였다. 연구결과 문화를 향유 하는 계층도 다양해지고 있음을 알 수 있었다. 둘째, 역사를 바탕으로 형성된 놀이가 전통문화라는 관심으로 연결될 수 있었다. 셋째, 지역과 공동체의 가치를 복원하고지역민이 공감할 수 있는 장을 만들어 낼 수 있다. 넷째, 기억을 품었던 공간의 형태가 유지되고 그곳에서 역사의 기억으로 문화의 지역성이 만들어지는 것으로 나타났다. 마지막으로 지속적인 활용으로 지역민과 조화를 이루는 환경조성과 지역 정체성의 자원으로 활용될 수 있음을 알 수 있었다. 본 연구결과를 바탕으로 향후, 지속가능성이라는 측면에서 지역 문화자원을 보존하고 활용하는 선순환 모델을 연구할 수 있기를 기대한다. The purpose of this study is to examine how Seonyujulbul-nori in Hahoe village is perceived by local residents as a local cultural resource. The research method used was a qualitative research method targeting local residents who had experience watching the Seonyujulbul-nori in Hahoe village. As a result of the study, it was found that the classes that enjoy culture are also becoming more diverse. Second, the play formed based on history could be connected to the interest in traditional culture. Third, it can restore the values of the region and community and create a place where local residents can empathize. Fourth, it was found that the form of the space that contained the memory was maintained and that the locality of culture was created there through the memory of history. Lastly, it was found that through continuous use, it can be used as a resource for creating an environment in harmony with local residents and for local identity. Based on the results of this study, we hope to be able to study a virtuous cycle model that preserves and utilizes local cultural resources from the perspective of sustainability in the future.

      • KCI등재

        장소기억 기반 유휴공간 재생방안 연구 -구(舊) 안동역 사례를 중심으로-

        김용남 ( Yongnam Kim ) 사단법인 아시아문화학술원 2021 인문사회 21 Vol.12 No.1

        본 연구는 안동 원도심에 위치하였던 구(舊) 안동역을 장소기억의 특성을 바탕으로 유휴공간 재생방안 마련을 위한 이론적 기초를 제시하는 데 목적이 있다. 이를 위해 유휴공간의 발생원인과 유형을 살펴보았으며, 장소기억으로서의 유휴공간 재생방안 분석틀을 활용하였다. 연구결과 유휴공간 재생이 새로운 지역공동체의 문화공간으로 의미가 있다. 물리적 공간과 형태는 역사와 문화를 보존하려는 노력이 있으며, 지역민들은 기억 보존의 가치가 있다. 또한, 지역민들과 함께 경험과 관계로부터 형성되는 다양한 콘텐츠를 통해 공유 가치가 생기며, 다수의 지역민이 참여하여 공유할 수 있는 열린 공간으로 장소성이 있다. 유휴공간인 구 안동역이 지역민들과 함께 하는 실존의 장소로 의미를 가지며 재생되길 기대하며, 향후 이 연구를 토대로 한 실증연구를 기대한다. The purpose of this study is to present the theoretical basis for preparing a plan for regenerating idle spaces based on the characteristics of the former Andong Station located in the original city of Andong. To this end, this study investigated the causes and types of idle spaces happening, and utilized the analysis framework for regeneration plan of idle spaces as a place memory. As a result of the study, the regeneration of idle spaces is meaningful as a cultural space of a new local community. Physical spaces and forms have an effort to preserve history and culture, and local residents deserve memory preservation. In addition, shared values are created through various contents formed from experiences and relationships with local residents, and there is a place nature as an open space where many local residents can participate and share. The old Andong Station, This study expects the old Andong Station, an idle space, to be regenerated with meaning as a place of existence with local residents, and We look forward to empirical research based on this research.

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