RISS 학술연구정보서비스

검색
다국어 입력

http://chineseinput.net/에서 pinyin(병음)방식으로 중국어를 변환할 수 있습니다.

변환된 중국어를 복사하여 사용하시면 됩니다.

예시)
  • 中文 을 입력하시려면 zhongwen을 입력하시고 space를누르시면됩니다.
  • 北京 을 입력하시려면 beijing을 입력하시고 space를 누르시면 됩니다.
닫기
    인기검색어 순위 펼치기

    RISS 인기검색어

      검색결과 좁혀 보기

      선택해제
      • 좁혀본 항목 보기순서

        • 원문유무
        • 음성지원유무
        • 원문제공처
          펼치기
        • 등재정보
          펼치기
        • 학술지명
          펼치기
        • 주제분류
          펼치기
        • 발행연도
          펼치기
        • 작성언어
        • 저자
          펼치기

      오늘 본 자료

      • 오늘 본 자료가 없습니다.
      더보기
      • 무료
      • 기관 내 무료
      • 유료
      • KCI등재

        혈관질환 정보관리 시스템

        김동익,김덕경,허세호,이병붕,김용신,김은숙,문지영,도영수,신성욱,김동수,김만태,진재욱,김용신 대한혈관외과학회 2002 Vascular Specialist International Vol.18 No.1

        As medical technology progresses rapidly, there is a rise in the average age along with the Korean dietary lifestyle becoming more westernized, which leads to an increase in the number of vascular disease patients in Korea. Thus, we need to manage the medical information of a disease systematically in order to diagnose and treat constructively. However, since there has been no standardized method of man agement to date, a great deal of information could not be properly utilized nor studied. Therefore, the departments of Cardiology, Radiology and Neurology of Samsung Seoul Hospital recently got together to develop an information management system called the Vascular Data System. This program was developed to be run on win98 O/S, upper Pentium Ⅲ, and upper 128 MB Memory, and its source code is Dephi 4.0. It was configured for the user to set the configurations as well as do a variety of search and analysis. If this program were to be updated continuously, it may be used extensively as well as in various parts of clinical research activities.

      • KCI등재후보

        2003년 국내 중증급성호흡기증후군 진료 현황 및 문제점 분석

        이진수,김은실,정문현,백제중,정선화,안주희,최영화,이선희,고철우,김성범,김민자,박승철,기현균,송재훈,최상호,김양수,이상오,조용균,박영훈,정숙인,김연숙,이흥범,손창희,장성희,정희진,김우주 대한감염학회 2004 감염과 화학요법 Vol.36 No.3

        목적 : 2002년 말 중국에서 SARS가 발생한 이후 국내에서도 2003년 10월까지 총 3명의 추정환자, 17명의 의심환자가 보고되었다. 향후 추가적인 SARS의 유행이 우려되는 상황에서, 그간의 SARS 환자 진료에 있어서의 실질적인 준비사항, 진료 현황 등에 대한 조사를 통해 문제점을 파악하여, 향후 더 나은 대비가 될 수 있도록 개선점을 제시하고자 하였다. 재료 및 방법 : SARS로 의심되는 환자를 진료 경험이 있는 병원의료진을 대상으로 2003년 10월에 설문조사를 실시하였다. 설문에는 SARS 환자 진료 시의 실질적인 조치, 진료 현황, 병실, 응급실 및 외래에서의 격리 시설과 준비사항, 보건당국의 관리와 지원에 관한 사항을 포함하였다. 결과 : 대상이 되는 22개 병원 중 17개(17/22, 77.2%) 병원이 설문에 응하였다. SARS 환자를 위한 격리실은 응급실, 외래, 일반병실 및 중환자실에서 각각 9개(9/17, 52.9%), 5개(5/17, 29.4%), 15개(15/16, 93.7%), 4개(4/16, 25%) 병원에서 음압처리가 되어있지 않은 일인실 혹은 다인실이 사용되었고, 1개(1/16, 6.3%) 병원에서만 일반병실에서 음압격리실이 운영되었다. 입원환자의 진찰 시 개인보호구의 착용은 거의 모든 의료기관에서 이루어졌다. 보건당국에서 SARS지정병원의 시설 등을 사전에 확인한 곳은 1곳(1/12, 8.3%)이였고, 14개 병원(14/15, 93.3%)에서는 보건당국에 의뢰한 검사결과를 통하 받지 못하였다. 결론 : 의료기관에서 SARS 환자용 격리실뿐만 아니라 기존의 격리실 설비 등이 미흡하였으며, 특히 중환자실 및 외래의 준비가 더욱 부족하였다. 보건당국의 의료기관에 대한 종합적인 지원이 부족하였고, 병원과의 원활한 연계가 잘 이루어지지 않았다. SARS 만이 아닌 격리를 필요로 하는 질환의 적절한 진료를 위해 향후 병원 시설의 정비와 정부차원에서의 보다 구체적이고 실질적인 대책마련이 필요하다. Background : There was an worldwide outbreak of the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) originated from China in late 2002. During that period three cases of suspected SARS and 17 cases of probable SARS were reported in Korea. With the concerns about the reemergence of SARS-coV transmission, it is important to be prepared for any possibility. So, this study is aimed to analysis the past measures in managing SARS and propose the amendatory plans to improve the preparedness. Materials & Methods : Questionnaires were collected among clinicians with any experience in managing the probable or suspected SARS cases in Oct. 2003. 17 out of 22 hospitals responded to the questionnaire. The contents in the questionnaire were practical activities, personal equipments, response plans, isolation facilities in emergency centers, outpatient clinics, general wards and intensive care units, and relationship with the public health department. Results : The dedicated isolation rooms in emergency centers, outpatient clinics, general wards, and intensive care units were prepared in 9 (9/17, 52.9%), 5 (5/17, 29.4%), 15 (15/16, 93.7%), and 4 (4/16, 25.0%) hospitals, respectively. Except for one hospital that newly made negative pressure room for SARS, single or multi-bed rooms without airborne infection control were used in all the other hospitals. The personal precaution principles were kept quite well in general wards. Before the designation of SARS hospital by the public health department prior evalution to see if the hospital was suitable for managing SARS was conducted in only 1 (1/12, 8.3%) hospital. The results of laboratory diagnosis were reported back in 1 (1/15, 6.6%) hospital. Conclusions : The isolation facilities which can control airborne infection were almost deficient not only for SARS but also for other respiratory transmissible diseases. For the infection control of transmissible diseases including SARS, more investment is needed on medical facilities and comprehensive support from the public health department required.

      • KCI등재후보

        대동맥 판막 치환술 후 반복되는 Acinetobacter baumannii 균혈증의 원인이 된 대동맥염 1예

        정용필,김성철,송은희,장은영,김은경,김윤지,성흥섭,김미나,최상호,우준희,김양수 대한감염학회 2007 감염과 화학요법 Vol.39 No.3

        감염성 대동맥염은 흔하지 않지만 매우 위중한 질병으로 Salmonella so.와 S. aureus가 주된 원인균이다. 아직까지 병원내 감염의 주요 원인균인 Acinetobacter baumannii에 의한 감염성 대동맥염은 보고된 바가 없었다. 저자들은 대동맥 판막 치환술을 시행받은 76세 남자 환자에서 적절한 항생제 투여에도 반복되는 A. baumannii 균혈증의 원인이 감염성 대동맥염으로 진단되었던 1예를 경험하였기에 보고하는 바이다. Infectious aortitis is an uncommon yet, life threatening disease. Early surgical treatment and prolonged antibiotic therapy is crucial to survival. Salmonella sp. and Staphylococcus aureus are the most common organisms isolated. There is no case report of infectious aortitis caused by Acinetobacter baumannii, which has recently emerged as a major cause of health care-associated infections. Here, we describe a 76-year-old male with infectious aortitis who experienced recurrent bacteremia due to A. baumannii in spite of adequate antimicrobial therapy after aortic valve replacement.

      • KCI등재후보

        내관지압이 슬관절 전치환술 받은 노인 환자의 오심, 구토 및 통증에 미치는 효과

        유제복 ( Je Bog Yoo ),장희정 ( Hee Jung Jang ),나은희 ( Eun Hee Na ),김선영 ( Sun Young Kim ),신동수 ( Dong Soo Shin ) 경희대학교 동서의학연구소 2011 동서간호학연구지 Vol.17 No.2

        지압은 수직압, 지속압, 조화압으로 경혈을 찾은 다음 치료하는 사람의 체중을 실어서 위에서 아래로 누르는 방법으로 어깨에 불필요한 힘을 뺀 상태에서 자연스럽게 상체의 체중을 손가락에 집중을 시켜 수직으로 경혈을 보통 3-4초 정도 지속적으로 눌러 주는것을 말한다(East-west nursing research institute, 2000; Kim, 1999). 내관지압의 오심· 구토 경감 효과를 검증한 연구를 살펴보면, Alsaid 등(1997)이 수술 후 오심· 구토 감소에 효과가 있다고 보고하였고, Ming 등(2002)은 기능적 내시경 부비동 수술에 지압이 효과가 있다고 하였으며, Apfel 등(1999)은 항암화학요법을 받는 유방암 환자에게 지압이 오심과 구토에 유의한 차이가 있다고 보고하였다. Kim. 2003). Kim (2003)의 연구결과 내관지압이 항암화학요법을 받는 폐암 환자의 오심· 구토에 미치는 영향을 연구한 결과, 실험군에서 제2일과 3일에 오심 정도를 감소시키는 효과를 검증한 바 있다. 수술 환자의 자가 통증 조절기 사용은 최근 널리 적용되고 있는 통증완화를 위한 방법으로 자가 통증 조절기는 통증 완화를 위한 치료 효과는 높지만 오심· 구토는 대부분의 수술 후 자가 통증 조절기를 사용하는 환자들이 경험하는 심각한 불편감으로, 자가 통증조절기(PCA) 사용을 중단하게 되는 원인이 되기도 한다(Lee, 2006). 수술 후 오심, 구토는 통증보다 더욱 힘든 것으로 보고되고 있어, 이를 경감시켜 주기 위한 다양한 간호중재 전략의 개발이 요구된다Song & Shin, 1988). 본 연구는 슬관절 수술 환자의 자가 통증 조절기 사용 후 오심· 구토의 완화를 위해 내관지압을 적용하여 그 효과를 검증함으로써 비 침습적이고 독자적인 간호중재로서 발전시키기 위해 시도되었다. 본 연구 결과에서 내관지압 제공 후 24시간에 구토영역과 오심·구토 전체 영역에서 유의한 차이가 있었는데, 이는 Lee (2008)의 중이수술 대상자에게 손목밴드 내관지압을 적용한 결과 마취 종료후 24시간에 오심· 구토의 전체영역에서 유의한 차이가 나타났다는 결과와 일치하였다. 그러나 본 연구에서는 오심 영역은 유의미한 차이를 나타내지 못하여 Kim (2003)의 연구에서 항암화학요법주기 제2일 오심불편감이 실험군과 대조군 간에 통계적으로 유의한 차이를 보였다는 결과와 일치하지 않는 결과를 나타내었다. 이는 대상자의 차이에 의한 것으로 수술 환자와 항암요법대상자의 차이에서 비롯된 것으로 본다. Shin (2002)의 연구에서는 지압교육실험군에서 항암화학요법제투여 2일, 3일, 4일, 5일째 오심· 구토 정도가 유의미하게 감소하였다. 본 연구에서는 내관지압 제공 후 12시간에서 유의미하게 구토영역에서 감소를 나타내기 시작하였다. 이는 대상자가 다르기 때문으로 판단되며 항암요법을 실시하고 있는 대상자보다 고관절치환술 후자가통증조절기를 보유하고 있는 대상자의 오심· 구토 정도가 상대적으로 항암 환자보다 낮은 정도이기 때문으로 본다. Lee (2002)의 연구결과 오심 정도는 제3일째는 유의미한 차이가 있었으나 구토정 도에서는 유의미한 차이를 나타내지 않았다. 본 연구결과와는 차이를 나타내었다. 역시 항암요법을 받는 난소암 환자가 대상자이기 때문에 대상자의 차이로 인한 결과라고 본다. 따라서 앞으로 연구 시에는 동일대상자에 대한 반복연구가 필요함을 시사할 뿐 아니라 최초 효과발현 시기에 대해 다양한 대상자별 반복연구가 필요함을 알 수 있었다. 본 연구의 결과에서 내관지압 제공 후 24시간 시점에서 두 군 간의 오심· 구토 전체 점수는 유의미하게 낮았고 특히 구토 횟수, 구토불편감, 구토 양은 통계적으로 낮아 유의한 차이가 있었다. 그러나 Lee (2008)의 연구에서는 마취종료 후 24시간에 오심· 구토 전체 점수에서 유의미하게 차이가 났다는 결과와는 일치하였으나 세부 하위영역에서 유의미한 영역은 차이가 있다. 즉, Lee (2008)는 특히 오심에서 유의미한 차이를 나타내어 본 연구결과와 일치하지는 않았다. 이는 대상자의 수술의 심각성 정도에 따라 차이를 나타낸 것으로 보인다. Shin (2002)의 연구에서 항암화학요법을 받은 위암 환자에게 내관지압이 하위영역 구토 횟수 감소에 유의한 효과를 나타냈다는 결과와는 일치하였으며 Kim 등(2007)의 연구와도 일치하였다. 이는 지압 제공 후 12시간보다는 24시간에 효과가 큰 것은 시간이 지남에 따라 지압의 효과가 축적되어 나타나는 것이라 본다. Kwon(2011)의 결과 갑상선절제술 환자에게 손목밴드를 이용한 내관지압을 적용하였을 때 시간이 경과함에 따라 오심· 구토 점수가 감소하였다는 결과가 있었고 Kim 등(2010)의 결과에서는 시간에 따라 오심감소가 유의미하게 있었으므로 앞으로도 시간이 경과함에 따라오심· 구토의 감소효과를 계속해서 연구할 필요가 있다. Aidah 등(2002)의 연구결과 24-48시간에 구토의 부작용이 가장 심하게 나타난다는 연구결과가 있었는데 이때 지압을 통해 구토영역이 유의미하게 낮은 점수를 나타낸 것은 대조군은 구토의 부작용이 지속되지만 실험군은 지압의 효과로 구토의 부작용을 최소화하였기 때문이라 볼 수 있다. 그래서 본 연구의 실험군에서도 24시간에 가장 구토영역의 유의미하게 낮은 점수를 나타낸 것으로 본다. 본 연구결과는 24시간 시점에서 집중적으로 오심· 구토를 중재할 수 있는 간호 중재의 요구도가 있다는 것을 나타내는 증거라고 본다. 그러므로 앞으로는 내관(P6)지압을 24시간 이후 48시간에도 계속 적용한 후 오심· 구토 정도를 확인하는 반복 연구가 필요하다. 내관지압의 통증감소효과에 대한 가설을 세웠으나 본 연구결과 통증에는 효과가 나타나지 않았음을 보였다. 지압이 통증 감소에 영향을 미친다는 연구결과와 일치하지 않는 것을 보였다. Ju (2010)의 연구결과 경혈지압마사지가 요통 환자의 통증감소에 효과적이었다고 보고하였으나 이는 8주간의 장시간을 두고 효과를 검증한 것이었다. Shin (2004)은 자궁 적출술 환자의 통증 자가조절교육과 함께 내관지압을 실시한 실험군에서 통증감소효과가 있었다고 보고한 것과도 일치하지 않는 결과를 나타내었다. 이는 본 연구에서 이미 대상자 스스로 통증치료를 위해 PCEA를 사용하고 있으므로 통증에 대해서는 스스로 조절을 하는 부분이 더 영향을 미쳤을 것으로 본다. 그러나 앞으로의 연구에서는 PCEA를 착용하고 있으므로 이를 통한 통증약물 사용량을 함께 측정함으로써 통증 정도를 좀 더 정확하고 광범위하게 측정하여 통증 정도의 효과를 검증하는 것이 필요하다고 본다. 이상에서 논의한 바와 같이 본 연구는 수술 후 자가 통증 조절기사용 환자의 오심 및 구토, 통증 완화에 지압을 이용한 간호중재가 부분적으로 오심· 구토 감소에 효과를 나타낸다는 것을 검증하였으므로 임상에서 내관(P6)지압을 간호중재의 하나로서 적극 활용할 것을 제안한다. Purpose: Patient-controlled epidural analgesia (PCEA) is an effective method for controlling post surgical pain. However, it is associated with adverse drug reactions such as nausea and vomiting. In this, study we tested the effects of Nei-Guan (P6) acupressure on PCEA-associated nausea, vomiting, and pain in geriatric patients after total knee replacement arthroplasty (TKRA). Methods: Ninety-nine patients who had TKRA for the first time were randomly assigned to either, experiment group (n=50) or control groups (n=49). All patients received PCEA immediately after surgery, but acupressure on Nei-Guan (P6) point was applied to experiment group only. Ten minutes of finger acupressure on Nei-Guan (P6) acupressure point was applied twice with 15 minute-interval in the experiment group. The incidence of nausea, vomiting, and retching as well as pain intensity were assessed at 12 and 24 hours after surgery. Nausea, and vomiting were assessed by Index of Nausea, Vomiting and Retching (INVR) questionnaire. Pain intensity was measured with frequency of analgesics. Results: Vomiting both was significantly different between two groups at 12 hours (t=-2.18, p=0.03) and 24 hours (t=-2.64, p=0.01) after surgery. Total scores of nausea, vomiting and retching in experimental group was significantly lower than control group 24hours after surgery (t=- 2.18, p=0.03). However, pain was not different between two groups. Conclusion: Nei-Guan (P6) acupressure may be considered as an effective nursing intervention to decrease PCEA-associated nausea and vomiting in older patients after TKRA.

      • SCOPUSSCIEKCI등재
      • KCI등재

        Caffeine이 지구성 운동 수행능력에 미치는 영향과 억제성 아미노산에 의하여 활성화되는 이온통로의 조절작용

        김은경,김영표,천병옥,이계영,김연정,임백빈,조영욱,김창주,김성수 대한스포츠의학회 1999 대한스포츠의학회지 Vol.17 No.1

        To investigate the effect and mechanism of caffeine on endurance exercise, two experiments were performed. First, to test caffeine effect on aerobic exercise, 200-300g Sprague-Dawley rats were used and three groups, control group, low caffeine injection group and high caffeine injection group, were divided. Blood smpling by heart puncture were done at rest, after 30 min treadmill exercise, and after maximal exercise. Blood glucose, free fatty acid concentration were detected and following results were obtained. Glucose concentration showed significant difference between groups(p=0.0305) and also significant changes were exhibited between time(p=0.0004). Free fatty acid concentration had no difference between groups. but had significance between times(p=0.00065). Exercise endurance performance time showed significant difference(p=0.02350 in high caffeine injection group compared to control group. In this experiments, endurance exercise capacity was increased by caffeine injection. Therefore, second experiment was performed to investigate the effect of caffeine on ion current induced inhibitory amino acid neurotransmitter. GABA and glycine. Single periaqueductal gray neuron was acutely dissociated and nystatin perforated patch clamp was performed under voltage clamping condition. Caffeine evoked outward current in PAG neuron dose dependent manner. 1mM of caffeine application had no response. but 3mM caffeine evoked about 32.5±8.539pA outward ion current and 10mM caffeine evoked about 215.46±19.4pA outward current. 10^-2mM GABA activated Cl ̄current and recorded by inward current. Caffeine inhibited GABA activated Cl ̄ current concentration dependent manner. 10^-2mM of caffeine had no effect on 1-^-2mM of GABA response. but 10^-1mM caffeine inhibited GABA activated Cl ̄ current about 5.74±2.13%, 1mM caffeine inhibited about 17.25±2.70%, 10mM caffeine inhibited GABA response about 45.31±7.71%. 10^-1mM of glycine activated Cl ̄ current and also recorded by inward current. Caffeine inhibited glycine activated Cl ̄ current concentration dependent manner. 10^-2mM caffeine decreased glycine activated Cl ̄ current about 4.61±1.650%, 10^-1mM caffeine decreased about 6.49±2.24%, 1mM caffeine decreased about 26.82±4.27%, and 10mM caffeine decreased glycine response about 94.47±1.39%. These results suggest that caffeine inhibite inhibitory amino acid, GABA and glycine, this response causes excitation of CNS and this seems to be the basic mechanism of increasing effect to aerobic exercise performance by caffeine.

      • 요한복음 12:1~8의 향유부음의 의미

        김은수 베뢰아학회 2007 베뢰아논단 Vol.1 No.4

        KIM, Eun Soo. "The Meaning of Perfume Pouring in John 12:1~8." Berea Forum 1 (2007): 390~410. Mary's perfume pouring on Jesus in the Book of John is a beautiful and marvelous incident beyond description. Although all four Gospels mention it (Mt 26:1~13; Mk 14:3~9; Lk 7:36~50; Jn 12:1~8), the particular content and construction in John differ from Luke's description of an utterly sinful woman's love (Lk 7:47) or from Mark's portrayal of the King's anointing (Mk 14:3). As a result, the finest in spirituality and literature can be said to be achieved in this text. John demonstrates that the pouring of the perfume over Jesus' head resulted from the long cherished desire for love and remission, and also that for Jesus, it is his consecration as the eternal high priest who through self-sacrifice carries the sin of humankind. For this purpose, John perfects the Old Testament motive by metaphorically describing the temple's cleansing, burning incense and covenant in 12:1-8. At the same time, the incident of perfume pouring induces the reader to think over the meaning of Jesus' burial as the text suggests that Jesus' death is not irrelevant to the Passover. Jesus, by performing many miraculous signs as the Son of God, and stopping over Bethany to raise Lazarus from the dead, and being anointed as the high priest, the Christ, shows that his sufferings were for the sake of his eternal sacrifice, and that they constitute salvation that would lead, not only Lazarus but also all those who believe in him, to resurrection. The text finely states the intention of the Book of John, namely to make believe that Jesus is the Son of God and the Christ, and that by believing in him one may have eternal life.

      • 사용종료매립지 환경현황 및 사후관리대책

        김은호,박진식,김정권,안종수,성낙창,김수생,박출재 동아대학교 환경문제연구소 1996 硏究報告 Vol.19 No.1

        In this study, we can be obtained the following conclusions about the present environmental conditons and the post management of the expired landfill. 1. The component ration in paper, vinyl·plastic and leather·rubber of combustible amounts to much more than others. In the future, decompositions will be delayed considerably, due to these. 2. Except heavy metals in leachate, each of analysis value change considerably, but are equal to the component of general leachate. 3. The soils of lower part in landfill do not differ greatly from surrouding soils. soil pollutions with heavy metals in general domestic waste proved to be concerned greatly. 4. All of landfill facilites are poor in enviromental, and the post management is rearly controlled, so the proper countmeasure preparation is urgent.

      • Rifampicin에 의한 것으로 추정되는 위막성 대장염1예

        김수현,이은우,정종혁,문승현,김동한,양혁승,오영상,김호동,김도현,박혁,박정환,박경옥,이영직 朝鮮大學校 附設 醫學硏究所 2006 The Medical Journal of Chosun University Vol.31 No.2

        Pseudomembranous colitis, caused by altering the normal colonic flora and allowing the multiplication of Clostridium difficile, is an deleterious adverse effect of antibiotics. But it is rarely reported by rifampicin. Rifampicin is one of the first line drug in the treatment of tuberculosis and many patients are exposed to its potential adverse effects. We experienced a patient that had abdominal discomfort and hematochezia due to pseudomembranous colitis after receiving antituberculous medication, and which was probably caused by rifampicin. A 82 years old man was admitted with abdominal discomfort and hematochezia for one week. On the past history he had been diagnosed as endobronchial tuberculosis about 4 months ago. Colonoscopy revealed multiple discrete whitish mucosal lesion on rectosigmoid colon, and histologic findings were consistent with pseudomembranous colitis. The antituberculous agents were discontinued and vancomycin was administered. The patient's symptoms were resolved within several days. There was no recurrence after reinstitution of the antituberculous agents excluding rifampicin. We report here on a case of pseudomembranous colitis probably due to rifampicin.

      • KCI등재

        Comprehensive genomic analyses with 115 plastomes from algae to seed plants: structure, gene contents, GC contents, and introns

        Eun‑Chae Kwon,Jong‑Hwa Kim,Nam‑Soo Kim 한국유전학회 2020 Genes & Genomics Vol.42 No.5

        Background Chloroplasts are a common character in plants. The chloroplasts in each plant lineage have shaped their own genomes, plastomes, by structural changes and transferring many genes to nuclear genomes during plant evolution. Some plastid genes have introns that are mostly group II introns. Objective This study aimed to get genomic and evolutionary insights on the plastomes from green algae to flowering plants. Methods Plastomes of 115 species from green algae, bryophytes, pteridophytes (spore bearing vascular plants), gymnosperms, and angiosperms were mined from NCBI organelle genome database. Plastome structure, gene contents and GC contents were analyzed by the in-house developed Phyton code. Intronic features including presence/absence, length, intron phases were analyzed by manually in the annotated information in NCBI. Results The canonical quadripartite structures were retained in most plastomes except of a few plastomes that had lost an invert repeat (IR). Expansion or reduction or deletion of IRs resulted in the length variation of the plastomes. The number of protein coding genes ranged from 40 to 92 with an average 79.43 ± 5.84 per plastome and gene losses were apparent in specific lineages. The number of trn genes ranged from 13 to 33 with an average 21.19 ± 2.42 per plastome. Ribosomal RNA genes, rrn, were located in the IRs so that they were present in a duplicate except of the species that had lost one of the IR. GC contents were variable from 24.9 to 51.0% with an average 38.21 ± 3.27%, indicating bias to high AT contents. Plastid introns were present in 18 protein coding genes, six trn genes, and one rrn gene. Intron losses occurred among the orthologous genes in different plant lineages. The plastid introns were long compared with the nuclear introns, which might be related with the spliceosome nuclear introns and self-splicing group II plastid introns. The trnK-UUU intron contained the maturase encoding matK gene except in the chlorophyte algae and monilophyte ferns in which the trnK-UUU was lost, but matK retained. There were many annotation artefacts in the intron positions in the NCBI database. In the analysis of intron phases, phase 0 introns were more frequent than those of phase 2 and 3 introns. Phase polymorphism was observed in the introns of clpP which was derived from nucleotide insertion. Plastid trn introns were long compared to the archaeal or eukaryotic nuclear tRNA introns. Of the six plastid trn introns, one was at the D loop and other five were at the anticodon loop. The insertion sites were conserved among the trn genes in archaea, eukaryotic nuclear and plastid tRNA genes. Conclusions Current study refurbrished the previous findings of structural variations, gene contents, and GC contents of the chloroplast genomes from green algae to flowering plants. The study also included some noble findings and discussions on the plastome introns including their length variations and phase variation. We also presented and corrected some false annotations on the introns in protein coding and tRNA genes in the genome database, which might be confirmed by the chloroplast transcriptome analysis in the future.

      연관 검색어 추천

      이 검색어로 많이 본 자료

      활용도 높은 자료

      해외이동버튼