배추 유전체열구의 현황과 전망

최수련,박지영,박범석,김호일,임용표,Choi, Su-Ryun,Park, Jee-Yong,Park, Beom-Seok,Kim, Ho-Il,Lim, Yong-Pyo 한국식물생명공학회 2006 식물생명공학회지 Vol.33 No.3

유전체 연구란 목적하는 유전체의 구조를 밝히고 가지고 있는 모든 유전자의 기능 및 진화과정을 망라하여 이해하고자 하는 것이다. 계통발생학상 애기장대와 연관되어 있는 Brassica rapa는 채소, 유지 및 사료로 이용되는 중요한 작물의 하나이다. Brassica rapa의 유전체 연구를 착수하는 데는 적합한 유전학적 재료 및 유전체 재료가 있어야 한다. 우리는 배추 (Brassica rapa spp. pekinensis)를 재료로 하여 표준 mapping 집단을 개발하여, 78계통으로 구성된 DH집단과 약 250 계통으로 구성된 RI집단을 개발하였다. 2가지 제한효소 (HintIII, BamHI)를 이용해 세균인공염색체 (BAC) library (KBrH, KBrB)를 만들었고, 이들은 각각 56,592개와 50,688개의 클론으로 구성되어 있다. 또한 배추의 각기 다른 부위를 이용하여 만든 22가지의 cDNA library를 이용하여 평균 575bp의 길이를 가지는 104,914개의 EST 분석을 실시 하였다. 세계적으로 'Multinational Brassica Genome Project (MBGP)' 조직이 구성되었고 배추의 전 염기서열 분석을 하기로 2003년 결정되었다. 그 첫 단계로 104,914개의 BAC 클론의 BAC-end 염기서열분석이 제안되어 2006년 9월 5개국 공동 프로젝트로 추진하여 완성하게 되었다. 이러한 BAC-end 염기서열분석의 결과는 유전자의 염기서열 해석, 및 풍부하게 존재하는 반복염기서열 DNA를 분석함으로써 배추의 유전체 구조를 이해할 수 있는 실마리를 주었다. BAC 클론의 전체 염기서열분석은, 비록 단편 내에 유전자의 결실이 변화무쌍하게 일어나지만 배추 DNA 단편이 유전체에서 광범위하게 삼중복으로 존재함을 나타냈다. 이러한 BAC-end 염기서열을 아기장대 염기서열에 비교하여 629개의 종자 BAC을 선정하게 되었고, 이들의 염기서열 분석을 완성하였다. MBGP에서는2단계로서 배추의 전 유전체 염기서열 분석을 추진하게 되었고, 유전자지도에 위치한 종자 BAC을 이용하여 인접한 BAC 클론을 찾아 염기서열 분석하는 BAC-to-BAC 방법을 추진하고 있으며 8개국에서 참여하여 현재 염기서열 분석을 추진 중 이다. 최근에 각 국에서는 생물정보학기법을 활용한 염기서열 분석 기반에 대하여 많은 토론이 진행되고 있다. 앞으로 다양한 유전체 정보가 축적됨에 따라 배추의 유전체 구조를 이해하고 농업적으로 적용하고자 하는데 기여를 할 것이다. Brassica rape is an important species used as a vegetable, oil, and fodder worldwide. It is related phylogenically to Arabidopsis thaliana, which has already been fully sequenced as a model plant. The 'Multinational Brassica Genome Project (MBGP)'was launched by the international Brassica community with the aim of sequencing the whole genome of B. rapa in 2003 on account of its value and the fact that it has the smallest genome among the diploid Brassica. The genome study was carried out not only to know the structure of genome but also to understand the function and the evolution of the genes comprehensively. There are two mapping populations, over 1,000 molecular markers and a genetic map, 2 BAC libraries, physical map, a 22 cDHA libraries as suitable genomic materials for examining the genome of B. rapa ssp. pekinensis Chinese cabbage. As the first step for whole genome analysis, 220,000 BAC-end sequences of the KBrH and KBrB BAC library are achieved by cooperation of six countries. The results of BAC-end sequence analysis will provide a clue in understanding the structure of the genome of Brassica rapa by analyzing the gene sequence, annotation and abundant repetitive DHA. The second stage involves sequencing of the genetically mapped seed BACs and identifying the overlapping BACs for complete genome sequencing. Currently, the second stage is comprises of process genetic anchoring using communal populations and maps to identify more than 1,000 seed BACs based on a BAC-to-BAC strategy. For the initial sequencing, 629 seed BACs corresponding to the minimum tiling path onto Arabidopsis genome were selected and fully sequenced. These BACs are now anchoring to the genetic map using the development of SSR markers. This information will be useful for identifying near BAC clones with the seed BAC on a genome map. From the BAC sequences, it is revealed that the Brassica rapa genome has extensive triplication of the DNA segment coupled with variable gene losses and rearrangements within the segments. This article introduces the current status and prospective of Korea Brassica Genome Project and the bioinformatics tools possessed in each national team. In the near future, data of the genome will contribute to improving Brassicas for their economic use as well as in understanding the evolutional process.

Brassica A genome의 최근 연구 동향

최수련,권수진 한국식물생명공학회 2012 식물생명공학회지 Vol.39 No.1

As a scientific curiosity to understand the structure and the function of crops and experimental efforts to apply it to plant breeding, genetic maps have been constructed in various crops. Especially, in the case of Brassica crop, genetic mapping has been accelerated since genetic information of model plant Arabidopsis was available. As a result, the whole B. rapa genome (A genome) sequencing has recently been done. The genome sequences offer opportunities to develop molecular markers for genetic analysis in Brassica crops. RFLP markers are widely used as the basis for genetic map construction, but detection system is inefficiency. The technical efficiency and analysis speed of the PCR-based markers become more preferable for many form of Brassica genome study. The massive sequence informative markers such as SSR, SNP and InDels are also available to increase the density of markers for highresolution genetic analysis. The high density maps are invaluable resources for QTLs analysis, marker assisted selection (MAS), map-based cloning and comparative analysis within Brassica as well as related crop species. Additionally, the advents of new technology, next-generation technique, have served as a momentum for molecular breeding. Here we summarize genetic and genomic resources and suggest their applications for the molecular breeding in Brassica crop.

이탈리안 라이그라스 조생종의 답리작재배 파종시기가 수량에 미치는 영향

최수련,김맹중,임용우,성병렬,김종근,김기용 한국초지조사료학회 2005 한국초지조사료학회 학술대회논문집 Vol.2005 No.1

클라우드 기반 의료정보시스템 도입에 대한 지각된 위험, 지각된 혜택이 수용저항에 미치는 영향

최수련,양성병 한국경영정보학회 2019 한국경영정보학회 학술대회논문집 Vol.2019 No.11

제4차 산업혁명 시대를 맞아, 금융, 의료, 제조 등 다양한 산업분야에서 클라우드 컴퓨팅 기술을 활용한 서비스가 등장하고 있으며, 의료 및 헬스케어 산업 또한 클라우드 컴퓨팅을 활용한 의료정보데이터의 축적, 빅데이터 및 인공지능 기법을 활용한 분석, 분석결과를 활용한 효율적인 의료서비스 제공 등의 노력이 이어지고 있다. 클라우드 기반의 의료정보시스템은 데이터의 권한이 병원 중심에서 환자 중심의 데이터로 나아가기 위한 시작으로, 병원에서 근무하는 의료정보시스템 사용자들은 이러한 동향을 파악하고 새로운 시스템에 적응할 필요가 있다. 이에 본 연구에서는 정보기술의 발전으로 의료정보시스템에도 고도화의 흐름이 진행됨에 따라, 갓 도입된 클라우드 기반 의료정보시스템의 초기 수용 사용자의 지각된 위험, 지각된 혜택을 통한 지각된 가치를 도출하여, 이를 통해 수용저항에 어떠한 영향을 미치는지를 확인해 보고자 한다. 3차 상급 종합병원을 대상으로 한 온라인 설문을 통해 분석한 진행한 결과, 프라이버시 위험이 지각된 가치에 유의한 영향을 미치는 것으로 나타났고, 경제성 및 공유성이 지각된 가치에 유의하게 영향을 미치는 것을 확인하였다. 한편, 지각된 가치는 수용저항에 강하게 영향을 미치고 있음을 확인하였다. 본 연구의 결과가 의료데이터의 주도권이 병원에서 환자 중심으로 넘어가고 있음을 주지시키고, 이를 통해 클라우드 기반 의료정보시스템을 통해 확보한 수많은 환자들의 의료정보가 어떻게 안전하게 보호되어야 하며, 나아가 어떻게 활용 및 공유될 수 있을지에 대해서도 진지하게 고민할 수 있는 시발점이 되기를 기대한다.

클라우드 기반 의료정보시스템 도입에 대한 지각된 위험 및 혜택이 수용저항에 미치는 영향: 가치기반수용모형을 기반으로

최수련,강은경,양성병 한국인터넷전자상거래학회 2022 인터넷전자상거래연구 Vol.22 No.5

In the 4th industrial revolution era, cloud computing has been spreading in various industries. In the healthcare industry as well, calls for advancing the healthcare information system (HIS) through cloud-based digital transformation are gaining momentum so that healthcare services can be received ‘anytime and anywhere’ from a patient perspective, not from a hospital one. Most of the previous studies on cloud computing in the field of HIS have been conducted from the perspective of hospitals that establish and operate HIS; there is a clear limitation that it has not been conducted from the perspective of patients who need healthcare services. Therefore, based on the value-based adoption model (VAM), this study derives perceived risk (i.e., privacy risk, performance risk, institutional risk) and perceived benefit (i.e., usefulness, shared benefit, economic benefit) factors, and investigates their impact on perceived value and acceptance resistance in the context of cloud-based HIS. A structural equation model analysis was conducted using 118 samples obtained through an online survey targeting potential HIS users at general hospitals in Korea. As a result of hypotheses testing, it was found that privacy risk, shared benefit, and economic benefit significantly impact perceived value, which in turn negatively influences acceptance resistance. This study is the first to apply the VAM to the context of cloud-based HIS. Research findings would help managers considering the introduction of cloud-based HIS in the future prepare practical guidelines to reduce user acceptance resistance effectively.

양단탕 추출물의 항염증 효과에 대한 연구

최수련,황형서,김태연 한의병리학회 2020 동의생리병리학회지 Vol.34 No.5

Yangdan-tang (YD) is recorded as a treatment to treat exterior-related fever illness in the Korean medicine. In this study, we examined the anti-inflammatory effects of YD, using YD water extract and lipopolysaccharide (LPS)-induced RAW 264.7 cells. First of all, we measured the amount of nitric oxide (NO) and prostaglandin E2 (PGE2), the products of inflammatory metabolism. Also, we measured enzymes such as inducible nitric oxide synthase (iNOS) and cyclooxygenase-2 (COX-2), as well as cytokines such as tumor necrosis factor alpha (TNF-α), interleukin 6 (IL-6), interleukin 1 alpha (IL-1α), and interleukin 1 beta (IL-1β). YD suppressed the production of NO and PGE2 in a dose dependent manner and reduced the amount of protein and the mRNA expression of iNOS and COX-2. Also, YD reduced the mRNA expression of TNF-α, IL-6, IL-1α and IL-1β. In conclusion, YD decreased production of LPS-induced inflammatory factor, which could be a clinical basic subject for inflammatory diseases.

흰쥐 담즙울체간에서의 Glucose-6-Phosphate Isomerase 및 Fructose-1, 6-Bisphosphate Aldolase의 활성도

최수련,김여희 啓明大學校 醫科大學 1997 계명의대학술지 Vol.16 No.4

담즙울체간에서 glucose-6-phosphate isomerase(GPI)와 froctose-1,6-bisphosphate aldolase(ALS)의 활성도 변동을 알아보기 위하여 흰쥐 총담관을 결찰한 후 12시간부터 42일까지의 담즙울체간의 세포분획에서 이들 효소의 활성도를 측정하는 한편 혈청에서도 이들 효소의 활성도를 측정하였다. 총담관 결찰 후 흰주 담즙울체간의 cytosolic GPI의 활성도는 총담관 결찰 후 12시간부터 2일까지 유의한 감소를 나타내었다. 그러나 motochondrial 및 microsomal GPI의 활성도는 각각 총담관 결찰 후 2일부터 42일 및 1일부터 28일까지 유의한 증가를 나타내었다. 총담관 결찰 후 흰주 담즙울체간의 mitochondrial 및 microsomal ALS 활성도는 다같이 총담관 결찰 후 2일과 3일에 유의한 증가를 나타내었다. 그러나 cytosolic ALS 활성도는 총담관 결찰후 1일부터 42일까지 약간 감소되었다. 이상의 결과로 보아 흰쥐 담즙울체간에서는 mitochondrial 및 microsomal GPI 와 ALS는 그 활성도가 증가되는 효소이고 cytosolic GPI와 ALS는 그 활성도가 감소되는 효소이며, 담즙울체간에서 mitochondrial, 및 microsomal GPI와 ALS의 활성도 증가는 담즙울체간에서 그 합성이 증가되어 나타난 결과라 생각된다. 또한 담즙울체시 혈정에서 GPI 와 ALS의 활성도가 증가된 것은 간의 괴사와 간세포막의 투과성 항진으로 이 효소들이 혈증에 다량 주출되어 나타난 결과라 생각된다. This study was made to know the changes of glucose-6-phosphate isomerase (GPI) and fructose-1, 6-bisphosphate aldolase (ALS) activities in cholestatic rat livers. GPI and ALS activities were determined in cytosolic, mitochondrial, and microsomal preparations isolater from cholestatic rat liver, and in the rat serum after common bile duct ligation for a period of forty two days. The activities of mitochondrial and microsomal GPI in cholestatic rat liver showed a significant increase from the second day to the forty second day, and from the first day to the twenty eighth day, respectively, after the ligation. However, the cytosolic GPI activity in cholestatic liver showed a significant decrease from the twelfth hour to the second day after the ligation. The activities of both mitochondrial and microsomal ALS in cholestatic rat liver showed a significant increase from the second day to the third day after the ligation. However, cytosolic ALS in cholestatic liver was decreased slightly from the first day to the forty second day after the ligation. On the other hand, the activities of GPI and ALS in rat serum showed a significant increase from the twelfth hour to the seventh day, and from the first day to the forty second day, respectively,, after the ligation. These results, therefore, suggest that the biosynthesis of liver particulate-bound GPI and ALS are induced in response to cholestasis. And the elevations of both serum GPI and ALS activities seem to be leak of the enzymes into the blood from cholestatic liver

일 도농복합지역 주민의 우울증 유병률 조사

최수련(Soo Ryun Choi),연병길(Byeong Kil Yeon),한창환(Chang Hwan Han),홍나래(Narei Hong),권희정(Hee Jung Kwon) 대한사회정신의학회 2007 사회정신의학 Vol.12 No.1

목 적: 우울증의 조기 발견 및 치료는 정신보건분야에서 매우 중요하다. 우울증을 조기에 발견해서 치료함으로써 정신 및 신체 질환의 일반적인 예후를 향상 시킬 수 있으며 자살률 또한 낮출 수 있다. BDI는 일차 진료현장에서 비교적 쉽고 빠르게 우울증상을 발견할 수 있는 척도이다. 이 연구는 BDI를 이용하여 우울증 및 우울증상의 유병률을 밝혀 지역 사회 정신건강 증진의 기초자료를 마련하고자 하였다. 방 법: 충청남도 아산시 도고면, 온양 3동에 거주하는 주민 291명을 대상으로 인구학적 기초정보 및 BDI를 조사하였다. 우울증은 BDI 점수를 기준으로 남성의 경우 23점, 여성의 경우 24점 이상으로 정의하였고 우울증상은 BDI STEN 점수 7점 이상으로 정의하였다. 결 과: 연령 보정 후 우울증의 유병률은 전체 8.9%, 남성 4.1%, 여성10.0%로 나타났으며 우울증상의 유병률은 전체 17.9%, 남성 12.5%, 여성 23.1%이었다. 우울증상과 관련된 요인으로는 성별, 정신과 질환의 가족력, 내과적 질환 등으로 나타났으며 나이, 교육정도, 수입, 결혼력과의 관련성은 통계적으로 유의하지 않았다. 결 론: 도농복합지역에서의 우울증 및 우울증상의 유병률은 국가 전체를 대상으로 했을 때와 비슷한 결과를 보였다. 우울증 및 우울증 상을 보이는 것으로 나타난 고위험군을 대상으로 하여 정신보건 서비스를 제공하여 우울증상을 조기 발견, 치료한다면 지역사회 정신건강을 증진시킬 수 있을 것이다. Objectives:Early detection and treatment of depression is very important to improve community mental health. Finding and treating depression early can improve general prognosis of mental and physical diseases and reduce the rate of suicide. Using BDI, primary practitioner can easily find depressive symptoms. The purpose of this study was to find prevalence of depression and depressive symptoms and correlates of depressive symptoms to suggest baseline data. Methods:We investigated 291 people who were residing in Onyang 3-dong and Dogo-myun, Asan-si, Chungcheongnam-do. Our research team visited their residence and gathered information using the questionnaire about sociodemographic factors and BDI. Depression was defined as BDI total score over 23 in males and over 24 in females. Depressive symptom was defined as BDI STEN score over 7. Results:The prevalence of depression in Asan-si was 8.9% in total, 4.1% among males, 10.0% among females. The prevalence of depressive symptoms was 17.9% in total, 12.5% among males, 23.1% among females. The related factors of depressive symptoms was sex, family history of psychiatry and medical disease. Age, education years, incomes and marital status were not statistically significant. Conclusion:Prevalence of depression and depressive symptoms in a mixed region of urban and rural communities is similar with those among national wide sample. With mental service for those who are in high risk group, early detection of depressive symptoms from community will be needed to improve general health status.

Analysis of Japanese Aesthetic Concepts by Language Game

SuRyun Choi(崔秀蓮),Masato YAKO(矢向正人) 한국일본문화학회 2017 日本文化學報 Vol.0 No.73

The purpose of this paper is to analyze Japan’s wabi-sabi and iki in comparison with Korea`s han and Western aesthetic categories. It is understood that wabi-sabi, iki and han are not pure concepts of aesthetics but are also associated with human behaviors, psychology and somesthesis. In addition to this, these concepts may sometimes become expressions that connote rejection of the world. Therefore, to set bases for these concepts, they have to be described with consideration for a function to provide feedback when they are used and while differentiating the demeanors and latent powers. Based on this consideration, a circulation model of aesthetic formation created by Yako based on the later thought of Wittgenstein is applied to these concepts. In order to clarify their attributes while differentiating the demeanors, each circulation is examined from the aspects like stability, orientation, distance, clarity, tension, intensity and persistence. Lastly, Kuki"s “iki cube” has been reconstructed through the comparison with one of the author’s model.

Genetic Mapping Based on AFLP, RAPD, SSR, and PCR-RFLP in Chinese Cabbage

Su Ryun Choi(최수련),Harui Cui(최해서),Yong Pyo Lim(임용표) 한국원예학회 2002 한국원예학회 학술발표요지 Vol.2002 No.6