Rhizopus속의 염색체에 관한 연구 1

민병례,이택준,최영길 한국미생물학회 1982 미생물학회지 Vol.20 No.3

This experiment was designed to elucidate the life cycle of 7 species (Rh.nigricans, Rh. delemar, Rh.oryzae, Rh.acidus, Rh.tritici, Rh. formosaensis and Rh. japonicus) in genus Rhizopus isolated from Korean soil, so as to seize the appropriate stage for detecting their chromosomal number and nuclear size under the method of thin layer slide culture using modified Rogers(1965a) medium. The results are summarized as the folowings ; 1. The haploid chromosome number are found 16 in Rh. japonicus are 8, respectively. 2. Comparing the 7 species of Rhizopus with each other, it may be concluded that the basic haploid chromosome number of genus Rhizopus distributed in Korean soil are 8 and that Rh. nigricans is double of the basic hapolid chromosome number (n = 16). Besides them, the other two species (Rh. tritici and Rh. formosaensis) are believed aneuploids.

Rhizopus 속내의 2종에 대한 단백질 분석

민병례,이주향 상명대학교 기초과학연구소 1996 기초과학연구 Vol.9 No.-

산업적, 공업적, 경제적, 의학적으로 중요한 균종중의 하나인 Rhizopus에 속하는 2 균종중 phylogeny상 유연관계가 상당히 먼 2종 R acidus 와 R. stolonifer를 택하여 이들의 유전자 발현 산물인 단백질 patterns을 관찰한 결과 SDS-PAGE로 분리한 단백질 patterns은 분자량 14,400 daltons에서 97,400 daltons사이에 30개 이상의 polypeptide bands를 볼 수 있었고, 2종간의 bands에서는 큰 차이를 볼 수 없었다. 등전점을 이용한 IEF-gel에서는 pH 3.5~10의 ampholine을 사용하였으나, 주로 pH6~pH8 사이에서 6~9개의 bands를 보았다. 전체적으로 R.stolonifer의 pH가 R.acidus의 pH보다 낮았는데, 이는 최적 생장 pH가 R.acidus가 더 높은 것과 일치하는 결과였다. The paper reports on soluble-protein patterns using SDS-PAGE and IEF-gel for two species, R, acidus and R stolonifer, in the genus Rhizopus. There are over 30 polypeptide bands ranged from molecular weight 14,400 ddtons to 97,400 daltons on SDS-PAGE and no obvious differences between two species. On IEF-gel using ampholine pH 3.5-10 as canier ampholytes, all of polypeptide bands are over pH 6, ranged from pH 6.5 to pH 7.9. Polypeptide bands of R. acidus are slightly more basic than in R. stolonifer. This result coincides with optimum pH of growth.

Fusarium 속에서 PFGE 를 이용한 Electrophoretic Karyotyping

민병례,정진숙,최영길 ( Byung Re Min,Jin Sook Jung,Yong Keel Choi ) 한국균학회 1998 韓國菌學會誌 Vol.26 No.2

Fusarium속의 염색체 분석

민병례 한국미생물학회 1989 미생물학회지 Vol.27 No.4

Fusarium 속의 20균주를 PDA 배지에서 배양하고. HCI-Giemsa 염색법을 이용하여 균사 내에서의 영양핵의 핵분열을 관찰하였고, 염색체 수를 세었다. 관찰한 모든 Fusarium 속의 균주들익 염색체 수는 4-8개 사이에 있었다. 그 중에서 3균주인 F. solari S Hongchun D4. F. moniiforme(from banana), F. raphani (from radish)는 n=8개이고, F, solani 7468(from Sydney), F, solani 7475 (from Sydney), F, oxyporum (from tomato), F, oxyporum(from tomato). F F. roseum(from rice), F, sporotrichioides C. Jungsun 1, F. avenaceum C Kosung 6. F, avenaceum46039 등의 7균주에서는 n=7개였다 F. monilzfonne (from rice), F. graminellrum, F. probiferatum 6787(from Sydney), F. anguioides ATCC20351의 5균주는 n=6개 F. moniliforme NRRL2284. F. poae NRRL3287. F. tricintum NRRL 3299의 3균주는 n=5개였고 가장 적은 수의 n=4개인 균주로는 F. sporotrichioides NRRL3510과 F. equiscli KFCC 11843 IFO 030198의 3균주였다. 이상의 균주들의 염색체 수를 비교 고찰할 때 Fusarium 속의 기본 염색체 수는 반수체가 4개이며 종 분화과정에서 이수체와 배수체가 되었을 것으로 추론된다. by use of HCl-Giemsa technique and light microscope, dividing vegetative nuclei in hyphae of Fusarium species were observed and the results are summerized. The chromosome number of these fungi was ranged 4 to 8. Of the 20 strains, the highest haploid chromosome number is 8 in F. solani S Hongchun K4, F. moniliforme (from banana) and F. raphani (from radish). The lowest is 4 in F. sporotrichioides NRRL 3510 and F. equiseti KFCC 11843 IFO 30198. F. solani 7468 (from Sydney), F. solani 7475 (from Sydney), F. oxysporum(from tomato). F. roseum (from rice), F. sporotrichioides C Jngsun 1, F. equiseti C Kosung 1 and F. avenaceum 46039 are n=7. F. moniliforme (from rice) F. graminearum, F. proliferatum 6787 (from Syndey), F. proliferatum 7459 (from Synder) and F. anguioides ATCC 20351 are n=6. F. moniliforme NRRL 2284, F. poae NRRL 3287 and F. trincinctum NRRL 3299 are n=5. From these results, it may be concluded that the basic haploid chromosome number of the genus Fusarium is 4 and mat have been evolutionary variation of chromosome number through aneuploidy and polyploidy.

Fusarium 속 균종들의 염색체수

민병례 한국미생물학회 1991 미생물학회지 Vol.29 No.1

The chromosome of Fusarium species during the vegetatve nuclear divisions in hyphae were observed by use of HCl-Giemsa technique on light microscope. The haploid chromosome number of Fusarium anthophilum 7472 was n=7, n=6 in F. anthophilum 7481 and n=6 in F. oxysporum 7500. The haploid chromosome number was 7 in F. napiforme 6129 and F. napiforme 6144. Those of F. caucasicum F. caucasicum ATCC 18791 and F. aquaeductuum ATCC 15612 were n=5. F. coeruleum ATCC 20088 was n=6, n=8 in F. camptoceras ATCC 16065 and n=7 in F. sambucinum NRRL 13451. From these results and previous papers, it may be concluded that the basic haploid chromosome number of the genus Fusarium is n=4.

Fusarium 종에서의 RAPD-PCR분석

민병례,양연주,최영길 한국미생물학회 1999 미생물학회지 Vol.35 No.2

Fusarium 균에 속하는 16종 21균주를 대상으로 RAPD-PCR 방법을 이용하여 DNA 다형성을 분석하여 계통 유전학적 유연관계를 검토하였다. 40개의 random primer 로 시험하여 실험한 모든 종에서 다형성을 나타내는 11개의 primer를 선별하였다. RAPD 분석결과 평균 23.9개씩 모두 263개의 크기가 다른 RAPD 밴드들을 조사할 수 있었다. 각 primer에 대해 각각 독특한 DNA 다형성을 나타내었고, 증폭된 DNA 크기는 0.1-3.0 kb 범위에서 형성되었다. 각 균주간의 genetic similarity를 계산하여 유연관계를 dendrogram 으로 나타내었다. Genetic similarity 0.627을 기준으로 하여 크게 4그룹으로 나눌 수 있었다. To assess genetic diversity amoug 21 strains from sixleen Frrsn~i~nn species , we used RAPD(rando1n amplified pol.ymorphic DNA) analysis based on PCR(po1ymerase chain reaction). Eleven primers showing Ule polymorphism were chosen from the 40 random pnmers-tcstcd. A total of 263 polymorphic bands were generated by the primers and the size of amplified DNA fragments ranged from 0.1 lo 3.0 kb. Sirnilku-it), coefficients between strains were calcnlatcd, and UPGMA cluster analysis was used to generate a dendrogram showing relationships among them. The results from RAPD-PCR analysis were grouped into four main groups at the si~nilarity level of 0.627.

토양에 존재하는 미생물세포와 포자의 PCR 검출을 위해 소량의 DNA Sample 준비를 위한 방법

민병례,김정은 상명대학교 자연과학연구소 2004 自然科學硏究 Vol.12 No.-

RAPD 분석을 이용한 Fusarium 속(Genus)내 13종간의 분류학적 위치 규명

민병례,류지숙 상명대학교 기초과학연구소 1998 기초과학연구 Vol.11 No.-

Fusarium 13종의 분류학적 위치를 규명하기 위하여 arbitrary decamer primers를 사용하여 polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (RAPD) 방법을 사용하여 유전적인 다양성을 조사하였고, 증폭된 DNA의 PCR band patterns를 기초로 하여 UPGMA 방법으로 dendrogram을 그려 각 종간의 유사도를 구하였다. 선별한 8개의 primer에서는 평균적으로 1-9개의 bands가 0.1-3.0kb의 범위에서 나타나는 양상을 보였다. 13종간의 계통 분류학적 유사도는 0.58-0.85 사이로 나타났고, 가장 높은 유사도는 0.85로 section Elegans에 속하는 F. oxysporum과 section Liseola에 속하는 F.subglutinans 간에서 관찰되었다. To clarify the taxonomical classification of the genus Fusarium 13 species, genetic variation among them was assessed by RAPD using 8 arbitrary decamer primers. Similarity values were calculated from PCR patterns and based on these values a dendrogram was constructed by UPGMA method. We confirmed that the use of the RAPD procedure make it possible to distinguish among different species. The range of genetic similarity value among selected 13 species is 0.58 - 0.85, and the highest clustered value was 0.85 between F. subglutinans and F. oxysporum, which were belonged to different section.

Rhizopus屬의 染色體에 關한 硏究(第二報) -II. Rhizopus 17種에 對하여-

민병례,Min, Byung-Re 한국미생물학회 1984 미생물학회지 Vol.22 No.3

After the previous paper, this chromosomal studies on the fungi were dealt with 17 species in genus of Rhizopus. The results are sumarized as the followings; The haploid chromosome number of 17 species were confirmed as of 6(Rh. oligosporus), 8(Rh. homothallicus, Rh. liquefaciens, Rh. shanghaiensis, Rh, acetorinus), 12(Rh. microsporus, Rh. pseudochinensis, Rh, rhizopodiformis, Rh, thermosus, and Rh. kazanensis), 14(Rh. stolonifer), and 16(Rh. suinus), respectively. Referring to the above fact and the previous paper, it is strongly presumed that the basic chromosome number of Rhizopus are 4.

Fusarium 속내의 rDNA ITS region의 RFLP 분석

민병례,이영미 상명대학교 자연과학연구소 1998 自然科學硏究 Vol.5 No.-

Fusarium section Discolor와 Roseum에 속하는 8개의 균주간의 유전적 변이를 조사하기 위하여 rDNA의 ITS 부위를 PCR을 이용하여 증폭한 후에 16개의 제한효소를 처리하여, RFLP patterns를 분석하였다. PCR 생산물의 크기는 대략 560 - 610bp로 다양하게 나타났다. 사용한 제한효소 중에서 7개만이 조사된 균주에서 절단 부위를 가지고 있었다. EcoRI와 SphI으로 처리된 band pattern은 모든 strain에서 거의 같은 양상을 나타내었다. 그러나 AluI, MspI, HaeIII, PstI 그리고 SmaI으로 처리한 후 나타난 밴드 양상은 각 균주에서 서로 다른 patterns를 보여주었다. RFLP 분석의 결과에서, Fusarium 균주의 ITS 부분은 종간과 종내 변이를 나타내었다. To investigate the genetic variation among 8 strains belonged to Fusarium Section Discolor and Roseum, after the ITS regions of the rDNA were amplified using the PCR and digested with 16 restriction enzymes, RFLP patterns were analyzed. The size of PCR products varied approximately 560-610 bp. Among these restriction endonuclease tested, seven enzymes had restriction sites in the ITS region of Fusarium species. Band patterns digested with EcoRI and SphI appeared almost same in all straines, but those with AluI, MspI, HaeIII, PstI and SmaI showed different from each other. As the result of RFLP analysis, the ITS region of the Fusarium species showed intraand interspecific variation.