Corynebacterium glutamicum의 sigH 유전자의 분리 및 기능분석

김태현,김형준,박준성,김연희,이흥식,Kim Tae-Hyun,Kim Hyung-Joon,Park Joon-Sung,Kim Younhee,Lee Heung-Shick 한국미생물학회 2005 미생물학회지 Vol.41 No.2

유전자 lacZYA가 aces 유전자의 프로모터 하단에 연계된 $(P_{aceB}-lacZYA)$ 리포터 플라스미드를 함유하는 Escherichia coli를 이용하여 glyoxylate bypass를 매개하는 유전자중하나인 aceB의 발현을 조절하는 것으로 여겨지는 Corynebacterium glutamicum클론들을 색판독에 의해 분리하였다. 이 중 한 개의 클론을 선택하여 분석할 결과 이 클론을 함유한 E. coli는 리포터 플라스미드에서 발현되는 $\beta-galactosidase$의 활성 이 약 $40\%$ 감소하였고 이는 클론에서 발현되는 단백질이 aceB프로로터에 작용함에 기인한 것으로 판단되었다. 서열분석결과 ORF1과 ORF2의 두 개의 인접한 ORF가 발견되었고 이중 ORF2가 reporter plasmid의 $\beta-galactosidase$의 활성 감소에 직접적으로 기여함을 알 수 있었다. ORF1은 206아미노산으로 구성된 23,218 Dalton의 단백질을 발현하는 것으로 여겨졌고, 유사성 분석결과 ECF-type에 해당되는 RNA polymerase의 sigma factor를 암호화하는 것으로 보여 sigH로 명명하였다. 유전자 sigH의 기능을 밝히기 위해 gene disruption technique을 이용하여 sigH 유전자가 기능을 하지 못하는 돌연변이 균을 제작하였으며 이 균주는 야생형에 비해 성장속도가 저하됨을 관찰하였다. 또한 변이균은 oxidative stress를유발하는 pumbagin둥에 대해서도 민감성을 나타내었다. 이들 결과는, 유사성 분석결과에서도 볼 수 있듯이 sigH유전자가 세포성장과정 중 처하게 되는 각종 stress중 특히 oxidative stress에 대한 대응과 관련되어 발현될 수 있음을 암시한다.상관관계는 공간적인 범위가 10$\times$10km 이하인 경우에 높게 나타났다. 하지만 공간범위가 그 이상이 될 경우에는 그 내부에서 나타나는 다양성으로 인해 통계적인 상관성이 현격하게 낮아지는 것을 관찰할 수 있었다. 이러한 결과는 지역 및 국가 단위의 환경변화모델에서 모델의 공간적인 구성범위가 일정한 수준을 넘으면, 그 내부에서 발생하고 있는 다양성이 급격하게 증가하여 지표피복변화의 원인과 결과를 정확하게 파악하기 힘들게 된다는 것을 의미한다. 10$\times$10km의 공간적인 범위는 농업생산이 위주가 되는 사바나 지역에서는 주로 개별 마을이 차지하고 있는 공간적인 범위와 대체적으로 일치한다. 따라서 사바나 지역에서 나타나는 지표피복변화의 다양성을 고려하면서 보다 정확하게 모형화하기 위해서는 마을단위에서 나타나는 지표피복변화과정이 최소의 모델단위가 되어야 함을 시사한다. 아니라 다른 방법으로 영향을 미치고 있다는 것을 알 수 있었다., 계절별로는 여름철에 강수가 집중됨으로서 습성강하물 침착량이 총량적으로 증가하였으며, 그 값은 $SO_4^{2-}\;2.118g/m^2/season,\;NO_3^-\;1.509g/m^2/season,\;Cl^-\;2.185g/m^2/season,\;NH_4\;^+\;1.096g/m^2/season$로. 나타났다. 계절별 잎의 평균 pH의 변화는 봄 pH $5.9\pm0.5$, 여름 pH $5.5\pm0.4$, 가을 pH $5.1\pm0.3$을 나타내었고, 엽중 수용성 황함량의 계절별 평균값은 봄 $0.012\pm0.004\%$, 여름 $0.012\pm0.002\%$, 가을 $0.020\pm0.007\%$ 수준을 보이고 있다. 수피 내 함유되어 Corynebacterial clones which exert regulatory effects on the expression of the glyoxylate bypass genes were isolated using a reporter plasmid carrying the enteric lacZ fused to the aceB promoter of Corynebacterium glutamicum. Some clones carried common fragments as turned out by DNA mapping technique. Subcloning analysis followed by the measurement of $\beta-galactosidase$ activity in Escherichia coli identified the region responsible for the aceB-repressing activity. Sequence analysis of the DNA fragment identified two independent ORFs of ORF1 and ORF2. Among them, ORF2 was turned out to be responsible for the aceB-repressing activity. ORF1 encoded a 23,216 Da protein composed of 206 amino acids. Sequence similarity search indicated that the ORF may encode a ECF-type $\sigma$ factor and designated sigH. To identify the function of sigH, C. glutamicum sigH mutant was constructed by gene disruption technique and the sigH mutant showed growth retardation as compared to the wild type strain. In addition, the mutant strain showed sensitivity to oxidative-stress generating agent plumbagin. This result imply that sigH is probably involved in the stress response occurring during normal cell growth.

입체조형 동적회전조사 방사선치료의 선량 검증

김태현,신동호,이두현,박성용,윤명근,신경환,표홍렬,김주영,김대용,조관호,양대식,김철용,Kim Tae Hyun,Shin Dong Ho,Lee Doo Hyun,Park Sung Yong,Yun Myung Guen,Shin Kyung Hwan,Py Hong Ryull,Kim Joo-Young,Kim Dae Yong,Cho Kwan Ho,Yang Dae-Sik,K 한국의학물리학회 2005 의학물리 Vol.16 No.4

입체조형 동적회전조사 방사선치료(Dynamic Conformal Arc Radiotherapy, DCAR)에서 필름 선량계를 이용한 선량검증시 필름 회전중심점 이동 보정값을 최적화법으로 구하고 최적화 후 DCAR에 대한 선량 검증의 정량적 허용기준을 제시하고자 하였다. 정위방사선치료를 시행했던 7명의 전이성 뇌암 환자에서 DCAR 치료계획을 시행하고 필름 선량계로 선량을 측정하였다. 필름 선량계의 가장 큰 계통적 오차 요인인 회전중심점 이동 보정값을 최적화법으로 구하고 치료계획과 필름으로 측정된 선량분포를 비교하여 최적화 전후의 평균 선량오차와 점선량오차가 $5\%$ 이상인 지점의 비율을 얻었다. 모든 환자에서 필름 선량계의 회전중심점 이동 보정값은 1 mm 이내였다. 필름 회전중심점 이동 보정 최적화전, 후로 선량오차 결과를 산출하였다. 최적화 전, 후의 평균 선량오차의 평균은 각각 $1.70{\pm}0.36\%$, $1.34{\pm}0.20\%$이었고 점선량오차가 $5\%$ 이상인 지점 비율의 평균은 각각 $4.54{\pm}3.94\%$, $0.11{\pm}0.12\%$로서 최적화 후 선량오차가 현저히 감소하였다. 본 연구의 결과와 같이 최적화법을 이용한 필름의 회전중심점 이동값을 구하고 최적화 후의 평균 선량오차와 점선량오차가 $5\%$ 이상인 지점의 비율을 구하는 방법은 임상에서 DCAR에 대한 선량 검증 방법으로 유용하게 사용될 수 있을 것으로 기대된다. The purpose of this study is to develop the optimization method for adjusting the film isocenter shift and to suggest the quantitative acceptable criteria for film dosimetry after optimization In the dynamic conformal arc radiation therapy (DCAR). The DCAR planning was peformed In 7 patients with brain metastasis. Both absolute dosimetry with ion chamber and relative film dosimetry were peformed throughout the DCAR using BrainLab's micro-multileaf collimator. An optimization method for obtaining the global minimum was used to adjust for the error in the film isocenter shift, which is the largest pan of systemic errors. The mean of point dose difference between measured value using ion chamber and calculated value acquired from planning system was $0.51{\pm}0.43\%$ and maximum was $1.14\%$ with absolute dosimetry These results were within the AAPM criteria of below $5\%$. The translation values of film isocenter shift with optimization were within ${\pm}$1 mm in all patients. The mean of average dose difference before and after optimization was $1.70{\pm}0.35\%$ and $1.34{\pm}0.20\%$, respectively, and the mean ratios over $5\%$ dose difference was $4.54{\pm}3.94\%$ and $0.11{\pm}0.12\%$, respectively. After optimization, the dose differences decreased dramatically and a ratio over $5\%$ dose difference and average dose difference was less than $2\%$. This optimization method is effective in adjusting the error of the film isocenter shift, which Is the largest part of systemic errors, and the results of this research suggested the quantitative acceptable criteria could be accurate and useful in clinical application of dosimetric verification using film dosimetry as follows; film isocenter shift with optimization should be within ${\pm}$1 mm, and a ratio over $5\%$ dose difference and average dose difference were less than $2\%$.

119구급대원의 아동학대 인식 및 신고의무태도에 관한 연구

김태현,조근자,Kim, Tae-Hyun,Cho, Keun-Ja 한국응급구조학회 2019 한국응급구조학회지 Vol.23 No.2

Purpose: The purpose of this study was to assess 119 emergency medical technicians' perception of child abuse, attitudes towards mandatory reporting, and perceptions of mandatory reporting system, and to promote early reporting. Methods: The questionnaire was filled out by one hundred ninety 119 EMTs with paramedic or nurse licenses. The questionnaire consisted of 53 items with responses based on a five-point scale. Data were collected from July 10 to July 31, 2018, and were analyzed using IBM SPSS version 24.0 software. Results: The average score for 119 EMT's perception of child abuse was 3.76. The average score for positive attitude towards mandatory reporting was 3.63, and the average score for negative attitude towards mandatory reporting was 2.63. The average score for perceptions of the mandatory reporting system was 3.50. There was a significant positive correlation between perception of child abuse and positive attitude towards mandatory reporting (r=.244, p=.001), between perception of child abuse and perceptions of the mandatory reporting system (r=.209, p=.004), and between positive attitude towards mandatory reporting and perceptions of mandatory reporting system (r=.336, p=.000). Conclusion: Systemic educational programs for 119 EMTs on perception of child abuse and reporting are needed. It is very important to establish institutional strategies such as the use of checklist for suspicion of child abuse, procedural simplicity after reporting, and protection of reporter information.

크기 및 대조 기반의 Connected Operator를 이용한 효과적인 수리형태학적 영상분할

김태현,문영식,Kim, Tae-Hyeon,Moon, Young-Shik 대한전자공학회 2005 電子工學會論文誌-SP (Signal processing) Vol.42 No.6

본 논문에서는 영역 기반 부호화를 위해 수리형태학 연산자를 이용한 영역 분할 알고리즘을 제안한다. 수리형태학을 이용한 영상 분할은 단순화, 마커 추출, 영역 결정의 세 단계로 구성된다. 단순화 단계는 분할을 용이하게 하기 위하여 영상의 복잡한 부분들을 제거하는 단계이고, 마커 추출단계는 단순화 과정을 거친 영상으로부터 각 영역의 초기 기준 영역을 찾는 과정이다. 영역 결정단계는 추출된 마커로부터 각 영역의 경계를 결정하는 단계이다. 단순화를 위해 기존 평탄면 필터를 효과적으로 개선한 크기와 대조를 고려한 효과적인 Connected Operator를 사용한다. 마커 추출 과정에서 원영상으로 복원된 영역은 제외시키고 나머지 부분에서 크기와 대조가 일정값 이상인 영역을 마커로 결정한다. 생성된 모든 마커와 Hierarchical Watershed algorithm을 이용하여 초기 영상 분할을 하고 영역 병합과정에서는 영역 수에 대한 화질의 저하를 최소로 하는 영역 병합 알고리즘을 제안한다. 동시에, 시각적 특성을 고려하여 일정 대조 이상인 영역 쌍은 병합에서 제외시킨다. 실험 결과에서 제안된 마커 추출 방법이 화질을 많이 저하시키지 않는 범위 내에서 적은 수의 마커를 추출하며, 영역 병합과정을 통해 많은 불필요한 영역들을 병합할 수 있음을 보인다. In this paper, we propose an efficient segmentation algerian using morphological grayscale reconstruction for region-based coding. Each segmentation stage consists of simplification, marker extraction and decision. The simplification removes unnecessary components to make an easier segmentation. The marker extraction finds the flat zones which are the seed points from the simplified image. The decision is to locate the contours of regions detected by the marker extraction. For the simplification, we use a new connected operator based on the size and contrast. In the marker extraction stage, the regions reconstructed to original values we excluded from the candidate marker. For the other regions, the regions which are larger than structuring elements or have higher contrast than a threshold value are selected as markers. For the initial segmentation, the conventional hierarchical watershed algorithm and the extracted markers are used. Finally in the region merging stage, we propose an efficient region merging algorithm which preserves a high quality in terms of the number of regions. At the same time, the pairs which have higher contrast than a threshold are excluded from the region merging stage. Experimental results show that the proposed marker extraction method produces a small number of markers, while maintaining high quality and that the proposed region merging algorithm achieves a good performance in terms of the image quality and the number of regions.

STRUCTURAL ASSESSMENT OF RPV UNDER MULTI-LAYERED CORIUM FORMATION CONDITIONS

김태현,Seung Hyun Kim,장윤석 한국원자력학회 2015 Nuclear Engineering and Technology Vol.47 No.3

External reactor vessel cooling (ERVC) for in-vessel retention (IVR) has been considered one of the most useful strategies to mitigate severe accidents. However, reliability of this common idea is weakened because many studies were focused on critical heat flux whereas there were diverse uncertainties in structural behaviors as well as thermal–hydraulic phenomena. In the present study, several key factors related to molten corium behaviors and thermal characteristics were examined under multi-layered corium formation conditions. Thereafter, systematic finite element analyses and subsequent damage evaluation with varying parameters were performed on a representative reactor pressure vessel (RPV) to figure out the possibility of high temperature induced failures. From the sensitivity analyses, it was proven that the reactor cavity should be flooded up to the top of the metal layer at least for successful accomplishment of the IVR-ERVC strategy. The thermal flux due to corium formation and the relocation time were also identified as crucial parameters. Moreover, three-layered corium formation conditions led to higher maximum von Mises stress values and consequently shorter creep rupture times as well as higher damage factors of the RPV than those obtained from two-layered conditions.

원통 도체 위에 장착된 역 F 안테나의 방사 패턴 분석

김태현,김성완,이재득,박동철,Kim Tae-Hyun,Kim Sung-Wan,Lee Jae-Deuk,Park Dong Chul 한국전자파학회 2005 한국전자파학회논문지 Vol.16 No.5

본 논문에서는 위성 발사체와 같은 원통 도체에 UHF 대역의 역 F 안테나가 장착되어 있을 때 방사 패턴을 시뮬레이션하고 분석하였다. 우선 파라미터를 변화시켜가면서 장착될 역 F 안테나 자체의 특성을 분석한 다음, 이 역 F 안테나가 원통 도체에 장착된 경우에 대하여 시뮬레이션하고 분석하였다. 특히 역 F 안테나의 개수, 원통의 길이, 그리고 원통의 직경 변화에 대하여 방사 패턴을 시뮬레이션하고 분석하였다. 다음으로 역 F 안테나를 제작하여 반사 손실을 측정하고 원통 도체에 장착하였을 때 방사 패턴을 측정하였다. 측정 결과와 시뮬레이션 결과는 서로 잘 일치함을 확인하였다. In this paper, radiation patterns are simulated and analyzed for inverted-F antenna(IFA) on a cylindrical conducting body like a satellite launcher. First, parametric studies are performed for IFA itself to analyze its characteristics. Then, IFAs on a cylindrical conducting body are simulated and analyzed. Especially, by changing the number of IFAs, the length and the diameter of the cylinder radiation patterns are simulated and analyzed. Finally, IFAs on a cylindrical conducting body are fabricated and their return losses and radiation patterns are measured. Good agreements are observed between the simulated and measured results.

측면시야각에서의 대칭적 명암대비비 향상을 위한 IPS-LCD 광학보상

김태현,김봉식,박우상,Kim, Tae-Hyeon,Kim, Bong-Sik,Park, Woo-Sang 한국전기전자재료학회 2016 전기전자재료학회논문지 Vol.29 No.3

In this study, we proposed an optical compensation method to improve the symmetricity of contrast ratio for wide viewing angle IPS (in-plane switching) LCD. First, the phase retardation depending on the thickness of compensation film is calculated, and then the phase change is presented at the $Poincar{\acute{e}}$ sphere. The phase retardation and the polarization state of the light passing through the optical elements are caculated by using the EJMM (extended Jones matrix method). In addition, the transmittance and the contrast countour are also calculated by using the Berremann's $4{\times}4$ matrix method. The simulation is carried out for a IPS LC cell with positive A/C/A compensation film. From the standard deviation of the contrast ratio, we confirmed the symmetricity at each viewing angle is inversely proportional to the standard deviation and calculated the optimum design condition of the uniaxial compensation film for the IPS LCD.

유관기관칼럼 - 불법 전격살충기(전기 모기퇴치기)의 위험성

김태현,Kim, Tae-Hyeon 기술표준원 2008 기술표준 Vol.80 No.-

SoC 플랫폼 상에서 임베디드 블루투스 오디오 스트리밍 솔루션 개발

김태현,Kim, Tae-Hyoun 한국정보처리학회 2006 정보처리학회논문지 A Vol.13 No.7

본 논문에서는 블루투스 무선 링크를 이용한 실시간 오디오 스트리밍을 위해 DSP를 내장한 SoC (System-on-Chip) 플랫폼 상에서 임베디드 블루투스 솔루션의 개발과 최적화에 대해 설명한다. 개발된 솔루션을 이식성을 고려해서 가상 운영체제 상에서 구현된 임베디드 블루투스 프로토콜 스택, 프로파일과 타겟 멀티미디어 SoC의 특성을 이용한 최적화 기법들을 포함한다. 수요 최적화 기법으로는 SoC 내의 스크래치 패드 메모리의 활용을 통한 메모리 접근 최소화, DSP 연산과 병렬 메모리 접근 명령을 이용한 코덱 구현, 무선 통신 환경을 고려한 동적 오디오 품질 조정 등이 있다. 실험 결과는 본 연구에서 제안한 최적화 기법을 적용한 임베디드 솔루션은 별도의 외부 메모리 없이 고품질 오디오 스트리밍을 지원할 수 있음을 보여준다. In this paper, we describe the development and optimization of an embedded Biuetooth solution on an SoC platform for real-time audio streaming over a Bluetooth wireless link. The solution includes embedded Bluetooth protocol stack and profile simplemented on a virtual operating system for portability, and other optimization techniques to fully exploit the benefits of multimedia-oriented SoC. The optimization techniques implemented in this paper are memory access minimization by using on-chip scratch pad memory, codec library optimization with DSP and parallel memory access instruction set, and dynamic audio quality adjustment regarding current wireless link status. Experimental results show that the optimized solution presented in this paper can support high-qualify audio streaming without the support of external memory.

액정 전계 렌즈 기반 3차원 디스플레이 장치의 엄정한 시청영역 분석

김태현,김봉식,박우상,Kim, Tae-Hyeon,Kim, Bong-Sik,Park, Woo-Sang 한국전기전자재료학회 2016 전기전자재료학회논문지 Vol.29 No.8

In this paper, we proposed the 3-dimenstional (3D) analysis for calculating the optical characteristics of an autostereoscopic display with electric field driven liquid crystal (ELC) lens. From 3D analysis considering the slanting of lens, we calculate the cross-talk of each images and the distortion of viewing zone. Using geometric opics and extended Jones matrix method (EJMM), phase retardation of ELC lens according to position is calcuated and then optical path difference in 3D space considering tilt and azimuth angle of incident light is gotten. Then, intensity distribution is presented in the space. Through camparing the intensity distribution using ideal lens with the ELC lens, we identify the noise and image distortion of ELC lens. As a result, this analysis is expected to provide optimum design conditions for realistic and rigorous 3D display with ELC lens.