한국인 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상과 Dystrobrevin Binding Protein 1(DTNBP1) 유전자의 P1635와 P1655 단염기 다형성의 연합에 대한 연구

박진수,박병래,김령효,김동현,장호준,김임렬,이인상,서한길,이철순,김봉조,한규희,정한용,김기훈,신태민,신형두,우성일 대한정신약물학회 2006 대한정신약물학회지 Vol.17 No.6

Objective : We investigated the association of P1635 and P1655 polymorphisms on dystrobrevin binding protein 1(DTNBP1) gene with smooth pursuit eye movement(SPEM) abnormality in Korean schizophrenia patients. Methods : We measured SPEM function in 216 Korean schizophrenia patients(male 116, female 100) and divided them into two groups, one is a good SPEM function group and the other is a poor SPEM function group. We then analyzed P1635 polymorphism and P1655 polymorphism on DTNBP1 gene from their DNAs extracted from their blood. We compared the differences of genotype and allele distributions of the two polymorphisms on DTNBP1 gene between the two groups. Results : The Ln S/N ratio(mean ± sd) of the good SPEM function group was 4.39 ± 0.33 and the ratio of poor SPEM function group was 3.18 ± 0.71. There were no statistically significant differences of age and male/female ratio between the two groups. There were no significant differences of genotype or allele distributions of the P1635 polymorphism and P1655 polymorphism on DTNBP1 gene between the two schizophrenia groups divided by SPEM function. Conclusion : The results suggest that P1635 polymorphism and P1655 polymorphism on DTNBP1 gene might not be related to SPEM function abnormality in schizophrenia. 연구목적:정신분열병 환자의 안구추적운동 이상은 유력한 생물학적인 지표이나 유전자적 원인에 대한 연구가 활발히 진행되지 못하였다. 최근 여러 연구들에서 dystrobrevin binding protein 1(DTNBP1, dysbin-din)이 정신분열병의 원인 유전자의 후보로서 시사되었고, 그 유전자에서 번역된 dysbindin의 발현의 저하가 정신분열병 환자의 해마 및 CA2, CA3 부위 조직에서 나타난다는 보고가 있었다. 그러나 DTNBP1 유전자가 정신분열병 환자의 안구운동 이상의 원인 유전자로 작용할 것인지에 대한 연구는 거의 없었다. 본 연구의 목적은 DTNBP1 유전자상에 존재한 비교적 인접한 두개의 단 염기 다형성들인 P1 635와 P165가 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상의 유전자적인 원인으로 작용할 것인지를 알아보고자 시행되었다. 방 법 :대상군은 216명의 입원한 만성 정신분열병 환자들이며 안구운동(SPEM)을 측정하였고, 신호/잡음의 자연 대수 값(Ln S/N ratio)을 구하여 안구운동이 우수한 군과 열등한 군으로 구분하였다. 이후 대상군의 혈액에서 추출한 DNA로부터 DTNBP1 유전자상의 단 염기 다형성들인 P1 635와 P1655를 분석하여 유전자형과 대립인자형을 알아낸 후, 안구운동 이상 유무에 따른 두 군사이의 분포의 차이를 조사하였다. 결 과 :정신분열병 환자들 중 안구운동이 우수한 군의 신호/잡음의 자연대수 값(Ln S/N ratio)의 평균과 표준편차는 4.39 ± 0.3이었고, 안구운동이 열등한 군의 신호/잡음의 자연 대수 값(Ln S/N ratio)의 평균과 표준편차는 3.18 ± 0.71이었다. 두 군 사이에 나이나 성별비율의 차이는 통계적으로 의미가 없었다. P1 635와 P 1655의 유전자형과 대립인자형의 분포의 차이는 안구운동 이상 유무에 따라 구분한 두 군 사이에 나타나지 않았다.

生鮮에 飛來集合하는 파리群에 對한 調査

金惠淑(A),金治孝,金令彩,金信愛 이화여자대학교 의학회 1974 梨花醫學會誌 Vol.- No.6

1973년 7,8월에 서울 市內 魚肉店 또는 野外에 飛來集合한 파리群에 對해서 調査하여 그 개요를 다음과 같이 記述하고저 한다. (1) 이번 조사에서 서울市內와 市內近郊에서 捕獲한 파리類는 4科 9種으로서 그 種類는 第Ⅰ表와 같다. (2) 서울市內 魚肉店에 飛來集合한 파리類는 6種이며 그 數量的 順位가 집파리(M. domestica) P. Sericata, Lucilia illustris MEIGEN, 알비쉬파리(P. albiceps), M.angustifrons(♀)등으로 그 順位를 보였다(第3表 參照). (3) 서울市內 近郊에서 魚肉에 飛來집합한 파리는 市內魚肉店에 飛來集合한 6種類보다 1種類가 많은 7種類였으나 집파리科(Muscidae)는 始興을 除外하고는 飛未集合이 없었다(第3表 參照) (4) 野外에서 飛來集合한 順位는 地域的인 差가 若干있으나 연두금파리(Lucilia illustris MEIGEN)이 第1位를 나타냈고 그 다음은 P. sericata가 第2位를 나타냈으며 第3位로서는 B. peregrina로 딴 種類보다는 顯著하게 그 數量이 많았다(第3表 參照). (5) 특히 陵谷에서의 飛來集合은 漢江을 낀 環境條件의 野外라 그런지 他地域보다는 그 數量이 比較的 적었다.

한국인 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상과 Dystrobrevin Binding Protein 1(DTNBP1) 유전자의 SNP A와 P1763 다형성의 연합에 대한 연구

이창희,박병래,김령효,김동현,조숙현,박진수,김임렬,이인상,서한길,변기욱,김봉조,한규희,김기훈,신태민,신형두,우성일,Lee, Chang Hee,Park, Byung-Lae,Kim, Lyoung Hyo,Kim, Dong Hyeon,Cho, Sook Hyun,Park, Jin-Soo,Kim, Im-Yel,Lee, In-Sang,Seo, Han-Gil,Byun, 대한생물정신의학회 2006 생물정신의학 Vol.13 No.4

목 적: 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상은 유력한 생물학적인 지표이나 유전자적인 원인에 대한 연구가 활발히 진행되지 못하였다. 최근 여러 연구들에서 dystrobrevin binding protein 1(DTNBP1, dysbindin)이 정신분열병의 원인 유전자의 후보 유전자로서 시사되었으나 정신분열병 환자의 안구운동 이상의 원인으로 작용할 것인지에 대한 연구는 거의 없었다. 본 연구의 목적은 DTNBP1 유전자상에 존재한 비교적 인접한 두개의 단염기 다형성들인 SNP A와 P1763이 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상의 유전자적인 원인으로 작용할 것인지를 알아보고자 시행되었다. 방 법: 대상군은 217명의 입원한 만성 정신분열병 환자들이며 안구운동(SPEM)을 측정하였고, 신호/잡음의 자연대수 값(Ln S/N ratio)을 구하여 안구운동이 우수한 군과 열등한 군으로 구분하였다. 이후 대상군의 혈액에서 추출한 DNA로부터 DTNBP1 유전자상의 단 염기 다형성들인 SNP A와 P1763를 분석하여 유전자형과 대립인자형을 알아낸 후, 안구운동 이상 유무에 따른 두 군사이의 분포의 차이를 조사하였다. 결 과: 정신분열병 환자들 중 안구운동이 우수한 군의 신호/잡음의 자연대수 값(Ln S/N ratio)의 평균과 표준편차는 $4.39{\pm}0.33$이었고, 안구운동이 열등한 군의 신호/잡음의 자연 대수 값(Ln S/N ratio)의 평균과 표준편차는 $3.17{\pm}0.71$이었다. 두 군 사이에 나이나 성별비율의 차이는 통계적으로 의미가 없었다. SNP A와 P1763의 유전자형과 대립인자형의 분포의 차이는 안구운동 이상 유무에 따라 구분한 두군 사이에 나타나지 않았다. 결 론: DTNBP1 유전자상에 존재한 SNP A와 P1763은 정신분열병 환자의 안구추적운동 이상의 유전자적인 원인으로 작용한다는 증거를 얻지 못하였다. Objectives : We investigated the association of SNP A and P1763 polymorphisms on dystrobrevin binding protein 1(DTNBP1) gene with smooth pursuit eye movement(SPEM) abnormality in Korean schizophrenic patients. Methods : We measured SPEM function in 217 Korean schizophrenics(male 116, female 101) and divided them into two groups, one is a good SPEM function group and the other is a poor SPEM function group. We then analyzed SNP A polymorphism and P1763 polymorphism on DTNBP1 gene from their DNAs extracted from their blood. We compared the differences of genotype and allele distributions of the two polymorphisms on DTNBP1 gene between the two groups. Results : The Ln S/N ratio(mean${\pm}$SD) of the good SPEM function group was $4.39{\pm}0.33$ and the ratio of poor SPEM function group was $3.17{\pm}0.71$. There were no statistically significant differences of age and male/female ratio between the two groups. There were no significant differences of genotype or allele distributions of the SNP A polymorphism and P1763 polymorphism on DTNBP1 gene between the two schizophrenic groups divided by SPEM function. Conclusion : The results suggest that SNP A polymorphism and P1763 polymorphism on DTNBP1 gene might not be related to SPEM function abnormality in schizophrenia.

生鮮에 飛來集合하는 파리群에 對한 調査

金惠淑(A),金治孝,金令彩,金信愛 이화여자대학교 의과대학 1974 梨花醫學誌 Vol.- No.6

1973년 7,8월에 서울 市內 魚肉店 또는 野外에 飛來集合한 파리群에 對해서 調査하여 그 개요를 다음과 같이 記述하고저 한다. (1) 이번 조사에서 서울市內와 市內近郊에서 捕獲한 파리類는 4科 9種으로서 그 種類는 第Ⅰ表와 같다. (2) 서울市內 魚肉店에 飛來集合한 파리類는 6種이며 그 數量的 順位가 집파리(M. domestica) P. Sericata, Lucilia illustris MEIGEN, 알비쉬파리(P. albiceps), M.angustifrons(♀)등으로 그 順位를 보였다(第3表 參照). (3) 서울市內 近郊에서 魚肉에 飛來집합한 파리는 市內魚肉店에 飛來集合한 6種類보다 1種類가 많은 7種類였으나 집파리科(Muscidae)는 始興을 除外하고는 飛未集合이 없었다(第3表 參照) (4) 野外에서 飛來集合한 順位는 地域的인 差가 若干있으나 연두금파리(Lucilia illustris MEIGEN)이 第1位를 나타냈고 그 다음은 P. sericata가 第2位를 나타냈으며 第3位로서는 B. peregrina로 딴 種類보다는 顯著하게 그 數量이 많았다(第3表 參照). (5) 특히 陵谷에서의 飛來集合은 漢江을 낀 環境條件의 野外라 그런지 他地域보다는 그 數量이 比較的 적었다.

Direct sequencing for comprehensive screening of LDLR genetic polymorphisms among five ethnic populations

김정현,정현섭,김령효,신희정,나한성,정면우,신형두 한국유전학회 2015 Genes & Genomics Vol.37 No.3

Low density lipoprotein receptor (LDLR) playsan important role in plasma lipoprotein metabolism andpharmacological responses. Although mutations of LDLRand their functional associations with plasma LDL cholesterolconcentrations have been described, no comprehensivecomparisons of LDLR variants among populationsare established. The aim of this study is to define the distributionof single nucleotide polymorphisms (SNPs) ofLDLR and to discover novel variants across populationgroups. A total of 288 DNAs from 96 Korean, 48 Chinese,48 Japanese, 48 African-American, and 48 European-American subjects were resequenced. A total of 59 SNPs(18 in the coding regions, 37 in the introns, and 4 in the 30-untranslated region) were identified, including eight novelvariants. Polymorphisms of LDLR showed significantlydifferent distributions in comparisons among ethnicpopulation groups (P\0.05, Fisher’s exact test). Moreover,almost all of these differently distributed SNPs werecommon variants. Notably, prevalent variations—rs1003723, rs1799898, rs688, rs5925, rs6413504 in Europeans,nonsynonymous rs11669576 (Ala391Thr) in Africans,and rs14158 in Asians—were observed. In further insilico analyses for the novel SNPs, 2 intronic variants(?17716G[A in the intron 5 and ?38569A[C in theintron 16) were predicted as potential branch point sites foralternative splicing. Although this study is not free fromlimitations such as insufficient sample size and no functionalstudies on the novel SNPs, our findings providessupporting information about LDLR genetic variabilityamong ethnic groups and pharmacogenetics studies forplasma lipoprotein metabolism.

일반연제(포스터) : P-31 ; PCR-Direct Sequencing을 이용한 Lamivudine, Adefovir, Entecavir의 HBV 약제내성 빈도 분석

제은미,이선화,김령효,성혜순 대한임상병리사협회 2010 임상미생물검사학회 발표자료집 Vol.2010 No.-

배경: B형 간염 바이러스(hepatitis B virus, HBV)는 만성 간질환의 주요 원인으로, 우리나라에서는 전체 인구의 약 8%, 전 세계적으로 4억 명 정도가 간염바이러스 보균자로 알려져 있다. 만성B형 간염 치료의 경구용 치료제로 복제를 저해하여 감염력을 약화시키는 라미부딘(lamivudine)이많이 사용되어 왔으나 장기간 복용할 경우 내성바이러스의 출현이 높아 사용에 제한이 있다. 아데포비어(adefovir)는 wild type과 라미부딘 내성 B형 간염 바이러스에 모두 효과적인 약물로 최근에 사용이 증가되고 있다. 또한 초치료로 가장 강력한 항바이러스 제제를 선택해야 하므로 대부분의 가이드라인들은 현재까지 사용 가능한 약제 중 가장 강력한 약제인 엔테카비어(entecavir)를 권장하고 있다. 이에 저자는 HBV 양성 환자를 대상으로 라미부딘(rt80, rt173, rt180, rt181,rt204, rt207)과 아데포비어(rt215, rt236, rt237), 엔테카비어(rt238, rt169, rt184, rt202, rt250)내성과 관련 있는 HBV DNA polymerase 유전자의 돌연변이 빈도를 분석하였다. 방법: (재)네오딘의학연구소에 2010년 1월에서 8월까지 HBV 약제내성 돌연변이 검사가 의뢰된462건의 혈청 검체에서 DNA 추출하고 HBV nested-PCR을 실시한 후, 증폭된 PCR 산물(960bp)을 2% agarose gel에서 전기영동을 하여 확인하였다. 증폭된 PCR 산물은 자동 염기서열분석기를 이용하여 sequencing을 실시한 다음 rt80, rt173, rt180, rt181, rt204, rt207, rt215,rt236, rt237, rt238, rt169, rt184, rt202, rt250 부분의 돌연변이를 조사하고 그 출현 빈도를 구하여 관련성을 보고자 하였다. 결과: 총 462건 중 273건(59.09%)에서 돌연변이가 발견되었다. 전체 돌연변이 중 rtL180M(53.47%)이 가장 많았고, rtM204I(50.18%), rtM204V(34.79%), rtL80I(31.13%), rtV173L(8.79%), rtA181T(4.39%), rtA181V(3.29%), rtV207I(2.19%), 순 이었으며 나머지 rtA238T(1.46%), rtP237H(1.09%), rtN236T(0.73%), rtL180V(0.36%), rtP237T(0.36%)에서는 빈도가 현저히 낮았다. 그리고 rtM204S, rtQ215S, rtN238D, rtI169T, rtT184G, rtS202I, rtM250V 돌연변이는 확인되지 않았다. 돌연변이 중 단일 돌연변이(28.93%)보다 중복 돌연변이(71.06%)의 빈도가 높았으며, 2군데 돌연변이(70.10%), 3군데 돌연변이(28.86%), 4군데 돌연변이(1.03%)로 나타났다. 일반적으로 2~3군데의 돌연변이가 동시에 존재하는 경우가 빈번하게 확인되었다. 고찰: 본 연구에서 1차 약제인 라미부딘 관련 돌연변이가 95.80%, 아데포비어 관련 돌연변이가4.19%인 반면, 엔테카비어 관련 돌연변이는 본 실험에서 확인되지 않았다. 가장 많이 쓰이고 있는 라미부딘 약제 관련 돌연변이가 현저하게 많음을 확인할 수 있었으며 엔테카비어 약제 관련 돌연변이가 나타나지 않는 점으로 미뤄 이 약제에 의한 초치료가 내성면에서 보다 효과적 일 것이라 판단된다. 향후 라미부딘, 아데포비어, 엔테카비어의 약제 내성 관련 돌연변이형과 환자 임상결과의 관련성에 대한 연구가 추가적으로 실시되면 치료 약제의 효율적 선택에 대한 중요한 임상적 참고가 될 것으로 사료된다.

Screening of Genetic Polymorphisms of CYP3A4 and CYP3A5 Genes

이진솔,정현섭,김령효,김지온,김영훈,정명우,한순영,신형두,서두원 대한약리학회 2013 The Korean Journal of Physiology & Pharmacology Vol.17 No.6

Given the CYP3A4 and CYP3A5’s impact on the efficacy of drugs, the genetic backgrounds of individuals and populations are regarded as an important factor to be considered in the prescription of personalized medicine. However, genetic studies with Korean population are relatively scarce compared to those with other populations. In this study, we aimed to identify CYP3A4/5 polymorphisms and compare the genotype distributions among five ethnicities. To identify CYP3A4/5 SNPs, we first performed direct sequencing with 288 DNA samples which consisted of 96 Koreans, 48 European-Americans, 48 African-Americans, 48 Han Chinese, and 48 Japanese. The direct sequencing identified 15 novel SNPs, as well as 42 known polymorphisms. We defined the genotype distributions, and compared the allele frequencies among five ethnicities. The results showed that minor allele frequencies of Korean population were similar with those of the Japanese and Han Chinese populations, whereas there were distinct differences from European-Americans or African-Americans. Among the pharmacogenetic markers, frequencies of CYP3A4*1B (rs2740574) and CYP3A5*3C (rs776742) in Asian groups were different from those in other populations. In addition, minor allele frequency of CYP3A4*18(rs28371759) was the highest in Korean population. Additional in silico analysis predicted that two novel non-synonymous SNPs in CYP3A5 (+27256C>T, P389S and +31546T>G, I488S) could alter protein structure. The frequency distributions of the identified polymorphisms in the present study may contribute to the expansion of pharmacogenetic knowledge.

초록집 : 구연 ; Insulin-Like Growth Factor 2 유전자 다형성과 B형 간염 바이러스 감염 자연 치유와의 관련성

김윤준,윤정환,김정룡,김령효,박병래,신형두,이효석 대한간학회 2005 춘계 학술대회 Vol.11 No.-

P-34 : HCV Genotype 구분을 위한 5`-UTR Region과 Core Region을 이용한 Direct Sequencing의 유용성 사례 보고

성혜순,정성환,박민영,김령효,신은심 대한임상병리사협회 2012 임상미생물검사학회 발표자료집 Vol.2012 No.-

배경: Hepatitis C virus(HCV)는 7개의 major genotype(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7)과 80여종의 subtype으로 구분되며 이 중 1, 4형의 경우 IFN-α치료에 어려움이 있어 간경화 등으로 질환이 심화될 위험성이 높고, 간 이식 후에도 간질환의 발생 빈도가 높은 반면 2, 3형은 IFN-α치료의 예후가 좋은 유전형으로 알려져 있어 임상적으로 HCV 유전형의 구분은 환자 치료에 유용한 자료가 되고 있다. 그러나 현재 HCV 유전형을 구분할 수 있는 여러 검사방법들이 1a형과 1b형, 2a형과 2c형 등과 같이 몇몇 subtype의 명확한 구분에 어려움을 겪고 있어 이에 HCV genome 중 5’-UTR gene과 core gene 두 가지 부위를 이용하여 direct sequencing으로 구분한 사례를 보고하고자 한다. 방법: HCV 5’-UTR region을 이용하여 direct sequencing(ABI 3730, USA)으로 분석한 HCVgenotype에서 subtype의 결과가 1a/1b로 판정된 세 건의 임상 검체에 대하여 HCV core region을 이용한 direct sequencing으로 분석하여 확인하였다. RT-PCR은 각각의 region에 특이적인 primer를 이용하여 nested RT-PCR을 수행하고 증폭산물을 대상으로 direct sequencing하여 genotype 판정은 HCV sequence database와 NCBI database를 이용하였다. 결과: 실험에 사용한 세 건의 검체 중 1건에서는 5’-UTR gene에서 1a/1b로 core gene에서도 1a/1b의 혼합감염으로 동일하게 분석되었으나 두건의 검체에서 5’-UTR gene에서 1a/1b로 혼합감염으로 분석된 건에서 core gene으로 분석한 결과가 1b 단독 감염으로 분석되어 상이한 결과를 보였다. 고찰: 최근 HCV genotype에 대한 연구가 활발히 진행되면서 계속해서 새로운 subtype이 구분되고 있다. HCV genotype이 C형 간염 환자의 치료에 사용하는 약제와 높은 연관성이 있는 만큼 그 정확한 genotye의 구분이 필요한 상황이며, 이에 정확한 genotype 구분이 어려운 case에서는 5’-UTR region 과 core region의 혼용 등 여러 가지 target 부위로 검증하는 것이 유용한 자료가 되리라 사료된다.

춘계학술대회 : 구연 ; Insulin-Like Growth Factor 2 유전자 다형성과 B형 간염 바이러스 감염 자연 치유와의 관련성

김윤준,윤정환,김정룡,김령효,박병래,신형두,이효석 대한간학회 2005 Clinical and Molecular Hepatology(대한간학회지) Vol.11 No.3(S)

배경/목적: 인체가 B형 간염 바이러스(HBV)의 감염에서 회복되는 기전은 감염된 간세포에 대한 세포 매개성 면역반응에 의한 것으로 추정되어 왔다. Insulinlike growth factor (IGF) II는 T 림프구의 증식에 중요한 역할을 하는 것으로 알려졌다. 이에 본 연구에서는 HBV 감염으로부터의 회복에 cytotoxic T 림프구에 의한 감염된 간세포의 파괴와 제거가 중요하다는 점에 착안하여 IGFII 생성에 영향을 줄 수 있는 유전자 다