Cis-acting Replication Element Variation of the Foot-and-mouth Disease Virus is Associated with the Determination of Host Susceptibility

Hyo Rin Kang(강효린),Mi So Seong(성미소),Bok Kyung Ku(구복경),JaeHun Cheong(정재훈) 한국생명과학회 2020 생명과학회지 Vol.30 No.11

구제역바이러스(FMDV)는 피코나바이러스 과에 속하는 바이러스로서 야생과 가축화된 소와 돼지에 감염된다. FMDV는 제어되기 어려워서 가축의 생산과 국제통상에 큰 장애가 되고 있다. FMDV RNA 게놈의 복제 과정에서 3D 중합효소가 특이적인 복제 기능을 담당하는데 게놈에 결합하는 부위가 매우 중요하다. 이 사실은 FMDV 게놈의 비코딩영역 내에서 3D 중합효소에 의해 인지되는 특이 RNA 구조가 관여함을 제시한다. 이 과정에서 cis-acting replication element (CRE)는 RNA 복제를 위한 개시에 필요하다. FMDV CRE는 15-17 뉴클레오티드의 고리와 이를 지지하는 이중가닥으로 형성된 줄기-고리 모양을 가지며 이들을 구성하는 RNA 뉴클레오티드 서열의 차이가 다른 RNA 이차구조를 생성한다. CRE 이외에 FMDV 복제를 위해서 많은 바이러스와 세포 인자들이 단백질-단백질 결합과 단백질-RNA 결합을 통해 협조적인 네트워크를 만들어낸다. 이 연구에서 국내에서 2010년부터 2017년 까지 구제역이 발생한 소와 돼지에서 FMDV를 분리하여 CRE 서열을 분석하였으며 이들 FMDV들은 A형과 O형의 유전자형을 가졌다. 흥미롭게 국내 FMDV들의 CRE RNA 이차구조의 변이들은 바이러스 간의 계통유전학적 상관관련성과 일치하며 특정 숙주 동물종의 FMDV 감염의 특이성을 밝혀주었다. 이를 토대로 국내 FMDV의 각 유전군의 분류는 독특한 기능적 CRE에 의해 특징지을 수 있으며 새로운 유전적 계통의 진화학적 연속성은 특징있는 CRE 모티프의 구분과 연관지을 수 있다. 그러므로 CRE의 특이적 RNA 구조는 숙주 동물종 의존적인 FMDV 부류의 부가적인 단서로 활용할 수 있음을 제안한다. 이들 연구 결과들은 향후 FMDV 대량감염이 발생할때 숙주동물종의 특이성을 CRE 서열로 조기에 정확히 분석하는데 도움이 될 것이다. The foot-and-mouth disease virus (FMDV), a member of the Aphthovirus genus in the Picornaviridae family, affects wild and domesticated ruminants and pigs. During replication of the FMDV RNA (ribonucleic acid) genome, FMDV-encoding RNA polymerase 3D acts in a highly location-specific manner. This suggests that specific RNA structures recognized by 3D polymerase within non-coding regions of the FMDV genome assist with binding during replication. One such region is the cis-acting replication element (CRE), which functions as a template for RNA replication. The FMDV CRE adopts a stem-loop conformation with an extended duplex stem, supporting a novel 15-17 nucleotide loop that derives stability from base-stacking interactions, with the exact RNA nucleotide sequence of the CRE producing different RNA secondary structures. Here, we show that CRE sequences of FMDVs isolated in Korea from 2010 to 2017 exhibit A and O genotypes. Interestingly, variations in the RNA secondary structure of the Korean FMDVs are consistent with the phylogenetic relationships between these viruses and reveal the specificity of FMDV infections for particular host species. Therefore, we conclude that each genetic clade of Korean FMDV is characterized by a unique functional CRE and that the evolutionary success of new genetic lineages may be associated with the invention of a novel CRE motif. Therefore, we propose that the specific RNA structure of a CRE is an additional criterion for FMDV classification dependent on the host species. These findings will help correctly analyze CRE sequences and indicate the specificity of host species for future FMDV epidemics.

ELSEVIER : Simultaneous determination of puerarin and its active metabolite in human plasma by UPLC-MS/MS: Application to a pharmacokinetic study

( Hyo Rin Jung ),( Sook Jin Kim ),( Seong Ho Ham ),( Jung Hee Cho ),( Yong Bok Lee ),( Hea Young Cho ) 전남대학교 약품개발연구소 2014 약품개발연구지 Vol.23 No.-

A rapid. selective and sensitive ultra-performance liquid chromatography (UPLC)-tandem mass spectrometry method about the simultaneous determination of puerarin and its major active metabolite. daidzein, in human plasma was developed and validated in order to investigate the pharmacokinetics (PKs) of Gegen after the usual oral dose administration to human. Chromatography was carried out on a Kinetex C18 column (2.1 mm x 50 mm. 1.7 11m) using 0.05% acetic acid in water and 0.05% acetic acid in methanol as mobile phase with a gradient elution. Liquid-liquid extraction with ethyl acetate in acidic condition could remove the interference and minimize the matrix effect of human plasma. The lower limit of quantification in human plasma was 0.2 ng/mL for both of compounds. puerarin and daidzein. The calibration curves for puerarin and daidzein in human plasma were linear over all the concentration range of 0.2-1 00 ng/mL with correlation coefficients greater than 0.998. This assay procedure was successfully applied to the PKs of puerarin and daidzein. after the usual oral dose of Gegen extract powder (2.56 g. containing 9.984 mg puerarin) in human subjects. ⓒ2014 Published by Elsevier B.V.

Development of Fenoxasulfone Residue Analysis Methods in Agricultural Products using high Performance Liquid Chromatography

Hyo-Rin Kim,Hye Young Kwon,Su Myeong Hong,Dan Bi Kim,Hyo Sub Lee,Byeong Chul Moon 한국농약과학회 2016 한국농약과학회 학술발표대회 논문집 Vol.2016 No.10

산수유의 Prebiotics 특성 및 Lipopolysaccharide로 유도된 장 상피세포 보호 효과

이효림(Hyo Lim Lee),이욱(Uk Lee),박선경(Seon Kyeong Park),강진용(Jin Yong Kang),김종민(Jong Min Kim),김길한(Gil Han Kim),김민지(Min Ji Kim),문종현(Jong Hyun Moon),정혜린(Hye Rin Jeong),박효원(Hyo Won Park),허호진(Ho Jin Heo) 한국식품영양과학회 2021 한국식품영양과학회지 Vol.50 No.5

본 연구에서는 산수유(Corni fructus)의 유익균 증식에 대한 prebiotics로서의 활용 가능성과 LPS로 유도되는 세포독성에 대한 장 상피세포 보호 효과 및 주요 생리활성 물질을 분석하였다. 2% 산수유 물 추출물은 양성대조군인 2% fructo-oligosaccharide보다 L. reuteri 및 L. brevis의 적정산도 및 생육에 도움을 주었으며 특히 L. reuteri의 아세트산 생성을 증가시켰다. 그리고 산수유 물 추출물은 LPS로 유도된 장 상피세포(HT-29 cells) 독성에 대한 보호 효과와 산화적 스트레스를 감소시켜 주었으며, TLR4와 NF-κB의 발현을 효과적으로 저해하고 밀착연접 단백질의 발현은 증가시켜 주었다. HPLC 분석 결과 산수유 물 추출물의 생리활성물질은 morroniside와 loganin으로 확인되었다. 결과적으로 산수유는 유익균 증식과 LPS로 유도되는 세포 손상 및 장 질환 예방 소재로서의 활용 가치가 있을 것으로 판단된다. 하지만 산수유에 존재할 수 있는 미량의 페놀성 화합물동정 및 prebiotics 소재에 대한 평가로서 동물모델 상에서의 추가적인 연구가 필요할 것으로 판단된다. To evaluate the prebiotic effect of water extract from Corni fructus (WCF), we measured the growth curves, titratable acidity and short-chain fatty acid (SCFAs) contents in Lactobacillus reuteri (L. reuteri) and Lactobacillus brevis strains. After 24 h incubation, growth curve of the WCF-treated L. reuteri strain showed a relatively higher viable count and titratable acidity, as compared to the fructo-oligosaccharide (FOS)-treated strain (positive control). Considering that SCFA contents are useful metabolites for gut health, our results revealed higher contents of acetate in the WCF-treated strain (1,235.98±62.71 mM) than the FOS-treated strain (763.57±5.38 mM) of L. reuteri. DCF-DA [intracellular reactive oxygen species (ROS) content] and MTT assays [cell viability on lipopolysaccharide (LPS)-induced cytotoxicity] were applied in human colon epithelial HT-29 cells to determine the cell protective effect of the WCF. The results indicate that WCF effectively decreases the intracellular ROS contents and increases cell viability in LPS-induced HT-29 cells. To confirm the inhibitory effect of WCF on LPS-induced inflammation, we examined the expression levels of toll-like receptor 4 (TLR4) and nuclear factor-ĸB (NF-κB). Regulation of the LPS-induced inflammatory reaction by WCF was achieved by decreasing the expressions of TLR4 and NF-ĸB in HT-29 cells. Exposure to WCF also inhibited the cell permeability injury, as determined by increased expressions of tight junction proteins (occludin and claudin-1) in LPS-induced HT-29 cells, indicating the anti-inflammatory effect of WCF. Finally, morroniside and loganin, the major compound iridoid glycosides in the WCF, were analyzed by high-performance liquid chromatography. Taken together, our results indicate that Corni fructus is a potentially good natural source as a prebiotic to prevent intestinal dysfunction.

구제역바이러스의 FMDV 2C 단백질은 소포체 스트레스를 통해서 염증 유도 사이토카인 TNFα의 발현을 증가시킴

강효린(Hyo Rin Kang),성미소(Mi So Seong),나진주(Jin Ju Nah),류소연(Soyoon Ryoo),구복경(Bok Kyung Ku),정재훈(JaeHun Cheong) 한국생명과학회 2020 생명과학회지 Vol.30 No.3

구제역바이러스(FMDV)는 Picornaviridae 과의 Aphthovirus 속의 한 종류이며, 야생과 가축의 소와 돼지에 감염한다. FMDV는 감염 조직에서 중증의 염증반응을 포함한 다양한 임상적 증후들을 일으킨다. FMDV 게놈 RNA는 약 8.3 kb 길이의 양성-단일 가닥을 가지고 있으며, 하나의 긴 단백질 번역틀(ORF)을 만든다. 이 ORF는 바이러스의 단백질가수분해효소에 의해서 구조단백질과 비구조단백질로 나누어진다. FMDV의 FMDV 2C 단백질은 FMDV 유전자에서 만들어지는 비구조단백질로서 염증과 세포사를 포함한 FMD 병리 과정과 바이러스 복제에서 중요한 역할을 한다. 이 연구에서 우리는 FMDV 2C가 염증 유도 사이토카인인 tumor necrosis factor alpha (TNFα)의 세포내 발현을 유도하는 가능성을 검토하였다. FMDV 2C의 돼지 세포인 IBRS-2 세포내 발현은 TNFα의 유전자 발현 조절 부위인 프로모터의 활성화를 이용하여 전사수준에서 TNFα의 mRNA와 단백질 생성을 증가시켰다. 추가적으로, 소포체 스트레스를 감소시키는 화학물질인 4-phenylbutyric acid (4-PBA) 처리는 FMDV 2C에 의해 유도된 TNFα 발현을 감소시켰다. 소포체 스트레스 반응을 매개하는 전사인자의 한 종류인 ATF4는 TNFα 프로모터의 활성을 유도하고, TNFα의 mRNA와 단백질 발현을 증가시켰다. 하지만, ATF4의 기능 결핍 돌연변이체 단백질의 발현은 FMDV 2C에 의한 TNFα 생성을 유도하지 못하였다. 이들 결과들은 FMDV FMDV 2C 단백질이 ATF4-매개 TNFα 발현을 통해 임상적 염증반응을 증가시키고, 이는 소포체 스트레스의 유도와 연관되어있음을 제시한다. Foot-and-mouth disease virus (FMDV), a member of the genus Aphthovirus in the Picornaviridae family, affects wild and domesticated ruminants and pigs. FMDV causes various clinical symptoms, including severe inflammation in infected tissue. Genome RNA of FMDV shows a positive single-strand chain approximately 8.3 kb long and encodes a single long open reading frame (ORF). The ORF is translated into structural and non-structural proteins by viral proteases. The FMDV 2C protein is one of the non-structural proteins encoded by FMDV and plays a critical role in FMD pathogenesis, including inflammation, apoptosis, and viral replication. In this study, we examined whether FMDV 2C induces intracellular expression of pro-inflammatory cytokine tumor necrosis factor alpha (TNFα). FMDV 2C expression in pig IBRS-2 cells increased mRNA and protein expression of TNFα at the transcriptional level via activation of TNFα promoter. Treatment with 4-phenylbutyric acid, an endoplasmic reticulum (ER) stress reducer, decreased TNFα expression induced by FMDV 2C. Activating transcription factor 4 (ATF4), a transcription factor mediating ER stress response, induced transactivation of TNFα promoter and expression of mRNA and protein of TNFα. However, the dominant negative mutant of ATF4 did not induce FMDV 2C–mediated TNFα expression. The results indicate that FMDV 2C protein increases clinical inflammation via ATF4-mediated TNFα expression and is associated with ER stress induction.

The Effects of Closed Kinetic Chain Exercise and Open Kinetic Chain Exercise on the Knee Position Sense in the Normal Adults

Ga Rin Lim,Eun Hwa Kwon,Dong Sung Kim,Jung Hyo Kim,Jin Park,Eun Hee Choi,Sik Hyun Kim 국제물리치료학회 2010 Journal of International Academy of Physical Ther Vol.1 No.2

The purpose of this study is to investigate the effects of closed and open kinetic chain exercise for increasing knee joint function on the knee position sense in the normal adults. Thirty normal adults(male 15, female 15; mean age: 22.13±2.58 years) were participated in this study into two groups, each with 15 people. The group I was trained that closed kinetic chain exercise on the knee joint and the group II was trained that open kinetic chain exercise on the knee joint. Exercise programs performed for 4 weeks, 3 times a week were using Shuttle 2000-1 closed kinetic chain exercise and Knee Extensor open kinetic chain exercise(HUR, Filand). The results of this study were as follows: 1) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 0-20。were found between before and after training in closed kinetic chain exercise(p<.05). 2) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 21-40。were found between before and after training in closed kinetic chain exercise(p<.05). 3) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 41-60。were found between before and after training in closed kinetic chain exercise(p<.05). 4) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 0- 20。were found between before and after training in open kinetic chain exercise(p<.05). 5) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 21-40。were found between before and after training in open kinetic chain exercise(p<.05). 6) There were statistically significant decreasing of measuring error degree in 41- 60。were found between before and after training in open kinetic chain exercise(p<.05). In conclusion, these results suggest that closed and open kinetic chain exercise has increased in the knee joint proprioception between before and after training. Especially, closed kinetic chain exercise could be more useful intervention than open kinetic chain exercise for increasing proprioceptive sense.

Multi-residue Analysis Method of Pesticides in Organic Agro-Materials

Hye-Rin Jeong,Se-Yeon Kwak,Aniruddha Sarker,Hyo-Jeong Kim,Ae-Ji Nam,Sang-Hyeob Lee,Hyeon-Jeong Cho,Hyo-Young Kim,Dong-Ho Kim,Jang-Eok Kim 한국농약과학회 2019 한국농약과학회 학술발표대회 논문집 Vol.2019 No.4

Multi-residue Analysis of 113 Pesticides in Organic Materials

Hye-Rin Jeong,Se-Yeon Kwak,Aniruddha Sarker,Sung-Chan Cho,Hyo-Jeong Kim,Sang-Hyeob Lee,Hyeon-Jeong Cho,Hyo-Young Kim,Dong-Ho Kim,Jang-Eok Kim 한국농약과학회 2018 한국농약과학회 학술발표대회 논문집 Vol.2018 No.10

집단소송제도 도입에 관하여: 식·의약 분야의 소비자 피해구제 방안을 중심으로

한효린(Han, Hyo-Rin) 경희대학교 경희법학연구소 2019 KHU 글로벌 기업법무 리뷰 Vol.12 No.1

유럽 등에서 문제가 된 살충제 계란문제가 국내로까지 이어진 그 당시, 어떻게 대응하였는가. 그 책임의 소재를 서로 회피하기 바빴고, 정부 각 부처마다 협의되지 않은 말들을 표명함에 따라 소비자의 심리적 불안은 더욱 가중되었다. 그런데도 실제 피해를 받은 소비자를 구제하는 제도들도 미비한 것이 현실이다. 특히 현재 시행 중에 있는 소비자단체소송의 경우 소송의 자격을 갖춘 주체의 범위가 지나치게 좁은 점, 공익성을 요하는 점 및 손해배상이 아닌 권익침해를 중지하거나 금지하는데 그친다는 점에서 궁극적으로 소비자에게 실효성 있는 구제책이라 보기 어렵다. 특히 식품사고가 있는 경우 소비자단체소송으로 분쟁을 해결할 수 있는 기회는 더욱 줄어든다. 또한 우리나라에서 존재하는 집단소송법은 증권분야에 한정된 형태라는 점에서 식의약 분야에는 적용될 여지가 없고, 비록 민법과 제조물책임법 상 식품소비자 피해에 대한 구제수단이 존재하나 식품 안정성으로 인한 대부분의 피해는 소액이나 다수의 피해라는 점, 식품에 대한 안전성 등의 결여로 인해 실질적인 손해가 발생하였다는 점을 소비자가 직접 증명하기 곤란한 점에서 실질적인 손해배상을 받기 어렵다. 이러한 점에서 식품사고가 발생한 경우 피해를 구제할 수 있는 집단소송제도의 도입이 필요하다고 할 것이다. 20대 국회에서 계류 중에 있는 집단소송 관련 법안은 총 6개이다. 그 중 대표적인 법안으로 박영선의원안 및 서용교의원안을 꼽을 수 있는데, 박영선의원안(집단소송법안), 서영교의원안(소비자집단소송법안)은 집단소송이 적용될 수 있는 구체적 범위에 대해 차이가 있으나 미국식의 집단소송 형태를 띠고 있다는 점에서 유사한 측면이 있다. 즉, 양 법안 모두 원고적격에 있어서 대표당사자형 모델이며, 피해자의 소송참여방법은 재외신고(opt-out)형 모델을 채택한 것으로 보인다. 생각건대 궁극적으로 소비자의 이익보호를 보다 강화한다는 취지에서 미국식의 집단소송을 도입하는 것이 바람직해 보인다. 즉, 피해자가 누구라도 전체 피해자 집단의 이익을 보호하기 위한 집단소송을 제기할 수 있도록 하고, 특별히 이 집단소송에서 제외를 신청하지 않는 한 집단소송의 결과에 구속되며, 피해구제를 받을 수 있도록 하는 것이 타당할 것이다. 이런 관점에서 집단소송제도가 하루 빨리 도입되고, 이후 예측가능하고 통일된 기준을 바탕으로 원활히 잘 운영된다면 국내의 소비자 영역은 한 층 더 높은 발전을 이룩할 것이다. How did you respond to the problem of insecticide egg problems in Europe and other countries? The psychological uneasiness of the consumers became more and more intense as the government tried to avoid the responsibility of each other and expressed the uncommon words of each ministry. Nevertheless, it is a reality that there are not enough systems to relieve consumers who have actually suffered damage. In particular, in the case of a consumer group litigation that is currently being implemented, the range of subjects eligible for litigation is too narrow, the public interest is required, and only the suspension or prohibition of infringement of rights, It is hard to see it as a remedy. Particularly in the case of food accidents, opportunities for solving disputes through consumer group litigation are further reduced In addition, since the Class Action Law existing in Korea is limited to the securities sector, there is no scope for the food and drug field. Even though the Civil Law and the Product liability Act provide remedies for damage to food consumers, It is difficult to obtain actual damages in the point that it is difficult for the consumer to directly prove that the actual damage is caused by the lack of safety of the food, etc. (causality). In this respect, it is necessary to introduce a class action system that can relieve damage in the event of a food accident. There are a total of six class action laws pending in the 20th National Assembly. As a representative measure, Park Young-sun s original bill and Seo Yong-kyo s original bill are the original bill. Park Young-sun s original bill (class action bill) and Seo Young-kyo s original bill (consumer class action bill) There is a similar aspect in that it has a form of class action. In other words, both of these laws are the representative party type models in the plaintiffs right, and the victim s method of participating in litigation seems to adopt the opt-out model. I think it would be desirable to introduce a US class action lawsuit to ultimately enhance the protection of consumers interests. That is, the victim should be able to file a class action to protect the interests of the entire victim group, and be bound by the outcome of the class action unless specifically requested for exclusion from the class action, It would be reasonable. From this point of view, if the class action system is introduced sooner and then operates smoothly on the basis of predictable and unified standards, the domestic consumer sector will achieve further development.

호중구감소증 발열 기간동안 합병된 경험적항균요법의 범위를 벗어난 장알균 소장결장염

김효린,정철호,김태형,이은정,김효진,문인기,문종주,문지윤,박가영,추은주,전민혁 순천향대학교 의학연구소 2009 Journal of Soonchunhyang Medical Science Vol.14 No.3S

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