에너지 효율성을 위한 선택적 Sensing Query 메커니즘

박수권 ( Soo-kwon Park ),박노열 ( No-yeoul Park ),김창화 ( Chang-hwa Kim ) 한국정보처리학회 2011 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.18 No.2

센서 네트워크의 가장 큰 이슈는 센서노드들의 제한된 에너지를 효율적으로 관리하여, 센서노드의 Lifetime을 연장하는데 있다. 센서 네트워크에서 가장 큰 에너지 손실 부분은 RF통신 부분이라 할 수 있다. 본 논문은 질의응답에 참여할 센서 노드를 선별적으로 구성함으로써, 질의응답에 참여하지 않는 센서노드들의 에너지를 관리하고자 한다. 또한 참여노드의 선별적 구성에 대한 신뢰도를 향상시키기 위해 클러스터에 존재하는 센서 노드들 간의 신뢰비율을 선택 메커니즘에 포함시키고자 한다.

Generation of Transgenic Rice without Antibiotic Selection Marker through Agrobacterium-mediated Co-transformation System

Soo-Kwon Park(박수권),Tackmin Kwon(권택민),Jong-Hee Lee(이종희),DongJin Shin(신동진),Woon-Ha Hwang(황운하),You-Chun Song(송유천),Jun-Hyun Cho(조준현),Min-Hee Nam(남민희),Seung-Ho Jeon(전승호),Sang-Yeol Lee(이상열),Dong-Soo Park(박동 한국생명과학회 2012 생명과학회지 Vol.22 No.9

작물의 수확량이나 병 저항성을 증가시키는 형질전환 식물체 개발은 세계 식량 부족을 해결하는 좋은 방법이다. 하지만 항생제나 제초제의 사용은 형질전환 작물의 안전에 대해서 일반 사람들의 심각한 우려를 초래한다. 본 연구에서는, 아그로박테리움을 이용한 동시 형질전환 방법을 이용하여 한국의 밀 재배종인 ‘조경밀’의 유전자인, 고분자 글루테닌 서브유닛[high molecular-weight glutenin subunit (HMW-GS)] Dx5가 삽입된 마커프리 형질전환벼를 개발하였다. 각각 Dx5 유전자와 하이그로마이신(HPTII) 저항성 유전자만으로 구성된 두 종류의 발현 카셋트(Two expression cassettes)를 독립적으로 아그로박테리움 EHA105에 도입하였고, Dx5와 HPTII가 도입된 각각의 EHA105 아그로박테리움을 3:1 비율로 혼합하여 벼 캘러스에 접종하였다. 66개의 HPTII 저항성 형질전환체 중에서 벼 게놈에 Dx5와 HPTII가 모두 삽입된 2개의 형질전환 라인을 획득하였다. Dx5와 HPTII가 벼 게놈에 도입된 것을 Southern blot을 통해서 다시 확인하였다. 또한, semi-quantitative RT-PCR을 통해 형질전환벼 T1 세대 종자의 밀 Dx5 전사여부를 확인하였고 결국, Dx5 유전자만을 가지는 마커프리 형질전환벼를 T1 세대에서 선발할 수 있었다. 본 연구 결과는 두 종류의 발현 카셋트를 사용한 아그로박테리움 동시 접종 시스템이 마커프리 형질전환벼를 생산하기 위한 효과적인 전략이 될 수 있음을 보여준다. Development of transgenic plant increasing crop yield or disease resistance is good way to solve the world food shortage. However, the persistence of marker genes in crops leads to serious public concerns about the safety of transgenic crops. In the present paper, we developed marker-free transgenic rice inserted high molecular-weight glutenin subunit (HMW-GS) gene (Dx5) from the Korean wheat cultivar ‘Jokyeong’ using Agrobacterium-mediated co-transformation method. Two expression cassettes comprised of separate DNA fragments containing only the Dx5 and hygromycin resistance (HPTII) genes were introduced separately into Agrobacterium tumefaciens EHA105 strain for co-infection. Each EHA105 strain harboring Dx5 or HPTII was infected into rice calli at a 3: 1 ratio of EHA105 with Dx5 gene and EHA105 with HPTII gene expressing cassette. Then, among 66 hygromycin-resistant transformants, we obtained two transgenic lines inserted with both the Dx5 and HPTII genes into the rice genome. We reconfirmed integration of the Dx5 and HPTII genes into the rice genome by Southern blot analysis. Wheat Dx5 transcripts in T1 rice seeds were examined with semi-quantitative RT-PCR. Finally, the marker-free plants containing only the Dx5 gene were successfully screened at the T1 generation. These results show that a co-infection system with two expression cassettes could be an efficient strategy to generate marker-free transgenic rice plants.

Development of Marker-free Transgenic Rice for Increasing Bread-making Quality using Wheat High Molecular Weight Glutenin Subunits (HMW-GS) Gene

Soo-Kwon Park(박수권),DongJin Shin(신동진),Woon-Ha Hwang(황운하),Se-Yun Oh(오세윤),Jun-Hyun Cho(조준현),Sang-Ik Han(한상익),Min-Hee Nam(남민희),Dong-Soo Park(박동수) 한국생명과학회 2013 생명과학회지 Vol.23 No.11

고분자 글루테닌 서버유닛(high molecular-weight glutenin subunit, HMW-GS)은 밀의 가공적성을 결정하는데 중요한 역할을 수행한다. 우리는 Agrobacterium 동시 형질전환법을 이용하여 한국 밀 품종인 ‘조경’으로부터 밀 HMW-GS을 암호화하는 Glu-1Bx7 유전자를 가지는 marker-free 형질전환 벼를 생산하였다. Glu-1Bx7 유전자의 종자 특이적 발현을 위하여 밀 Glu-1Bx7 유전자 자체 프로모터를 벡터 내에 삽입하였다. 동시 접종을 위해서 오직 Glu-1Bx7 유전자와 hygromycin phosphotransferase II (HPTII) 저항성 유전자만으로 구성된 두 종류의 발현 카셋트를 독립적으로 Agrobacterium EHA105에 도입하였고, Glu-1Bx7와 HPTII가 도입된 각각의 EHA105 Agrobacterium을 3:1 비율로 혼합하여 벼 캘러스에 접종하였다. 216개의 HPTII 저항성 형질전환체 중에서 벼 게놈에 Glu-1Bx7과 HPTII가 모두 삽입된 24개의 형질전환 라인을 획득하였다. Glu-1Bx7와 HPTII가 벼 게놈에 도입된 것을 Southern blot을 통해서 다시 확인하였다. 형질전환 벼 T₁ 세대의 종자에서 밀 Glu-1Bx7 유전자가 전사와 번역되어 오직 Glu-1Bx7만을 가지는 marker-free 식물체를 T₁ 세대에서 성공적으로 선발할 수 있었다. High-molecular weight glutenin subunits (HMW-GS) have been shown to play a crucial role in determining the processing properties of the wheat grain. We have produced marker-free transgenic rice plants containing a wheat Glu-1Bx7 gene encoding the HMG-GS from the Korean wheat cultivar ‘Jokyeong’ using the Agrobacterium-mediated co-transformation method. The Glu-1Bx7-own promoter was inserted into a binary vector for seed-specific expression of the Glu-1Bx7 gene. Two expression cassettes comprised of separate DNA fragments containing only Glu-1Bx7 and hygromycin phosphotransferase II (HPTII) resistance genes were introduced separately to the Agrobacterium tumefaciens EHA105 strain for co-infection. Each EHA105 strain harboring Glu-1Bx7 or HPTII was infected to rice calli at a 3:1 ratio of Glu-1Bx7 and HPTII, respectively. Then, among 216 hygromycin-resistant T0 plants, we obtained 24 transgenic lines with both Glu-1Bx7 and HPTII genes inserted into the rice genome. We reconfirmed integration of the Glu-1Bx7 gene into the rice genome by Southern blot analysis. Transcripts and proteins of the wheat Glu-1Bx7 were stably expressed in the rice T₁ seeds. Finally, the marker-free plants harboring only the Glu-1Bx7 gene were successfully screened at the T₁ generation.

Development of Marker-free Transgenic Rice Expressing the Wheat Storage Protein, Glu-1Dy10, for Increasing Quality Processing of Bread and Noodles

Soo-Kwon Park(박수권),DongJin Shin(신동진),Woon-Ha Hwang(황운하),Yeon-Jae Hur(허연재),Tae-Heon Kim(김태헌),Se-Yun Oh(오세윤),Jun-Hyun Cho(조준현),Sang-Ik Han(한상익),Seung-Sik Lee(이승식),Min-Hee Nam(남민희),Dong-Soo Park(박동수) 한국생명과학회 2014 생명과학회지 Vol.24 No.6

쌀가루는 많은 식품 가공에 이용된다. 그러나 밀가루 반죽이 빵과 면을 포함한 많은 식품 가공 제품에 적합한 반면에, 쌀로 만든 반죽은 신장성과 탄력성이 부족하다. 고분자 글루테닌 서브유닛(HMW-GS)은 밀의 가공 적성을 결정하는데 중요한 역할을 한다. 본 연구에서, 우리는 아그로박테리움(Agrobacterium) 동시 형질전환법을 이용하여 한국 밀 품종인 ‘조경’으로부터 HMW-GS를 암호화하는 밀 Glu-1Dy10 유전자를 발현하는 marker-free 형질전환 벼 식물체를 개발하였다. 오직 Glu-1Dy10 유전자와 HPTII (hygromycin phosphotransferase II) 저항성 유전자만을 포함하는 분리된 DNA 조각들로 구성된 두 가지 발현 카셋트(cassettes)를 독립적으로 아그로박테리움(Agrobacterium) EHA105 에 도입하였다. Glu-1Dy10 또는 HPTII를 함유하는 EHA105 를 각각 3:1 비율로 벼 캘러스에 접종하였다. 290개의 하이그로마이신(hygromycin) 저항성 T0 식물체 중에서 우리는 벼 게놈에 Glu-1Dy10과 HPTII 유전자가 모두 삽입된 29개의 형질전환 라인을 획득하였다. 우리는 Glu-1Dy10 유전자가 벼 게놈 내로 도입된 것을 Southern blot 분석을 통해 다시 확인하였다. 형질전환 벼 종자에서 Glu-1Dy10의 전사(Transcripts)와 단백질을 semi-quantitative RT-PCR과 Western blot 분석을 통해서 확인하였다. 최종적으로, 오직 Glu-1Dy10 유전자를 갖는 marker-free 식물체를 T1 세대에서 성공적으로 선발할 수 있었다. Rice flour is used in many food products. However, dough made from rice lacks extensibility and elasticity, making it less suitable than wheat for many food products such as bread and noodles. The high-molecular weight glutenin subunits (HMW-GS) of wheat play a crucial role in determining the processing properties of the wheat grain. This paper describes the development of marker-free transgenic rice plants expressing a wheat Glu-Dy10 gene encoding the HMG-GS from the Korean wheat cultivar ‘Jokyeong’ using Agrobacterium-mediated co-transformation. Two expression cassettes, consisting of separate DNA fragments containing Glu-1Dy10 and hygromycin phosphotransferase II (HPTII) resistance genes, were introduced separately into Agrobacterium tumefaciens EHA105 for co-infection. Each EHA105 strain harboring Glu-1Dy10 or HPTII was infected into rice calli at a 3: 1 ratio of Glu-1Bx7 and HPTII. Among 290 hygromycin-resistant T0 plants, we obtained 29 transgenic lines with both the Glu-1Dy10 and HPTII genes inserted into the rice genome. We reconfirmed the integration of the Glu-1Dy10 gene into the rice genome by Southern blot analysis. Transcripts and proteins of the Glu-1Dy10 in transgenic rice seeds were examined by semi-quantitative RT-PCR and Western blot analysis. The marker-free plants containing only the Glu-1Dy10 gene were successfully screened in the T1 generation.

기능성 흑찰거대배아미 조생종 벼 품종 ‘눈큰흑찰’

박동수(Dong-Soo Park),황운하(Un-Ha Hwang),박수권(Soo-Kwon Park),이종희(Jong-Hee Lee),한상익(Sang-Ik Han),조준현(Jun-Hyeon Cho),이지윤(Ji-Yoon Lee),오성환(Seong-Hwan Oh),장기창(Ki-Chang Jang),서우덕(Woo-Duck Seo),신동진(Dong-Jin Shin) 한국육종학회 2015 한국육종학회지 Vol.47 No.1

Nunkeunheugchal (registration No. 01-0001-2014-4), a black waxy giant embryo rice cultivar, was developed by the rice breeding team of National Institute of Crop Science (NICS), RDA in 2012. This cultivar was derived from the cross between get and Josaengheugchal in 2004/2005 winter season, and selected by a promising line, YR25277-B-B-314-2, was selected and designated as the line of Milyang263 in 2009. The local adaptability test of Milyang263 was carried out at four locations from 2010 to 2012 and it was named as Nunkeunheugchal. This variety is a early maturity cultivar. It has 65 cm in culm length and 72 spikelets per panicle, and 1,000 grain-weight of brown rice is 17.8 g which is less than that of Josaengheugchal. This variety is resistant to leaf blast, but susceptible to bacterial blight, neck blast, virus disease and insect pest. The yield potential of Nunkeunheugchal was about 3.54 MT/ha as brown rice at ordinary fertilizer level in local adaptability test for three years. Nunkeunheugchal possesses benefits to rice consumers because of high amounts of GABA, anthocyanin, calcium and iron. This variety would be adaptable to the paddy field of middle and southern plain region of Korea.

연구보문 : 벼 다단선반 육묘시 파종량과 LED 광원이 모 생육에 미치는 영향

박성태 ( Sung Tae Park ),김상열 ( Sang Yeol Kim ),박동수 ( Dong Soo Park ),박수권 ( Soo Kwon Park ),김상민 ( Sang Min Kim ),황운하 ( Woon Ha Hwang ),서우덕 ( Woo Duck Seo ),박창영 ( Chang Young Park ),이기환 ( Gi Hwan Yi ),강항원 한국국제농업개발학회 2010 韓國國際農業開發學會誌 Vol.22 No.4

벼 선반육묘시는 차광으로 모의 연약화와 뜸모 등 생리장애가 일어나기 쉽다. 벼 선반육묘시 건묘 육성 및 안전 육묘일수에 대한 기초자료를 얻고자 파종량별 LED 광원에 따른 파종후 일수별 묘소질 변화 및 뜸묘발생을 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 초장과 엽수는 파종량이 적을수록, 광원별로는 청색광에서 약간 길고 많았으나 처리간에 별차이는 없었다. 2. 건물중은 청색광에서 높았고 적색광과 녹색광에서 낮았는데, 무처리에 비해서는 파종량 120g에서는 청색광에서 높고 적색광과 녹색광에서 낮았다. 170g에서는 청색광에서 높았으나 그 외 광원은 유의차가 없었다. 220g에서는 파종후 25일 이후 적색광에서 짧았고 그 외는 무처리와 유의차가 없었다. 3. 모충실도는 0.729~1.165 mg/cm으로 광원별로는 청색광이 높고 적색광과 녹색광에서 낮았다. 무처리에 비해서는 청색광은 모든 파종량에서 파종 25일 이후 높았고, 적색광과 녹색광은 파종량 120g에서 파종 20일이후 낮았으나, 그 외는 무처리와 유의차가 없었다. 4. 뜸모발생은 청색광과 백색광에서 적었으나 녹색광에서 다소 높았는데, 뜸모는 파종후 15일까지는 발생하지 않았으나, 파종후 20일에는 파종량 120g에서는 녹색광에서 0.8% 발생 하였고 그 외는 발생하지 않았다. 170g 파종에서는 청색광은 발생하지 않았으나 그 외 광원은 0.2~1.3%, 220g 파종에서는 0.4~1.3% 발생하였다. 그리고 파종 25일 및 30일에는 각각 1.2~9.3%, 5.7~30.2%로 급격히 증가하였다. 5. 모충실도와 뜸모발생 등을 종합해 볼 때 다단선반 육묘시 안전 육묘일수는 파종량 120g 및 170g 파종 청색광은 20일, 170g 파종의 그 외 광원과 220g 파종은 15일이내 이었다. Rice seedling raising in shelf apparatus not only saves time but also reduces labor input. However. it sometimes gives weak seedling because of light shading during the seedling growth in shelf. To develop technology for healthy seedling growth in seedling raising shelf, the effect of red, blue, green and white light emitting diodes(LED) on seedling growth of rice(cv. Josaengheugchal) at three seeding rates such as 120g, 170g and 220g/tray was investigated. The plant height and leaf number of rice seedling grown under the different LED lights in the seedling raising shelf was not significantly different from those seedlings grown in the no-LED light treatment. However, dry weight and seedling healthy value of rice in the blue light were higher than red and green light supplements. The blue light treatment gave higher dry weight and seedling health in blue light treatment than the no-LED light treatment in 120g and 170g seeding rates. Based on the seeding rates, dry matter and seedling healthy value were higher in 120g/tray seeding rate than the 170g and 220g seeding rates. Occurrence of physiological disorder on rice seedling in blue LED supplement was also lower than that of red and green LED treatments. The physiological disorder did not occurred until 15 days after seeding at three seeding rates but it increased sharply from 20 days after seeding. Based on seedling quality and occurrence of physiological disorder, the critical seedling growth duration was found 20 day in 120g and 170g seeding rate with blue LED light but 15 day in 220g seeding rate for healthy seedling growth under seedling raising shelf condition.

유전 알고리즘 기반의 서포트 벡터 회귀를 이용한 소프트웨어 비용산정

권기태,박수권,Kwon, Ki-Tae,Park, Soo-Kwon 한국정보처리학회 2009 정보처리학회논문지D Vol.16 No.5

소프트웨어 공학에서 정확한 개발 비용 예측은 성공적인 개발 프로젝트를 위한 필수적인 요소로, 현재까지 많은 소프트웨어 비용산정을 위한 모델들이 개발되어 왔다. 전통적인 통계적 기법부터 기계학습을 적용한 알고리즘까지 다양한 분야의 아이디어를 접목하고 있다. 본 논문에서는 소프트웨어 개발 비용 예측을 위한 방법으로 유전 알고리즘과 서포트 벡터 머신의 회귀모델인 서포트 벡터 회귀를 결합한 GA-SVR 모델을 제안한다. 제안된 모델은 기존의 연구에 비해 향상된 결과를 보이고 있다. The accurate estimation of software development cost is important to a successful development in software engineering. Until recent days, the model using regression analysis based on statistical algorithm and machine learning method have been used. However, this paper estimates the software cost using support vector regression, a sort of machine learning technique. Also, it finds the best set of optimized parameters applying genetic algorithm. The proposed GA-SVR model outperform some recent results reported in the literature.

Functional Screening of Plant Genes Suppressed Salt Sensitive Phenotype of Calcineurin Deficient Mutant through Yeast Complementation Analysis

Seok-Jun Moon(문석준),Soo-Kwon Park(박수권),Un-Ha Hwang(황운하),Jong-Hee Lee(이종희),Sang-Ik Han(한상익),Min-Hee Nam(남민희),Dong-Soo Park(박동수),Dongjin Shin(신동진) 한국생명과학회 2013 생명과학회지 Vol.23 No.1

작물의 생산성 증가를 위해 염해 저항성 메커니즘을 이해하는 것이 중요하다. 식물의 염해 저항성에 관련된 유전자를 확보하기 위한 여러 가지의 선별방법이 개발되었다. 본 논문에서는 애기장대의 cDNA 라이브리를 염해 감수성 효모인 cnb 돌연변이체에 삽입하여 염해 감수성 표현형을 회복하는 콜로니를 선발하였다. 이 선별방법을 통하여 34종의 cnb 돌연변이체의 염해 감수성을 회복하는 콜로니를 선별하였으며, 염기서열분석을 통하여 CaS와 AtSUMO1, AtHB-12 등 9종의 유전자임을 확인하였다. 이들 유전자 중 CaS의 발현이 염해 저항성을 증가시키는 것과 염해 처리에 의해 CaS의 유전자의 발현이 증가되는 것을 확인하였다. CaS 발현억제 형질전환체는 100 mM 염처리에 의하여 뿌리생장이 저해되었다. 또한 150 mM 염처리에 의하여 CaS 발현억제 형질전환체의 잎에서 백화현상을 나타내었다. 이러한 결과를 통하여 CaS 유전자가 효모와 식물에서 염해 저항성에 중요한 유전자임을 증명하였다. Understanding salt tolerance mechanisms is important for the increase of crop yields, and so, several screening approaches were developed to identify plant genes which are involved in salt tolerance of plants. Here, we transformed the Arabidopsis cDNA library into a salt-sensitive calcineurin (CaN)-deficient (cnbΔ) yeast mutant and isolated the colonies which can suppress salt-sensitive phenotype of cnbΔ mutant. Through this functional complementation screen, a total of 34 colonies functionally suppressed the salt-sensitive phenotype of cnbΔ yeast cells, and sequencing analysis revealed that these are 9 genes, including CaS, AtSUMO1and AtHB-12. Among these genes, the ectopic expression of CaSgene increased salt tolerance in yeast, and CaStranscript was up-regulated under high salinity conditions. CaS-antisense transgenic plants showed reduced root elongation under 100 mM NaCl treatment compared to the wild type plant, which survived under 150 mM NaCl treatment, whereas CaS-antisense transgenic plant leaves turned yellow under 150 mM NaCl treatment. These results indicate that the expression of CaS gene is important for stress tolerance in yeast and plants.

고단백 내탈립 장류용 콩 품종 ‘하이프로’

김지민(Ji-Min Kim),신일섭(Ilseob Shin),박수권(Soo-Kwon Park),최만수(Man Soo Choi),이정동(Jeong-Dong Lee),하보근(Bo-Keun Ha),이주석(Juseok Lee),강양제(Yang Jae Kang),정순천(Soon-Chun Jeong),문중경(Jung-Kyung Moon),강성택(Sungteag Kang 한국육종학회 2021 한국육종학회지 Vol.53 No.1

A yellow soybean cultivar called ‘Hipro’ was developed using the single seed descent (SSD) method by crossing ‘Saedanbaek’(SS92414 ×MD87L) and ‘Daepung’ (Baekwon × Sinpaldal2). A preliminary yield trial (PYT), advanced yield trial (AYT), and regional yieldtrial (RYT) were conducted in three regions. ‘Hipro’ has a determinate growth habit, white flowers, and a spherical seed shape. In the regionalyield trial, the flowering and maturity dates of ‘Hipro’ were August 4 and October 17, respectively, and the 100-seed weight was 22.2 g,which was lower than that of Daewon (26 g). Additionally, ‘Hipro’ showed resistance to lodging, soybean mosaic virus (SMV), bacterialblight, and pod shattering. The seed protein content of ‘Hipro’, which was of particular interest in this study, was 53.9%, which was higherthan that of ‘Daepung’ (41.5%), and the total amino acid content without tryptophan was 43.6%, 19% higher than that of ‘Daepung’. Themean yield of ‘Hipro’ in RYT was 2.23 ton/ha, which was 91.3% of the yield of ‘Daewon’. However, ‘Hipro’ showed an 11% higher yieldthan Daewon in Paju. As a result of the tofu characteristic test, Hipro is suitable for making soy milk and tofu due to its high solid content(12.67 Brix) and protein content (13.68%) and high yield (325%) of tofu. Overall, ‘Hipro’ had high protein content, excellent processingquality for tofu and soy milk, and strong resistance to disease and pod shattering that will greatly contribute to the consumption of soybeansin Korea. (Registration No. 7735).

Dual functions in one enzyme: oxidative stress-dependent functional switching from a peroxiredoxin to a molecular chaperone

Sun Yong Lee(이선용),Jong Cheol Kim(김종철),Soo Kwon Park(박수권),Ho Hee Jang(장호희),Young Mi Lee(이영미),Jae Sook Kang(강재숙),Chae Oh Lim(임채오),Sang Yeol Lee(이상열) 한국생물공학회 2005 한국생물공학회 학술대회 Vol.2005 No.10