Microsatellite 표지자를 이용한 고로쇠나무 10개 집단의 유전변이

김회진 ( Hoi Jin Kim ),정지희 ( Ji Hee Jeong ),조아르나 ( Aruna Jo ),김용율 ( Yong Yul Kim ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

고로쇠나무는 유망조림수종 중 하나로 조림을 위한 종자는 대부분 채종임분에서 생산된다. 본 연구에서는 종자공급원의 효율적 관리를 위하여 3개 채종임분을 포함한 고로쇠나무 10개 집단의 유전다양성과 구조를 분석하였다. 8개 microsatellite 표지를 이용하여 확인된 유전자좌당 평균 대립유전자수(Na)는 8.2개 였다. 고로쇠나무의 이형접합도 기대치(He)는 평균 0.684로 관찰치 0.628에 비해 다소높은 수준이었다. 집단간 분화 정도를 나타내는 FST 값은 0.084로 전체 유전변이의 약 8.4%가 집단분화에 기인하는 것으로 나타났다. 위도와 유전다양성간의 상관을 분석한 결과, 이형접합도는 상관이 인정되지 않았지만 대립유전자 다양성은 유의한 상관을 보여(R=0.813, p=0.002), 북쪽에서 남으로 올수록 다양성이 낮아지는 경향을 보였다. 고정계수(F)는 집단에 따라 -0.027에서 0.155 범위의 값을 보였으며 평균은 0.082로 이형접합체가 기대치에 비해 약 8.2% 부족하여 전체적으로 근친교배의 영향을 다소 받고 있는 것으로 추정되었다. 특히, 채종임분 3개 집단의 고정계수가 상대적으로 높아(F, 0.095~0.155) 근친교배의 영향이 큰 편이었다. 반면, 유전다양성(He, 0.712~0.736)은 다른 임분에 비해 상대적으로 풍부한 것으로 나타났다. 즉, 본 연구에서 조사된 고로쇠나무 채종임분 3개 집단은 유전다양성은 풍부한 편이었지만 근친교배의 영향은 상대적으로 큰 것으로 나타났다. 따라서, 유전적으로 우수한 종자 생산을 위해서는 적절한 유전간벌 등 구체적인 채종임분 관리전략 마련이 필요하다고 판단된다. Most of the seeds for forestation of A. pictum subsp. mono, one of promising forestation species, have produced from designated seed production stands. In this study, genetic diversity and structure of 10 populations of A. pictum subsp. mono including 3 seed stands were analyzed for effective management of seed sources. Average number of alleles per locus was 8.2 based on 8 microsatellite loci. Observed(Ho) and expected heterozygosity(He) were 0.628 and 0.684, respectively. The FST value was 0.084, which means 8.4% of total genetic variation is due to genetic differentiation among 10 populations. Allele diversity was significantly correlated with latitude (R=0.813, p=0.002) that means population in northern part of Korea have more genetic diversity than those of southern area. However, observed and expected heterozygosity showed no significant correlation with latitude. The fixation index were ranged from -0.027 to 0.155 with an average of 0.082. Especially, three seed stands of the populations detected relatively high level of inbreeding(F, 0.095~0.155). However the genetic diversities(He, 0.712~0.736) in 3 seed stands were relatively higher than the other populations. In conclusion, three seed stands of A. pictum subsp. mono have relatively abundant genetic diversity but have more influenced by inbreeding. Therefore it needs to prepare a specific management strategy for the seed stands to prevent genetic erosion in seeds produced.

편백 유전분석용 Microsatellite DNA 표지 개발

정지희 ( Ji Hee Jeong ),조아르나 ( Aruna Jo ),김회진 ( Hoi Jin Kim ),김지현 ( Ji Hyeon Kim ),김호방 ( Ho Bang Kim ),김용율 ( Yong Yul Kim ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

편백( Chamaecyparis obtusa)은 일본 원산의 상록교목으로 우리나라의 남부지역에 널리 식재되고 있으며, 최근 편백림이 치유의 숲으로 각광받고 있어 그 수요가 늘고 있다. 본 연구에서는 편백 연구 및 육종에 활용될 microsatellite DNA표지를 개발하였다. 편백 엽시료에서 DNA를 분리하고, Glenn과 Schable(2005)의 방법에 따라 microsatellite enrichment 라이브러리를 작성하였다. 작성된 라이브러리로부터 microsatellite repeat을 가지는 96개 contig 서열(Genebank Acc. No. KF689689-KF689784)을 확보하고 이로부터 총 40개의 primer를 디자인 하였다. 디자인된 primer를 대상으로 편백 20개체의 DNA를 이용하여 재현성 및 다형성 검정 실험을 수행하였고, 그 결과 최종 10개의 primer를 선발하였다. 본 연구에서 개발된 microsatellite 유전자좌는 앞으로 편백의 교배양식, 집단유전 연구 등에 유용하게 활용할 수 있을 것으로 기대된다. Chamaecyparis obtusa, native to Japan, is an evergreen coniferous species and it was intensively planted in southern part of Korea. These days demand for the species is increasing due to the forest of Chamaecyparis obtusa has spotlighted as a healing forest. In this study, microsatellites were isolated and characterized for genetic analysis. DNA was isolated and microsatellite were isolated using the enrichment method described in Glenn and Schable(2005). 96 contig sequence(Genebank Acc. No. KF689689-KF689784) were obtained, and 40 primer pairs were designed from them. Finally, ten primer pairs successfully amplified unambiguous and polymorphic single locus among 20 individuals of C. obtusa. Microsatellite loci developed in this study will be useful in studies of breeding, mating system and population genetics.

굴참나무 6개 채종임분의 유전변이

정지희 ( Ji Hee Jeong ),김회진 ( Hoi Jin Kim ),조아르나 ( Aruna Jo ),김용율 ( Yong Yul Kim ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

굴참나무는 우리나라 주요 조림수종 중 하나로 조림용 종자의 대부분이 채종임분에서 생산된다. 본 연구에서는 채종임분의 효율적 관리를 위하여 6개 채종임분을 대상으로 개체수 및 생장 현황을 조사하고, 6개 Microsatellite DNA 표지를 이용하여 유전적 변이 특성을 분석하였다. 채종임분의 채종목개체수는 면적이 가장 넓은 경남 유평리 집단이 6,738개체로 가장 많았고, 충남 행정리 집단이 250개체로 가장 적었다. 평균 흉고 직경은 집단에 따라 18.8cm(경남 유평리)에서 27cm(충북 사은리) 범위에서 나타났고 6개 집단의 평균은 22.1cm 였다. 6개 Microsatellite 표지를 이용하여 분석된 유전다양성은 대립유전자 수(Na)가 집단에 따라 최소 3.3개(운암리)에서 최대 5.7개(유평리) 관찰되었고, 이형접합도 기대치는 0.497(사은리)에서 0.666(성주리) 사이의 값을 보였다. 전체적으로 면적이 넓고 개체수가 많은 유평리와 성주리 집단에서 유전다양성이 풍부했고, 면적이 좁고 개체수가 적은 운암리, 사은리, 행정리집단의 유전다양성이 낮은 편이었다. 굴참나무 6개 채종임분의 평균 유전다양성은 대립유전자수(Na)평균 4.6개, 이형접합도 관찰치(Ho) 0.642, 이형접합도 기대치(He) 0.571로, 중국의 굴참나무 5개 집단에서 조사된 평균 대립유전자수 8.4, 이형접합도 기대치 0.806 보다 낮은 수치였다(Xu et al., 2004). F-통계량 분석 결과 집단간 분화 정도를 나타내는 FST 값이 0.073으로 전체 유전변이의 약 7.3%가 집단간 분화에 의한 것으로 해석되었다. 이는 중국 굴참나무에서 조사된 0.046보다 다소 높은 편이었다. Quercus variabilis is one of the major afforestation/reforestation oak species in Korea. Most of seeds for the forestation have produced in designated seed stands. In this study, population size, growth status and genetic variation in 6 seed stands of Q. variabilis were investigated for effective management of the seed stands. Number of individuals in each seed stands were ranged from 250(Hangjeong-ri) to 6,738(Yupyeong-ri), and mean DBH were varied between 18.8cm(Yupyeong-ri) to 27cm(Saeun-ri) with an average of 22.1cm across 6 populations. Number of alleles per locus(Na) were ranged from 3.3(Wunam-ri) to 5.7(Yupyeong-ri) and expected heterozygosity(He) were 0.496(Saeun-ri) to 0.666(Seongju-ri) based on 6 microsatellite loci. It showed a tendency that larger populations(Yupyeong-ri and Seongju-ri) have more genetic diversity and smaller populations(Saeun-ri and Wunam-ri) have less variation. Genetic diversity investigated in 6 seed stands of Q. variabilis(Na=4.6, Ho=0.642, He=0.571) was considered as relatively low level than five populations of Q. variabilis in China(Na=8.4, He=0.806; Xu et al., 2004). The FST value was 0.073, which means 7.3 percent of total genetic diversity is due to genetic differences among 6 populations. It was quite higher level than the five populations of Q. variabilis in China( FST=0.046; Xu et al., 2004).

Microsatellite 마커를 이용한 자작나무 8개 채종임분의 유전변이

조아르나 ( Aruna Jo ),김회진 ( Hoi Jin Kim ),정지희 ( Ji Hee Jeong ),김용율 ( Yong Yul Kim ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

본 연구에서는 자작나무 종자공급원의 효율적인 관리를 위하여 8개 채종임분을 대상으로 5개 microsatellite 표지에 근거한 유전다양성과 구조를 조사하였다. 그 결과, 유전자좌당 평균 대립유전자수(Na)는 집단별로 최소 5.6개(금봉)에서 7개(율리)까지 관찰되었고 평균 6.2개 였다. 이형접합도의 관찰치(Ho)와 기대치(He)는 송천 집단이 각각 0.438, 0.590으로 가장 낮았고, 임계 집단이 각각 0.642, 0.654로 가장 높았으며, 8개 집단의 평균은 각각 0.513, 0.621이었다. 고정계수(F)는 임계 집단이 0.031로 가장 낮았고, 나머지 집단은 0.111에서 0.223 사이의 값을 보여, 대부분의 집단에서 근친교배의 영향을 받은 것으로 추정되었다. 자작나무는 풍매에 의한 타식을 위주로 하는 종임에도 불구하고 현재 채종임분의 유전다양성은 다른 자작나무류 천연임분에 비해 낮았고, 고정계수는 0.165로 상당히 높은 편이었다. 우리나라의 자작나무 채종임분은 모두 조림지로써 이러한 유전적 특성은 조성 당시 종자공급원의 영향을 크게 받은 것으로 추정된다. 앞으로 건강한 종자공급원의 유지 관리를 위해서는 추가적인 연구를 통해 새로운 유전자원의 도입, 유전간벌 등의 구체적인 전략 마련이 필요하다고 사료된다. In this study, genetic diversity and structure of 8 seed production stands of Betula platyphylla var. japonica were analyzed using 5 microsatellite loci. Average number of alleles per locus(Na) was varied from 5.6 to 7 with an average of 6.2. The observed(Ho) and expected heterozygosity(He) was ranged from 0.438 and 0.590 to 0.642 and 0.654 with average of 0.513 and 0.621, respectively. Fixation index showed the lowest value 0.031 in Imgye population, and the rest of the populations showed the values ranging between 0.111 to 0.223 with an average of 0.165. Therefore it was considered that the most of populations have influenced by inbreeding. As a result, relatively low level of genetic diversity and high level of inbreeding coefficient were detected in seed stands of Betula platyphylla var. japonica, considering the species have wind-pollinated outcrossing mating system. Because of all the seed stands investigated in this study were artificially planted, its genetic characteristics must be subject to seed sources at that time. To maintain and manage a healthy seed stands as a seed sources, it is necessary to make a specific strategy to introduce new genetic resources to supplement of genetic diversity through further studies.

자몽종자추출물과 자일리톨이 배합된 껌의 치은염 예방 및 항균효과

진미성,유윤정,최봉규,이희영,김미정,노회진,박종섭,조규성,김종관,최성호,Jin, Mi-Sung,Yoo, Yun-Jung,Choi, Bong-Kyu,Lee, Hee-Young,Kim, Mi-Jung,Roh, Hoe-Jin,Park, Jong-Sub,Cho, Kyoo-Sung,Kim, Chong-Kwan,Choi, Seong-Ho 대한치주과학회 2003 Journal of Periodontal & Implant Science Vol.33 No.3

Grapefruit seed extract has been reported to have antimicrobial effect. The purpose of this study was to evaluate the antimicrobial and anti-gingivitis effect of chewing gum containing grapefruit seed extract and xylitol. 40 healthy subjects with gingivitis or early periodontitis were divided into two groups. Subjects in the experimental group chewed gum containing grapefruit seed extract and xylitol while subjects in the control group chewed gum containing only xylitol. All subjects received scaling and tooth brushing instruction. 1 week after scaling was set as baseline. Gingival index and plaque index were scored at baseline, 1 week, 2 week, 3 week and 4 week. Bleeding index, probing pocket depth and clinical attachment level were scored at baseline, 2 week and 4 week. The number of total bacteria and Streptococcus mutans in unstimulated saliva of experimental group were counted at 1 week, 2 week, 3 week and 4 week. Gingival indices of experimental group and control group at baseline, 1 week, 2 week, 3 week and 4 week were 0.850${\pm}$0.298, 0.575${\pm}$0.345, 0.533${\pm}$0.332, 0.459${\pm}$0.311, 0.408${\pm}$0.224 and 0.758${\pm}$0.379, 0.592${\pm}$0.276, 0.563${\pm}$0.281, 0.454${\pm}$0.194, 0.413${\pm}$0.199 (mean${\pm}$SD), respectively. Plaque indices of experimental group and control group at baseline, 1 week. 2 week, 3 week and 4 week were 0.497${\pm}$0.500, 0.375${\pm}$0.484, 0.332${\pm}$0.471, 0,286${\pm}$0.452, 0.210${\pm}$0.407 and 0.411${\pm}$0.492, 0.375${\pm}$0.484, 0.354${\pm}$0.479, 0.313${\pm}$0.463, 0.193${\pm}$0.395, respectively. Bleeding indices of experimental group and control group at baseline, 2 week and 4 week were 0.377${\pm}$0.177, 0.298${\pm}$0.152, 0.192${\pm}$0.108 and 0.383${\pm}$0.124, 0.318${\pm}$0.153, 0.225${\pm}$0.126, respectively. Probing pocket depth of experimental group and control group at baseline, 2 week and 4 week were 2.56${\pm}$1.00, 2.40${\pm}$0.65, 2.23${\pm}$0.64 and 2.45${\pm}$0.682.37${\pm}$0.57, 2.19${\pm}$0.57, respectively. Clinical attachment level of experimental group and control group at baseline, 2 week and 4 week were 2.58${\pm}$1.01, 2.43${\pm}$0.67, 2.26${\pm}$0.65 and 2.49${\pm}$0.70, 2.40${\pm}$0.59, 2.22${\pm}$0.62, respectively. The % of reduction of total bacteria in saliva of experimental group at 2 week, 3 week and 4 week were 46 ${\pm}$ 53%, 53 ${\pm}$ 5% and 69 ${\pm}$ 33%. The % of reduction of Streptococcus mutans count in saliva of experimental group at 2 week, 3 week and 4 week were 52${\pm}$69%, 88${\pm}$30% and 89${\pm}$17%. From these findings, it can be concluded that regular use of grapefruit seed extract /xylitol chewing gum may be effective to control and prevent gingivitis and may have caries-preventive effect.

두경부재건을 위한 전외측 대퇴유리피판: 해부학적 연구

박주용,박현도,윤관현,곽현호,허경석,강현주,김회진,최성원,Park, Joo-Yong,Park, Hyun-Do,Youn, Kwan-Hyun,Kwak, Hyun-Ho,Hu, Kyung-Seok,Kang, Hyun-Joo,Kim, Hee-Jin,Choi, Sung-Weon 대한악안면성형재건외과학회 2005 Maxillofacial Plastic Reconstructive Surgery Vol.27 No.4

The anterolateral thigh flap was originally described in 1984 as a septocutaneous flap based on the descending branch of the lateral circumflex artery. This flap has some significant advantages for reconstruction of the head and neck. It can be raised as a subcutaneous flap, a fasciocutaneous flap, or a myocutaneous flap and can resurface large defects in the head and neck. In addition, it has a large and long vascular pedicle, and because of the distance of the donor site from the head and neck, it can easily be harvested with a 2-team approach. However, the number and locations of cutaneous perforators vary individually, and thus, it is not widely used because flap elevation is often complicated and time-consuming owing to unexpected anatomical variations. The purposes of this study are to classify the vascular anatomy and to assess the suitability of anterolateral thigh flap for head and neck reconstruction in Korean. We performed an anatomic study on cadavers and analyzed the anatomic pattern of the lateral circumflex femoral arterial system and the perforators nourishing the anterolateral thigh flap. This study suggest the characteristics of vascular anatomic patterns of anterolateral thigh flap of Korean and utility of this flap for head and neck reconstruction.

백두대간 중부권역 천연림의 산림 분류

황광모 ( Kwang Mo Hwang ),정상훈 ( Sang Hoon Chung ),양희문 ( Hee Moon Yang ),김회진 ( Hoi Jin Kim ),김지홍 ( Ji Hong Kim ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

본 연구는 백두대간 중부권역의 구룡산, 소백산, 백화산, 속리산, 백학산 등 5지역을 대상으로 복잡 다양한 천연림 군집을 분류하고 산림피복유형을 집약하기 위해 실시되었다. 점표본법을 이용하여 1,114개의 표본점에서 식생자료를 수집하였으며, 조사된 식생자료를 바탕으로 Cluster 분석을 실시하였다. 그 결과 총 27개 군집으로 분류되었으며, 분류된 군집의 상층 수종 구성의 유사성을 바탕으로 신갈나무림형, 중생혼합림형, 굴참나무림형, 소나무림형, 기타활엽수림형, 졸참나무림형, 아고산대림형 등 총 7개의 산림피복유형으로 집약하였다. 연구 대상지에서 신갈나무림형이 가장 넓게 분포하였고, 신갈나무의 구성비율이 증가함에 따라 종다양성지수가 낮아지는 경향을 나타내었다. 중생혼합림형과 기타활엽수림형은 계곡에 많이 분포하였고, 신갈나무림형과 소나무림형은 능선 부위에 많이 분포하는 것으로 조사되었다. This study was carried out to classify forest communities and to aggregate forest cover types for the complex and diversified natural forest areas of Guryongsan, Sobaeksan, Baekhwasan, Sokrisan, and Baekhaksan in the middle part of Baekdudaegan. The vegetation data were collected by point-centered quarter sampling method. 1,114 sample points were subjected to cluster analysis to classify 27 forest communities, which were aggregated into 7 representative forest cover types on the basis of community similarity from composition of canopy species. They were Quercus mongolica cover type, mixed mesophytic forest cover type, Quercus variabilis cover type, Pinus densiflora cover type, the others deciduous forest cover type, Quercus serrata cover type, and subalpine forest cover type. The Quercus mongolica cover type was most widely distributed in the study areas. It was assumed that abundance of Q. mongolica might be negatively associated with species diversity. Mixed mesophytic forest and the others deciduous forest cover type were commonly distributed in the areas of valley, on the other hand, Q. mongolica cover type and P. densiflora cover type tended to be distributed in the areas of ridge.

기존 철도교량 일탈방호시설의 설계, 성능평가 및 시공

강윤석(Yun-Suk Kang),이승정(Seung-Jung Lee),방춘석(Choon-Seok Bang),김회진(Hoi-Jin Kim),곽희곤(Hee-Gon Kwak),김정중(Jung-Joong Kim) 대한토목학회 2020 대한토목학회지 Vol.68 No.3