Genome sequence of Caballeronia sordidicola strain PAMC 26592 isolated from an arctic lichen species

김정희,권개경,김병권,홍순규,오현명,Kim, Junghee,Kwon, Kae Kyoung,Kim, Byung Kwon,Hong, Soon Gyu,Oh, Hyun-Myung The Microbiological Society of Korea 2017 미생물학회지 Vol.53 No.1

Caballeronia sordidicola strain PAMC 26592 was isolated from Umbilicaria sp., a lichen material collected from Svalbard Archipelago in the Arctic Ocean. We report the draft genome sequence of the strain PAMC 26592, a metabolic generalist. As we have observed in previous genomic studies in the genus Caballeronia draft genomic sequences of PAMC 26592 had an assortment of genes of ecological importance and of bio-technical potentials, which include diverse metabolic genes for carbohydrates, aromatic compounds, amino acids, and vitamins, and genes for nitrogen / sulfur metabolisms, stress responses, membrane transporters, antibiotic resistance, and heavy metal resistance.

곰피추출물의 간기능 개선 효과 평가를 위한 12주, 무작위배정, 이중맹검, 위약-대조 인체적용시험

김정희,김은진,강다혜,김형빈,장재영,엄애선,김종욱,Kim, Junghee,Kim, Eun Jin,Kang, Dahye,Kim, Hyung-Bin,Jang, Jae Young,Om, Ae-Son,Kim, Jongwook 한국식품위생안전성학회 2022 한국식품위생안전성학회지 Vol.37 No.3

본 연구에서는 경증 또는 중등도 간기능 이상 소견자를 대상으로 ESE의 간기능 개선 효과를 평가하기 위해 시험식품군과 대조식품군으로 나누어 단일기관, 위약대조, 무작위배정, 이중눈가림 평행 인체적용시험으로 연구를 수행하였다. 12주간 ESE 420 mg(210 mg/포, 1일 2회)을 함유한 시험식품 또는 대조식품을 섭취하였을 때 ESE의 간 기능 개선 유효성과 안전성을 평가하였다. 유효성 평가 결과, 섭취 후 시험식품군은 대조식품군과 비교하여 ALT, AST, γ-GT 수준이 유의하게 감소하였다. 반면, 지질대사 지표는 두 군간의 의미 있는 차이를 보이지 않았다. 또한, 비알콜성 시험대상자군을 대상으로 분석하였을 때도 ALT 및 AST 수준이 유의하게 감소하였으며 γ-GT의 경우 감소하는 경향성을 보였다. 안전성 평가로서 혈액, 소변, 활력 징후를 검사한 결과 대부분 항목에서 시험식품군과 대조식품군 군간 차이가 없었으며 몇몇 유의성이 나타난 지표도 임상적 의미는 없었다. 따라서 ESE는 간기능 개선에 도움을 줄 수 있을 것으로 보이며 안전한 식품 소재로 판단된다.

Celeribacter marinus IMCC12053의 외향고리 GpC DNA 메틸트랜스퍼라아제

김정희,오현명,Kim, Junghee,Oh, Hyun-Myung The Microbiological Society of Korea 2019 미생물학회지 Vol.55 No.2

DNA 메틸화는 유전체의 무결성의 유지 및 유전자 발현 조절과 같은 박테리아의 다양한 과정에 관여한다. Alphaproteobacteria 종에서 보존된 DNA 메틸 전이 효소인 CcrM은 S-아데노실 메티오닌을 공동 기질로 사용하여 $N^6$-아데닌 또는 $N^4$-시토신의 메틸 전이 효소 활성을 갖는다. Celeribacter marinus IMCC 12053는 해양 환경에서 분리된 알파프로테오박테리아로서 GpC 시토신의 외향고리 아민의 메틸기를 대체하여 $N^4$-메틸 시토신을 생산한다. 단일 분자 실시간 서열 분석법(SMRT)을 사용하여, C. marinus IMCC12053의 메틸화 패턴을 Gibbs Motif Sampler 프로그램을 사용하여 확인하였다. 5'-GANTC-3'의 $N^6$-메틸 아데노신과 5'-GpC-3'의 $N^4$-메틸 시토신을 확인하였다. 발현된 DNA 메틸전이 효소는 계통 발생 분석법을 사용하여 선택하여 pQE30 벡터에 클로닝 후 $dam^-/dcm^-$ 대장균을 사용하여 클로닝된 DNA 메틸라아제의 메틸화 활성을 확인하였다. 메틸화 효소를 코딩하는 게놈 DNA 및 플라스미드를 추출하고 메틸화에 민감한 제한 효소로 절단하여 메틸화 활성을 확인하였다. 염색체와 메틸라아제를 코드하는 플라스미드를 메틸화시켰을 때에 제한 효소 사이트가 보호되는 것으로 관찰되었다. 본 연구에서는 분자 생물학 및 후성유전학을 위한 새로운 유형의 GpC 메틸화 효소의 잠재적 활용을 위한 외향고리 DNA 메틸라제의 특성을 확인하였다. DNA methylation is involved in diverse processes in bacteria, including maintenance of genome integrity and regulation of gene expression. CcrM, the DNA methyltransferase conserved in Alphaproteobacterial species, carries out $N^6$-adenine or $N^4$-cytosine methyltransferase activities using S-adenosyl methionine as a co-substrate. Celeribacter marinus IMCC12053 from the Alphaproteobacterial group was isolated from a marine environment. Single molecule real-time sequencing method (SMRT) was used to detect the methylation patterns of C. marinus IMCC12053. Gibbs motif sampler program was used to observe the conversion of adenosine of 5'-GANTC-3' to $N^6$-methyladenosine and conversion of $N^4$-cytosine of 5'-GpC-3' to $N^4$-methylcytosine. Exocyclic DNA methyltransferase from the genome of strain IMCC12053 was chosen using phylogenetic analysis and $N^4$-cytosine methyltransferase was cloned. IPTG inducer was used to confirm the methylation activity of DNA methylase, and cloned into a pQE30 vector using dam-/dcm- E. coli as the expression host. The genomic DNA and the plasmid carrying methylase-encoding sequences were extracted and cleaved with restriction enzymes that were sensitive to methylation, to confirm the methylation activity. These methylases protected the restriction enzyme site once IPTG-induced methylases methylated the chromosome and plasmid, harboring the DNA methylase. In this study, cloned exocyclic DNA methylases were investigated for potential use as a novel type of GpC methylase for molecular biology and epigenetics.

Draft genome sequence of Caballeronia sordidicola strain PAMC 26633 isolated from an antarctic lichen, Psoroma species

김정희,홍순규,오현명,Kim, Junghee,Hong, Soon Gyu,Oh, Hyun-Myung The Microbiological Society of Korea 2017 미생물학회지 Vol.53 No.4

본 연구에서 남극 킹 조지 섬 인근에서 채집한 지의류 Psoroma 종에서 분리한 Caballeronia sordidicola 균주 PAMC 26633의 초벌 유전체를 분석하였다. 이전의 연구를 통한 극지방의 지의류에 공생하는 Caballeronia 속 세균의 유전체와 마찬가지로 생물공학 및 생태학적으로 활용가능성 있는 다양한 유전자를 발견할 수 있었다. 이는 다양한 대사 관련 유전자를 포함하며, 탄수화물, 아미노산, 질소/황 대사, 스트레스, 세포막 수송체, 항생제 및 중금속 내성에 관련이 있었다. 파아지와 트랜스포존 유전자가 소수 있었으며, CRISPR 관련 유전자 및 서열은 발견되지 않았다. Here we report the draft genome sequence of the Caballeronia sordidicola strain PAMC 26633, isolated from Psoroma species, a lichen material from Barton Peninsula, King George Island in Antarctica. As we have observed in previous genomic studies in the genus Caballeronia from polar lichen, draft genomic sequences of PAMC 26633 had an assortment of genes of ecological importance and of biotechnical potentials, which include diverse metabolic genes for carbohydrates, amino acids, and genes for nitrogen/sulfur metabolisms, stress responses, membrane transporters, antibiotic resistance, and heavy metal resistance. CRISPR genes and sequences were not found and there were some phage remnants and transposons.

공용 UDDI 비즈니스 레지스트리의 현황에 대한 분석

김정희(Junghee Kim),오수영(Youngkuk Kim),김영국(Sooyoung Oh) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.1C

본 논문은 현재 IBM, 마이크로소프트, SAP등이 운용하고 있는 대표적인 공용 UBR(UDDI Business Registry) 노드들과 국내에서 개발된 K-UDDI, 일본의 NTT에서 운용하는 UBR 노드에 대해 각각의 특징을 서로 비교해 본다. 또한 간단한 모니터링 프로그램을 구현하여, 각각의 UDDI 비즈니스 레지스트리에 등록되고 있는 전체 비즈니스 개체와 비즈니스 서비스 수의 증감 추이를 관찰하고, 등록된 비즈니스 개체별 링크된 WSDL파일의 유효함의 여부를 실행한 결과물을 통해 현재 운용중인 공용 UDDI 레지스트리의 활성화 정도를 분석해 본다.

감로도 도상의 기원과 전개 -연구현황과 쟁점을 중심으로-

김정희 ( Kim Junghee ) 한국불교미술사학회(한국미술사연구소) 2016 강좌미술사 Vol.47 No.-

甘露圖는 망자의 영혼이 고통을 벗어나 보다 좋은 곳에 태어날 수 있도록 불·보살에게 음식을 공양하며 영혼을 천도하는 의식을 표현한 불화로, 대표적인 靈駕薦度用 불화 가운데 하나이다. 현존하는 작품은 70 여 점으로 1580 년에 제작된 일본 개인소장 감로도가 가장 이른 작품이며, 나머지는 대부분 18, 19 세기의 작품이 주류를 이루고 있다. 감로도는 특정한 소의경전에 의거하여 교리적인 내용, 규범화된 구성을 보여주는 예배용 불화와 달리 하단·중단·상단으로 이어지는 상승적 구도, 현실생활을 그대로 옮겨놓은 듯한 다양한 도상, 중국이나 일본 등 다른 불교국가에는 없는 독창적인 불화라는 점 등에서 일찍부터 많은 연구자들의 주목을 받아왔다. 상단과 중단은 시식의례 및 망자천도와 관련된 종교적인 내용이 위주인 반면, 천도의 대상을 묘사한 하단은 인간들의 여러 危難相, 즉 아귀도의 모습과 비명횡사한 고혼, 육도윤회의 여러 모습, 지옥장면, 현실세계의 반영 등 풍속화라고 부를 만큼 다양한 도상들이 묘사되어 있다. 본고에서는 그동안 여러 분야에서 발표된 감로도 관련 글과 논문을 중심으로 감로도의 구성, 감로도의 기원과 소의경전 문제, 감로도 하단의 도상과 관련된 다양한 견해 등을 살펴보고, 이어서 감로도를 지칭하는 다양한 명칭에 대해 살펴보았다. 감로도의 기원에 대해서는 우리나라에서 여러 신앙을 기반으로 하여 독자적으로 발전하였다는 설, 수륙재용 의식불화에서 기원하였다는 설, 중국 수륙화의 영향을 받아 기원하였다는 설, 밀교경전을 소의경전으로 하여 기원하였다는 설 등이 발표되었으며, 하단의 도상에 대헤서는 하단의 장면과 의식집과의 관계. 풍속화와의 관계 등에 중점을 둔 연구를 비롯하여 하단의 장면과 조성 당시의 사회상과의 관계에 관한 연구가 이루어졌다. 또한 음악사분야에서는 하단의 장면 중 예인집단의 연주 방식과 예인집단의 종류와 성격, 악기 종류를 중심으로 도상학적으로 접근한 연구와 연희집단 중 특히 사당패에 관한 연구가 활발하게 진행되었다. 이밖에도 불교무용(작법), 복식 , 미용 , 무속. 의식법구 및 불구, 헌공화 등에 이르기까지 감로도 하단에 표현된 도상에 대한 다양한 연구가 진행되었다. 감로도의 명칭은 시대에 따라 다양하지만 감로탱, 감로왕탱, 감로회 등 감로와 관련된 명칭이 가장 많다는 점에 주목할 만하다. 16 세기에는 幀佛이라 하여 구체적인 명·칭이 기록되지 않았으며, 17 세기에는 畵像이라는 명칭과 함께 甘露王幀이라는 명칭이 처음으로 등장하였다. 또 18 세기에는 감로왕탱· 감로탱· 감로회· 하단탱, 19 세기에는 감로탱, 20 세기에는 감로탱 등으로 기재되어있어, 감로도를 지칭하는 가장 일반적인 명칭은 감로탱 또는 감로왕탱이었음을 알 수 있다. 이중 감로왕탱이라는 명칭은 甘露王如來가 7 여래 및 5 여래 중에 포함되어 있지 않은 경우도 있으며, 설령 포함되어 있다 하더라도 작품 속에서 어느 여래가 甘露王如來인지 확인하기 어려우며, 조선후기 작품에서는 감로왕여래와 아미타여래를 동일시하여 아미타여래를 주존으로 표현하는 경향도 있으므로, 감로도를 지칭하는 명칭으로는 적합지 않다. 감로도가 무주고혼들에게 감로를 베품으로써 아귀도에서 벗어나 극랑왕생하는 내용을 그림으로 표현한 불화라는 점을 생각해 본다면, 감로도에서 아귀도와 극락을 잇는 가장 중요한 매체는 감로이므로, 이러한 내용을 그림으로 표현한 그림은 감로도 또는 감로탱이라고 칭하는 것이 타당하다고 생각한다. This study examines the composition of Nectar Ritual Paintings(Gamrodo), the origins of Nectar Ritual paintings and issues of the basic Buddhist sutra, the various kinds of views related to the image of iconography at the bottom of Nectar Ritual Paintings, and then explore various names referring to Nectar Ritual Paintings. The origin of the Nectar Ritual Paintings is based on the belief that it developed independently on the basis of various beliefs in Korea, originated from the ritual Buddhist paintings for the Water-Land Ritual, and influenced by the Water-Land Ritual Paintings, and the origin of the scriptures of the eschatology as the basic Buddhist sutra. And as for the image of the lower part, researches focusing on the relationship between the scene at the bottom and books for ritual and the relationship between genre pictures and researches on the relationship between the scene at the bottom and the social phenomenon at the time were performed. In addition, in the aspect of artistic music history, on play methods of the groups of performing arts and entertainments at the bottom of the scene, and kinds and characters of artist groups, and the kinds of instruments, and play groups, especially research has been actively conducted on Sadangpae. In addition, a variety of studies were conducted on Images expressed at the bottom of Nectar Ritual Paintings including Buddhist dance, costume, beauty, Buddhist goods and instruments, and flower paintings. The names of Nectar Ritual Paintings varied from generation to generation, but the names such as Gamrotaeng, Gamrowangtaeng, and Gamrohoe were most commonly associated with Gamro (Sweet Nectar). Nectar Ritual Paintings was called as Taengbul in the 16th century, as Hwasang or Gamrowangtaeng in the 17th century. It was recorded as Gamrowangtaeng, Gamrotaeng, Gamrohoe, and Hadantaeng in the 18th century, and as Gamrotaeng in the 19th and 20th centuries, and so it can be said that the most common name for Nectar Ritual Paintings was Gamrotaeng or Gamrowangtaeng. Among them, there were cases that Gamrotaengtaeng was not included among seven Buddhas and/or five Buddhas. Even if it was included, it is difficult to confirm who is Gamro Buddha. In the later Joseon works, Gamro Buddha and Amitabha Buddha were identified to tend to express Amitabha Buddha as principal Buddha, which accordingly, is not suitable for the name referring to Nectar Ritual Paintings. Considering that Nectar Ritual Paintings are out of world of Preta by giving Sweet Nectar to the Forlorn Wandering Spirits and that Reincarnation in the Pure land is a picture-depicting discourse, the most important medium linking world of Preta and Paradise in Nectar Ritual Paintings is Sweet Nectar, and so therefore I think that it is appropriate to call these pictures which expressed these contents as Gamrodo or Gamrotaeng.

항공사 관계몰입과 러브마크에 관한 연구: 기업이미지 조절효과를 중심으로

김정희 ( Junghee Kim ) 관광경영학회 2020 관광경영연구 Vol.100 No.-

In this study, The relationship between the impact of relationship immersion on lovermark In addition, the moderating effect of corporate image on the influence of relationship immersion on lovermark was identified. As a result of reliability analysis, the Cronbach’s α coefficient of all variables such as relationship immersion, lovemark, and corporate image, showed 0.8 or more, thus ensuring reliability. The results of regression analysis between variables for hypothesis testing are as follows. First, as a result of verifying the effect of relationship immersion on lovemark, relationship immersion had a significant effect on lovemark. Second, the results of verifying the adjustment effect of corporate image are as follows. As a result of analyzing the moderating effect of corporate image in the relationship between relationship immersion and lovemark, the public confidence has been shown to control the relationship between emotional immersion and love dimension, and also to control the relationship between computational immersion and respect dimension. Affinity was found to control the relationship between computational immersion and love dimension, and to control the relationship between computational immersion and respect dimension.

지방정부 정책과정에서의 참여･직접･숙의 민주주의 결합 모색 : 광역시･도 조례를 중심으로

김정희(Kim, Junghee) 한국지방정부학회 2022 지방정부연구 Vol.25 No.4

지방정부 정책과정에서 참여･직접･숙의 민주주의의 핵심 가치를 결합해 폭넓은 참여, 질 높은 토론과 성찰적 의사결정, 자기결정권과 영향력을 시민들에게 보장하는 민주적 요소를 탐색하는 것이 이 연구의 목표이다. 선행연구를 토대로 분석지표를 도출하고 17개 광역 지방정부의 관련 조례들을 고찰하였다. 분석 결과는 각 민주주의가 가진강점과 약점을 극명하게 보여준다. 참여 및 직접 민주주의 관련 조례는 참여의 평등성과 포괄성이 숙의 조례에 비해높음을 알 수 있다. 예를 들어 주민참여예산조례와 주민자치회 조례는 의제 통제권과 숙의 형성에 비해 참여의 포괄성･평등성이 상대적으로 높았다. 주민투표 및 주민발안 조례는 참여성에 더해 의제 통제권이 숙의 형성 지표보다높게 나타났다. 숙의 조례의 경우 숙의 민주주의 수준은 매우 높은 데 비해 참여성과 의제 통제권이 대단히 낮은 것으로 확인되었다. 조례 속에 참여･직접･숙의적 요소를 모두 포함하는 안과, 각 제도를 순차적으로 연결하는 안 등을 개선과제로 제시하였다 This study aimed to explore the democratic elements that guarantee citizens a wide range of participation, high-quality discussion, reflective decision-making, self-determination, and influence by combining the core values of democracy in the process of local government policymaking. Based on previous studies, it derived the necessary analysis indicators and reviewed related ordinances of 17 metropolitan governments. The results of the analysis clearly showed the strengths and weaknesses of each democracy. Equality and participation inclusiveness were higher in participatory and direct democracy-related ordinances than those in deliberative democratic ordinances. For example, the residents’ participatory budging ordinance and the residents association ordinance were found to have relatively higher comprehensiveness and equality of participation than the formation of deliberation and agenda control authority. The referendum and residents’ initiative ordinance showed higher agenda control than the deliberation formation index. In the case of deliberation-related ordinances, it was confirmed that the level of deliberative democracy was very high, while participation and agenda control authority were very low. Two improvement tasks were suggested: a plan to include participatory, direct, and deliberative elements in the ordinance and another to connect each system sequentially

기억부하가 얼굴과 공간 작업기억의 유지에 미치는 효과 : 사건유관 fMRI 연구

김정희(Junghee Kim),정광우(Jeong Gwang-Woo),강형근(Heoung-KeunKang),이무석(Moo-Suk Lee),박태진(Taejin Park) 한국인지과학회 2010 인지과학 Vol.21 No.2

본 연구는 공간작업기억과 비공간작업기억의 유지 처리에 대한 영역특수모형과 처리특수모형을 검증하고자 수행한 사건유관 fMRI 연구이다. 지연반응과제에서 얼굴자극을 표적자극으로 사용하고 표적자극의 수를 달리하여 기억부하를 조작하였으며 일정한 지연기간 후 위치 및 얼굴 재인판단을 요구하였는데, 지연 동안 정보유형(위치와 얼굴)이 기억부하효과의 신경상관물에 미치는 영향을 뇌영상 처리로 분석하였다. 독립변인은 정보유형(자극영역)과 기억부하(표적자극의 수)로서, 정보유형변인은 얼굴작업기억(비공간작업기억) 및 공간작업기억의 두 수준, 기억부하변인은 표적자극이 1개인 조건(저부하)과 3개인 조건(고부하)이었다. 행동수행 분석 결과, 재인정확도에 있어 얼굴작업기억과 공간작업기억 간에는 차이가 없었으며 두 작업기억 모두에서 동등한 정도의 기억부하효과가 확인되었다. 뇌 영상분석 결과, 유지단계에서 전전두피질의 하측 및 중/상측영역이 모두 얼굴작업기억과 공간작업기억 양자와 관련되고 특히 VLPFC가 두 작업기억에 공통적으로 관련된다는 것이 밝혀졌는데, 이러한 결과는 처리성분에 따른 전전두피질의 기능적 전문화를 주장하는 처리특수모형에 더 잘 부합된다. In order to evaluate the domain-specific model and process-specific model of spatial and nonspatial working memory (WM), this study manipulated the memory load of the delayed response task and examined how the neural correlates of memory load effect was influenced by the stimulus domain (face and location) at the maintenance stage of WM using an event-related fMRI experiment. One or three face stimuli were presented as target stimuli and participants were asked to maintain the face itself (face WM) or the location of face stimuli (spatial WM). The results of recognition judgment accuracy showed no difference between face WM and spatial WM, and showed equivalent memory load effects of both WM. As a result of brian image analysis, memory load effect at maintenance stage showed that inferior, middle, and superior PFC were recruited by both face WM and spatial WM, and showed that VLPFC was the commonly activated area by both WM, supporting functional specialization of PFC by process components of WM. This study provides evidence for process-specific model in which maintenance of WM is associated with VLPFC.

원장의 감성리더십, 초임영아교사의 이직의도가 보육효능감에 미치는 영향: 교사민감성의 매개효과를 중심으로

김정희(Kim, Junghee),오승아(Oh, Seungah) 학습자중심교과교육학회 2018 학습자중심교과교육연구 Vol.18 No.22

본 연구는 어린이집 원장의 감성리더십과 초임영아교사의 이직의도가 보육효능감에 미치는 영향에 대한 교사 민감성의 매개효과를 규명하기 위해 실시되었다. 서울과 인천의 어린이집 영아반 초임교사로 재직 중인 148명을 대상으로 설문지를 통한 조사를 실시하였다. 예비조사는 2017년 11월 3째주에 진행하였고, 본 조사는 2017년 12월 한 달 동안 이루어졌다. 원장의 감성리더십 질문지(구자영, 2012), 이직의도 질 문지(안재현, 2014), 보육효능감 질문지(이기영, 2007), 교사 민감성 질문지(민광미, 2014)를 사용하였다. 결과 처리를 위해 SPSS 20.0을 이용하여 빈도분석, 신뢰도 검증, 상관관계분석, 회귀분석을 실시하였다. 연구결과 첫째, 초임영아교사의 민감성이 원장의 감성리더십과 보육효능감 간에 부분 매개역할을 하고 있었다. 둘째, 초임영 아교사의 민감성이 이직의도와 보육효능감 간에 부분 매개역할을 하고 있었다. 본 연구결과를 통해 보육효능감을 증진시킬 수 있는 다양한 방안과 초임영아교사의 민감성을 개발하고 발휘할 수 있는 전략을 모색하는데 기초정보를 제공할 수 있다. The purpose of this study was to investigate the mediating effects of the sensitivity of teachers on influences which the emotional leadership of director and beginning Infant teachers turnover intention have on the efficacy of child care and teaching. A questionnaire survey was conducted on 148 teachers who were working as beginning Infant teachers in the nursery schools in Seoul and Incheon. Preliminary survey was conducted on the third week of November and full-scale survey was conducted for one month in December. The emotional leadership(Koo Ja-young, 2012), the turnover intention(Ahn Jae-hyun, 2014), the childcare efficacy(Lee Ki Young, 2007) and the teacher sensitivity(Min Kwang Mi, 2014) questionnaire were used for the research. Frequency analysis, reliability verification, correlation analysis, and regression analysis were performed using SPSS 20.0 for this research. The results of this study are as follows: First, the sensitivity of beginning Infant teachers played a role as a mediator between the director s emotional leadership and childcare efficacy. Second, The sensitivity of beginning Infant teachers played a partial role as a mediator between beginning Infant teachers turnover intention and childcare efficacy. The results of this study can provide basic information for various ways to enhance the childcare efficacy and to find strategies to develop and exert the sensitivity of early childhood teachers.