5,10-Methylenetetrahydrofolate Reductase (MTHFR C677T와 A1298C) 유전자 돌연변이의 반복자연유산 관련성 연구

김남근,남윤성,이수만,김선희,신승주,장성운,김세현,차광렬,오도연,Kim, Nam-Keun,Nam, Yoon-Sung,Lee, Su-Man,Kim, Sun-Hee,Shin, Seung-Joo,Chang, Sung-Woon,Kim, Se-Hyun,Cha, Kwang-Yul,Oh, Do-Yeun 대한생식의학회 2002 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.29 No.3

Objective : Previous studies have suggested that hyperhomocysteinemia and methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR C677T) mutations are associated with increased risk of recurrent spontaneous abortion (RSA). Recently, a second site polymorphism in MTHFR, 1298A-->C, which changes a glutamic acid into an alanine residue, was shown to be associated with a decreased enzyme activity. We tested whether the variant alleles of MTHFR C677T and A1298C are risk factor (biomarker) for RSA. Materials and Methods: We analyzed DNA from a case-control study in the Korean DNA was extracted from blood samples of 118 patients with RSA and 123 healthy fertile patients as the controls. MTHFR variant alleles were determined by a PCR-restriction fragment length polymorphism assay. Results: We found no evidence for an association between 677TT genotype and risk of RSA (OR=1.95, 95% CI=$0.84{\sim}4.50$, p=0.12). However, the MTHFR 1298AC (OR=0.36, 95% CI=$0.20{\sim}0.63$, p=0.0004) and 1298AC+CC (OR=0.35, 95% CI=$0.20{\sim}0.61$, p=0.0002) genotypes were lower among 118 RSA cases compared with 123 controls, conferring a 2.8-fold decrease in risk of RSA, respectively. Moreover, the combined genotypes of MTHFR 677CC/1298AC (OR=0.30, 95% CI=$0.10{\sim}0.88$, p=0.029) and 677CT/1298AC (OR=0.77, 95% CI=$0.60{\sim}0.99$, p=0.043) also showed significantly lower risk than those with MTHFR 677CC/1298AA type. Conclusion: MTHFR 1298AC, MTHFR 677CC/1298AC and 677CT/1298AC genotypes may represent genetic markers for the protection of RSA at least in Korean women.

The Analysis of the $LH{\beta}$ Gene Mutation in Infertile Patients with Endometriosis and Amenorrhea Women

김남근,이유진,남윤성,이상희,정기화,고정재,이숙환,차광열,Kim, Nam-Keun,Lee, Eu-Gene,Nam, Yoon-Sung,Lee, Sang-Hee,Chung, Ki-Wha,Ko, Jung-Jae,Lee, Sook-Hwan,Cha, Kwang-Yul The Korean Society for Reproductive Medicine 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.1

연구목적: 본 연구는 자궁내막증과 무월경 불임환자들을 대상으로 $LH{\beta}$ exon 2 유전자의 돌연변이를 탐색하고자 시도하였다. 연구재료 및 방법: 그 대상으로 22명의 자궁내막증 환자와 12명의 무월경 환자 그리고, 54명의 건강한 비임신 여성을 대조군으로 사용하였다. 이들을 대상으로 한 돌연변이 탐색은 PCR-RFLP(polymerase chain reaction-restriction fragment polymorphism) 방법으로 수행되었다. 결과: 그 결과 자궁내막증과 무월경증 환자에서 그 변이의 비율이 각각 18.2%, 16.7% 그리고, 대조군에서 역시 16.7%의 빈도를 나타냈다. 결론: 따라서, 자궁내막증과 무월경증 환자는 $LH{\beta}$ exon 2 돌연변이와는 서로 관련이 없거나 매우 적음을 알 수 있었다.

야생 효모의 분리.동정 및 이를 이용한 포도주 제조

김정인,이남근,함영태,Kim, Jung-In,Lee, Nam-Keun,Hahm, Young-Tae 한국미생물학회 2007 미생물학회지 Vol.43 No.3

거봉 포도로부터 분리하여 동정한 야생효모 Saccharomyces cerevisiae IJ850을 이용, 국내산 캠벨얼리와 거봉포도를 발효시켜 적포도주를 제조하고, 이의 발효특성을 분석함으로서 포도주제조용 발효균주로서의 가능성을 알아보고자 하였다. 야생발효균주의 분리를 위하여 안성지역 거봉포도와 캠벨얼리 포도즙을 실온에서 6일 동안 스타터의 첨가없이 자연발효시켜 우세균주를 분리하였다. 거봉에서 분리된 효모의 발효능이 캠벨얼리에서 분리된 효모보다 1.8배정도 높았다. 거봉에서 분리한 발효균주를 분자 생물학적 인 방법 인 26S rDNA 염기서열에 근거하여 동정한 결과, Saccharomyces cerevisiae와 99.7%의 유사성을 나타내어 Saccharomyces cerevisiae IJ850으로 동정되었다. 분리균주를 이용한 포도주의 제조에서는 캠벨얼리와 거봉포도즙의 최종 당도를 $25^{\circ}Brix$로 포도당을 이용하여 보당하고, 이산화탄소를 발효조에 채우고, 실온에서 10일간 발효시켰다. 포도주의 수율은 캠벨얼리가 75%, 거봉이 85%였고 최종 알코올 도수는 캠벨얼리가 11.0%, 거봉이 13.0%이었다. 산업용발효균주인 S. cerevisiae EC-1118과 비교한 결과 총산도는 캠벨얼리와 거봉포도주 모두에서 산업용 발효균주인 EC-1118에 비하여 분리한 S. cerevisiae IJ850에서 낮은 수치를 보였다. 포도주의 pH와 색도 분석에서는 S. cerevisiae IJ850과 S. cerevisiae EC-1118로 제조한 포도주모두에서 비슷한 수치를 보여주었으나, 페놀 성분분석에서는 S. cerevisiae EC-1118로 제조한 캠벨얼리 포도주에서 125 mg/L의 함량을, S. cerevisiae IJ850으로 제조한 거봉포도주에서 75 mg/L의 함량을 나타내었다. 따라서 국내 거봉포도로부터 분리한 S. cerevesiae IJ850는 포도주 생산에 사용될 수 있는 균주로써 그 가능성을 보여주었다. The domestic cultured Campbell's Early and Geubong grapes were fermented far the production of red wines with the isolated wild yeast Saccharomyces cerevisiae IJ850. For the isolation of wild yeast, Geubong and Campbell's Early grapejuices were naturally fermented at room temperature for 6 days without adding stater culture. The strain isolated from Geubong which has 1.8 times higher fermentative ability than the strains isolated Campbell Early was selected. The selected strain was identified by using 26S rDNA sequencing. The strain showed 99.7% of similarity with Saccharomyces cerevisiae and thus identified as Saccharomyces cerevisiae IJ850. It was investigated the fermentative ability as the start culture. For the production of grapewine, the final sugar concentrations of grapejuices were adjusted to the $25^{\circ}Brix$ with anhydrous glucose. The grapejuices were fermented at room temperature for 10 days in the air-locked bottles filled with $CO_2$ gas. The final yield and alcohol concentration of Campbell's Early and Geubong grapewines fermented with the isolated wild yeast were 80.8%, 11.0% and 87.8%, 13.0%, respectively. Between the isolated wild yeast S. cerevisiae IJ850 and the commercial yeast S. cerevisiae EC1118, total acidities of grapewines produced with wild yeast were lower than those produced with the commercial yeast. The pH values and the values of color analysis of grapewines produced with both strains were similar. The total phenol contents of campbell's Early and Geubong wines produced with the isolated yeast and the commercial yeast were obtained in the range of 75 to 125mg/L. In conclusion, S. cerevesiae IJ850 isolated from the domestic cultured Geubong grape is able to use to produce grapewines as stater culture.

자궁내막증과 다낭성 난포증후군 불임환자에서 $LH{\beta}$ Exon 3 (Gly102Ser) 유전자의 돌연변이 분석

김남근,이유진,조민순,남윤성,정형민,정기화,오유경,고정재,차광열,Kim, Nam-Keun,Lee, Eu-Gene,Cho, Min-Soon,Nam, Yoon-Sung,Chung, Hyung-Min,Chung, Ki-Wha,Oh, Yu-Kyoung,Ko, Jung-Jae,Cha, Kwang-Yul The Korean Society for Reproductive Medicine 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.3

연구목적: 본 연구는 자궁내막증과 다낭성 난포증후군 불임환자들을 대상으로 $LH{\beta}$ exon 3 (Gly102Ser) 유전자의 돌연변이를 탐색하고자 시도하였다. 연구재료 및 방법: 그 대상으로 26명의 자궁내막증 환자와 52명의 다낭성 난포증후군 환자 그리고, 50명의 출산 경험이 있는 건강한 여성을 대조군으로 사용하였다. 이들을 대상으로 한 돌연변이 탐색은 PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism) 방법으로 수행되었다. 결과 : 그 결과 자궁내막증과 다낭성 난포증후군 환자 및 출산 경험이 있는 건강한 여성에서 그 변이형이 나타나지 않았다. 결론: 따라서, 자궁내막증과 다낭성 난포증후군 불임환자의 $LH{\beta}$ exon 3 돌연변이형은 중국인 집단에만 존재할 가능성이 높으며, 더 많은 불임환자들을 대상으로 한 연구가 요구된다.

다중 중합효소연쇄반응 ( Multiplex PCR ) 방법을 이용한 한국인 자궁경부암 환자에서의 HPV 고 위험군 및 저 위험군의 동시 분석

김남근(Nam Keun Kim),이찬(Chan Lee),이숙환(Sook Hwan Lee),고정재(Jung Jae Ko),손태종(Tae Jong Sohn),오유경(Yu Kyoung Oh),안희정(Hee Jung Ahn),차광열(Kwang Yul Cha) 대한산부인과학회 2000 Obstetrics & Gynecology Science Vol.43 No.9

목적 : 다중 중합효소연쇄반응 (Multiplex PCR) 방법을 이용하여 자궁경부암 환자에서 인유두종부 바이러스 (human papilloma virus; HPV)의 고 위험군과 저 위험군을 동시에 검색하고, 이를 진단 및 예후판정에 이용하고자 시도하였다. 연구방법 : 1995년 6월부터 11월까지 분당 차병원 산부인과에 내원하여 생검이나 수술적 적출술을 수행한 71명의 환자를 대상으로 실시하였다. Multiplex PCR 방법으로 한번의 RCR 수행으로 HPV 감염여부 및 고 위험군, 저 위험군을 동시에 typing하였다. 이때, HPV의 L1, E6, E7 DNA에 대한 3 set의 primer를 동시에 반응시켜 결과를 얻었다. 결과 : 총 68명의 자궁경부암 환자를 대상으로 HPV 감염여부 및 고 위험군과 저 위험군여부를 검색하였다. 이들을 자궁경부암의 진행정도에 따라 상피내종양 (cervical intraepithelial neoplasia; CIN)과 침윤암 (Invasive carcinoma; ICa)으로 구분하였다. 이들은 CIN I이 75% (9/12), CIN II가 75% (9/12), CIN III가 92.0% (23/25), 그리고 ICa가 94.7% (18/19)로 각각 나타났다. 또한, 고 위험군 (HPV16/18), 저 위험군 (HPV6/11) 및 기타 type이 각각 50.0%(34/68), 4.4%(3/68), 32.4%(22/68)로 나타났다. 전체적으로는 86.8%(59/68)의 HPV 감염 양성율을 나타냈다.결론 : 이러한 연구결과로 보아 다중 중합효소연쇄반응 (Multiplex PCR)은 자궁경부암 환자에서 HPV 고 위험군 및 저 위험군의 동시 분석에 매우 효과적인 방법으로 임상진단 및 예후판정에 널리 활용될 수 있을 것으로 기대된다. Objective : To investigate simultaneous detection of high and low-risk type of HPV in Korean cervical carcinoma using multiplex PCR method. Methods : HPV typing in cervical carcinoma was performed by multiplex PCR using three set of consensus primers for L1, E6, E7 of HPV DNA. Results : A total of 68 cervical carcinomas were examined. Histological examination revealed a specimen of carcinomas, which were classified as CIN I, CIN II, CIN III and invasive carcinoma (ICa). Of 68 cervical carcinomas, 75.0% (9 of 12) of CIN I, 75.0% (9 of 12) of CIN II, 92.0% (23 of 25) of CIN III and 94.7% (18 of 19) of invasive carcinoma (ICa) were positive for at least one type of HPV by the multiplex PCR. HPV 6/11, HPV 16/18 and other HPVs (general) were detected in 86.8% (59/68) were detected in 4.4% (3/68), 50.0% (34/68) and 32.4% (22/68) of cervical carcinomas of patients from Korea, respectively. Conclusion : We also confirmed that multiplex PCR is a simple, convenient, and cost-beneficial technique in simultaneous detection of high and low-risk type of HPV for genetic diagnosis in Korean cervical carcinoma patients.

한국인 조기 난소부전 불임환자에서 황체형성 호르몬 유전자 변이 분석

김남근,이유진,남윤성,이숙환,전혜선,박찬,김종욱,이경아,고정재,차광열,Kim, Nam-Keun,Lee, Eu-Gene,Nam, Yoon-Sung,Lee, Sook-Hwan,Jeon, Hye-Sun,Park, Chan,Kim, Jong-Wook,Lee, Kyung-Ah,Ko, Jung-Jae,Cha, Kwang-Yul 대한생식의학회 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.2

This study was performed to determine whether the $LH{\beta}$-subunit gene missense mutation is present in Korean infertile patients with 46,XX POF women. The variants of $LH{\beta}$ exon 2 (Trp 8Arg; TGG to CGG and Ile15Thr; ATC to ACC) were studied in forty-four 46,XX idiopathic POF and 54 nonpregnant women. The $LH{\beta}$ exon 2 variants were more frequent in POF patients (20.5%) than nonpregnant (16.7%) women (p>0.05). POF patients with the variant was slightly higher than nonpregnant women with the variant.

칼라영상을 이용한 방울토마토 품질 인자 계측에 관한 연구

김대용(Dae-Yong Kim),오현근(Hyun-Keun Oh),이남근(Nam-Keun Lee),김영식(Young-Sik Kim),조병관(Byung-Kwan Cho) 충남대학교 농업과학연구소 2010 농업과학연구 Vol.37 No.2

Surface color is the most important quality factor for the grade evaluation of cherry tomato. Color is one of the representative indicators for the maturity which is closely related to the internal quality of cherry tomato, such as firmness, sugar content, and acidity. This study was carried out to investigate the relationship between surface color and internal quality of cherry tomatoes harvested from both hydroponic and soil culture at different ripening stages . To calculate the color values of cherry tomatoes an automatic color imaging system was constructed. A specially designed image processing algorithm for the color measurement was developed. The color values of L*, a*, b* were calculated from the initial color values of RGB and then compared with the internal quality. Statistical analyses indicated that the internal quality was more highly correlated with the surface color than size of cherry tomatoes. Color image features were also investigated to detect external damage of cherry tomatoes. The value of (R value - R mean value)/R mean value was the most effective image feature for the detection of damaged areas on the surface of cherry tomatoes. The results of this study demonstrated the feasibility of color sorting process as an alternative of the conventional drum type size sorting system for cherry tomato industry.

PCR-SSCP 기법에 의한 조기난소부전 환자의 여포자극호르몬 수용체 (FSH receptor) exon 10 (Thr307Ala; A919G)의 분자변이에 관한 연구

김남근(Nam Keun Kim),이숙환(Sook Hwan Lee),남윤성(Yoon Sung Nam),손태종(Tae Jong Sohn),박상희(Sang Hee Park),박찬(Chan Park),고정재(Jung Jae Ko),차광열(Kwang Yul Cha) 대한산부인과학회 2000 Obstetrics & Gynecology Science Vol.43 No.7

목적 : 본 연구는 46,XX 조기난소부전 불임환자에서 FSH receptione xon 10(Thr307Ala;A919G) 유전자 돌연변이르 탐색하고자 시도하였다. 연구방법 : 그 대상으로 13명의 원인불명 조기난소부전 환자와 4명의 임신 경력이 있는 정상 여성을 대조군으로 조사하였다. 이들을 대상으로 한 돌연변이 탐색은 polymerase chain reaction-single conformation polymorphusm(PCR- SSCP)방법으로 수행되었다. 연구결과 : 여포자극 호르몬 수용체 exon 10의 돌연변이는 정상 대조군과 POF 환자군에서 발견되었다. 결론 : 이 돌연변이가 조기난소부전 환자와 정상 대조군에서 유의한 차이가 있는지는 좀 더 많은 연구가 진행되어야 결론을 내릴 수 있을 것이다. Objective : This study was performed to determine whether the FSH receptor mutation is present in infertile Korean patients with 46,XX premature ovarian failure (POF) women. Methods : The variant of FSH receptor exon 10 in thirteen 46,XX idiopathic POF and 4 healthy fertile (control) women were studied. Missense mutation in Exon 10 was detected in POF patients and healthy fertile women by polymerase chain reaction-single stranded conformation polymorphism (PCR-SSCP).Results : The variant types of FSH receptor exon 10 (Thr307Ala; A919G) were found in healthy fertile (control) and POF women. Conclusion : This mutation may not be specific in POF patients and further study is needed in fertile (control) and POF women.

흰쥐의 뇌조직에서 Protease Inhibitor Nexin - 1 과 N - Methylpurine - DNA Glycosylase 유전자 발현연구

김남근(Nam Keun Kim),황태선(Tae Sun Hwang),김남일(Nam Il Kim),강원석(Won Suk Kang),안정용(Jung Yong Ahn),오도연(Do Yeun Oh),황성규(Seong Gyu Hwang),김병성(Byung Sung Kim),고정재(Jung Jae Ko),(Ki Wha Chung) 한국유전학회 2001 Genes & Genomics Vol.23 No.4

Protease nexin-1(PN-1) is a potent thrombin inhibitor that is identical to the glia-derived neurite promoting factor or glia-derived nexin. It also plays a role in regulating proteolytic activity of plasminogen activator(PA) system. PN-1 is known to be involved in tissue remodeling, cellular invasiveness, matrix degradation and tumor growth. The multifunctional mammalian N-methylpurine-DNA glycosylase(MPG) is responsible for the DNA repair of alkylating damages. In this study, we examined regional differences of PN-1 and MPG transcript in the adult rat brain. Results show a widespread but heterogeneous patterns of expression. These analyses revealed distinct spatial PN-1 and MPG expression patterns in thalamus, olfactory bulb, midbrain, cerebellum, hippocampus, basal ganglia, septal area, spinal cord, pons, cerebral cortex, pituitary gland and medulla oblongata. Interestingly, PN-1 and MPG expressions were found in all tested brain regions with about two-fold differences(p>0.05). The differential regulation of PN-1 and MPG expression across different regions of the rat brain suggests multiple roles in tissue homeostasis and DNA damages.

Molecular Variants of the $LH{\beta}$-subunit in Infertile Patients with Polycystic Ovary Syndrome (PCOS) in Korean Women

김남근,정형민,이유진,남윤성,최동희,손태종,이숙환,고정재,차광열,Kim, Nam-Keun,Chung, Hyung-Min,Lee, Eu-Gene,Nam, Yoon-Sung,Choi, Dong-Hee,Sohn, Tae-Jong,Lee, Sook-Hwan,Ko, Jung-Jae,Cha, Kwang-Yul The Korean Society for Reproductive Medicine 2000 Clinical and Experimental Reproductive Medicine Vol.27 No.2

연구목적: 한국여성의 다낭성 난포증후군 환자에서 황체형성 호르몬 exon 2 유전자의 변이를 탐색하여 이들 변이와 질환과의 관련성 여부를 밝히고자 하였다. 연구재료 및 방법: 21명의 다낭성 난포증후군 환자를 대상으로 황체형성 호르몬 exon 2(Trp8Arg;TGG to CGG and Ile15Thr; ATC to ACC)의 변이를 탐색하였다. 혈액에서 Genomic DNA를 추출하여 PCR로 증폭한 후 RFLP 방법으로 변이형을 구분하였다. 결과: 황체형성 호르몬 exon 2의 변이형이 다낭성 난포증후군 환자에서 28.6%로 이미 조사된 바 있는 대조군의 16.7% 보다 약간 높게 나타났으나 통계적으로 유의한 차이는 없었다(p>0.05). 결론: 황체형성 호르몬 exon 2의 변이가 한국인의 다낭성 난포증후군 발병과 관련이 있는지를 밝히기 위해 더 많은 개체에 대한 연구가 요구된다.