E . coli 에서 돌연변이원에 의하여 유발되는 DNA 상해 회복과 돌연변이 유발기작

백형석,이세영 한국유전학회 1982 Genes & Genomics Vol.4 No.2

N/A

Plasmid pSL100의 curing, segregation 및 segregants 들의 재조합에 관한 연구

백형석,김국찬,이세영 한국미생물학회 1982 미생물학회지 Vol.20 No.1

A study was undertaken to examine the effect of curing agents on the stability, curing and segregation of R plasmid pSL100. And also the stability, transfer frequency, and recombination of its segregants obtained from curing agent treatment were studied. Ethidium bromide, acridine orange, and mitomycin-C were used as curing agent. The results obtained were as follows ; 1. The curing agent ethidium bromide, acridine orange, and mitomycin-C were not effective for curing the multiple antibiotic resistant determinant of pSL100 in Salmonella typhimurium and Escherichia coli. However, they induced plasmid segregation with high frequency in S.typhimuruim LT-2strains. TcApSmCm, TcSmCmKm, TcApCm, TcAp, TcKm, Tc segregants were obtained. 2. The resistant markers of the segregents were transferred to S.typhimurium LT-2 strains with high frequencies whereas they were transferred to E.coli K-12 only with low frequencies. 3. The transconjugants obtained from conjugation between two different S.typhimurium segregants were similar to the phenotype of the original R factor pSL100 and the resistant markers were transferred to the S.typhimurium LT-2 or E.coli strain with equal frequencies, indicating that they are recombinants. 4. The transconjugants obtained from conjugation between pSL100 segrgants and pKM101, or pBR322 possessed the resistant markers of the two parental plasmids and they were transferred to both S.typhimurium and E.coli K-12 strains with the same frequencies and maintained stably, suggesting that they are also recombinants. 5. The recombinant pSL100 could be also obtained in rec A-strains of E.coli, suggesting that the gene function of rec A is required for the recombination of pSL100 segregants in E.coli.

Escherichia coli tRNA^(Phe) 유전자의 restriction mapping

백형석 부산대학교 1988 자연과학논문집 Vol.45 No.-

In order to obtain unmodified phenylalanyl tRNA by run-off transcription method, phenylalanyl tRNA gene and its flanking regions are mapped by restriction endonuclease. AluI, Bsp1286, DdeI, HhaI, HinfI, HpaII, Sau3A, Sau96, and TaqI are used for restriction mapping.

합성세제를 분해하는 미생물의 분리

백형석,안영희,전홍기 부산대학교 1988 자연과학논문집 Vol.45 No.-

This study was carried out to obtain microorganisms having strong synthetic detergent-degrading plasmid. For that purpose, the medium containg sodium dodecylbenzenesulfonate(soft type) as sole source of carbon was employed to isolate synthetic detergent-degrading bacteria in sewages, river waters and soils. Isolated bacteria(152 strains) were examined for primary biodegradation rate of synthetic detergent in the medium by methylene blue-active subtance(MBAS) method and tested for resistance to several metal compounds by metal compound gradient method. Eventually, 13 strains were selected, which having both relatively efficient degradation rate of synthetic detergent and higher resistance to metal compounds.

Aspergillus parasiticus의 Aflatoxin 생성과 돌연변이 유발능에 미치는 인삼 Saponin의 영향

백형석,구재관,전홍기 한국미생물학회 1988 미생물학회지 Vol.26 No.2

The effect of ginseng saponin on aflatoxin(AF) production by Aspergillus parasiticus NRRL2999 and the mutagenicity of produced aflatoxin. The production of aflatoxin were decreased by the addition of ginseng saponin and the most effective concentration was 0.05%. The ratio of aflatoxin $B_{1}$ and aflatoxin $G_{1}$ were not changed by the addition of ginseng saponin. For the nutagenicity test, Ames method were adopted. Mutagenicity of mycelial aflatoxin was decreased by the addition of ginseng saponin on TA98, but not changed on TA100. Mutagenicity of excreted aflatoxin to broth was slightly increased by the saponin on TA98, but decreased on TA100.

Pseudomonas syringae pv. tabaci가 생산하는 tabtoxin의 미생물학적 검색방법에 관한 연구

백형석,구재관,전홍기 한국미생물학회 1989 미생물학회지 Vol.27 No.3

식물의 잎에 세균성 정무늬병을 야기시키는 식울 병원성균인 Pseudomonas syringae pv. tuhaci는 tabtoxin 이라는 phytotoxin 을 생성하는데 이 toxin을 미생물학적으로 간편하게 검색하는 방법플 여러가지 지시균주를 사용하여 각족 배지에서 검토하였다. Minimal A agar medium에서는 tabtoxin 검색에 Agrobactcrium tumefaces가 가장 유용한 균주였으며 minimal glucose agar m$\varepsilon$dium 에서도 역시 마찬가시의 견과를 얻였다 Complex agar medium 에서는 사용된 모든 지시균주에 대해 증식저지환이 형성되지 않아, tabtoxin이 생성되지 않음알수 있었다. 배양온도에 따른 tabtox의 생성능은 $20^{\circ}C$ 빛 $30^{\circ}C$ 에서 최적이였으며 배양시간이 경과함에 따라 tabtoxin 생성량이 증가 하였다. Glutamine을 minimal glucose agar medium에 첨가하여 tabtoxin 에 대한 지시 균주의 반응은 첨 가한 glutamine 의 양이 증가할수록 tabtoxin에 의한 생육억제가 감소함을 알 수 있었다. Tabtoxin produced in Pseudomonas syringae pv. tabace irreversibly inhibits its known physiological target, glutamine synthetase so that causes wildfire disease on leaves of host plant. In this study, we examined a rapid and sensitive microbiological method for tabtoxin assay in several media. In minimal A agar medium nd minimal glucose agar medium, growth inhibition zone of Agrobacterium tumefaciens was larger than that of other indicator strain. However, mostly, growth inhibition zone of indicator strains on the minimal glucose agar medium was smaller than that of on the miniaml A agar medium. In complex agar medium, growth inhibithiton zone was not observed in all the tested indicator strains. Pseudomonas syringae pv. tabaci produced more tabtoxin according to the incubation time. When glutamine was added to the minimal glucose agar medium, growth inhkbition zone of Agrobacterium tumefaciens was reduced.

Salmonella System 에 있어서의 농약의 돌연변이 유발성

백형석(Hyung - Suk Baik),변우현(Woo - Hyun Byeon),전문진(Moon - Jin Chun),이세영(Se - Young Lee) 한국미생물생명공학회 1977 한국미생물·생명공학회지 Vol.5 No.4

Interaction of Plasmid pKM101 Mutator Function with uvrA and uvrB Genes

Baik, Hyung Suk,Park, Hyun Jeong 부산대학교 1986 자연과학논문집 Vol.42 No.-

DNA 회복 기능이 결여된 Escherichia colir 균주에 nurA^(-)와 nurB^(-) mutator 기능을 가진 plasmid pKM101 또는 pSL4를 도입시키고, 돌연변이유발에 DNA 회복에 미치는 pKM101 mutator의 기능 그리고 pKM101과 DNA 회복 기능에 관여하는 유전자와의 상호작용을 조사하였다. 또한 UV와 4-NQO가 유발하는 DNA손상회복과 돌연변이에 있어서의 이들 DNA 회복 유전자의 역할을 조사하였다. 본 연구에서 얻어진 결과는 다음과 같았다. 1. DNA 회복 기능이 결여되어 있는 E. coli B/r 균주에 pKM101 또는 pSL4를 도입시킬 때의 빈도는 10^(-4)-10^(-6)이었으며 균주내에서 안정하였다. 2. E. coli B/r 균주에 pKM101 또는 pSL4를 도입시키면 자발적 인돌연변이율은 증가되었는데 pSL4가 도입되었을 때가 pKM101이 도입되었을 때보다 전반적으로 자발적 돌연변이율이 더 증가되었다. 3. uvrA^(-) 균주에서 pKM101과 pSL4는 UV나 4-NQO에 의한 돌연변이에는 아무 영향도 미치지 못하였다. 4. uvrB^(-) 균주는 UV와 4-NQO에 대해 민감하였으나 uvr+에 대해서는 민감하지 않았다. uvrB^(-) 균주에서 pKM101과 pSL4 모두 UV에 대한 보호효과를 나타내었다. uvrB-돌연변이는 4-NQO에 의한 돌연변이를 강하게 증가시켰으며 UV에 의한 돌연변이에는 아무런 영향을 미치지 않았다. uvrB^(-) 균주에 pKM101이나 pSL4가 도입되면 4-NQO에 의한 돌연변이에는 강하게 증가시켰으며 UV에 의한 돌연변이에는 아무런 영향을 미치지 않았다. uvrB^(-) 균주에 pKM101이나 pSL4가 도입되면 4-NQO에 의한 돌연변이에 대해서는 억제 효과를 나타내었으나 UV에 의한 돌연변이에 대해서는 아무런 영향을 미치지 못하였다. 5. UV나 4-NQO에 의한 DNA 상해의 회복은 uvrB 유전자의 기능이 관여하는 같은 DNA에 의하여 진행된다고 생각되지만 이들 돌연변이원에 의한 돌연변이 유발은 서로 다른 기작에 의하여 진행되는 것 같았다. 6. 본 연구의 결과를 근거로 해서 다음과 같은 가설을 세울 수 있다. 즉, pKM101의 mutator 효과와 돌연변이원에 대한 보호 효과는 플라스 미드의 한 유전자의 기능에 의한 것이며 이 유전자 산물은 error-free DNA 회복과 error-prone DNA 회복 system 양쪽 다에 상호작용을 가지며 어떤 돌연변이원에 의해서 uvrA-와 uvrB^(-)군주에서 나타난 pKM101의 anti-mutator 효과는 이 pKM101 유전자 산물이 error-prone DNA 회복 기능을 억제함으로써 더 많은 error-free DNA회복을 유발하여 나타나는 것이라고 생각할 수 있다. A plasmid with mutator effect, pKM101, and its mutant pSL4 were introduced into Escherichia coli B/r strains possesing DNA repair capacities (uvr A^(-) and uvr B^(-)) and determined the function of pKM101 mutator in the mutagenesis and DNA repair and their interactions with DNA damage and the mutagenesis induced by mutagens (UV and 4-NQO). The following results were obtained. 1. The transfer frequencies of pKM101 and pSL4 to E. coli B/r repair deficient mutants were in the range of 10^(-4) to 10^(-6) and the plasmids were maintained stably in the cells. 2. Whenplasmid pKM101 or pSL4 was introduced into the E. coli B/r strains, the spontaneous mutation rate was increased. The effect of pSL4 was generally more pronounced than that of pKM101. 3. The uvrA^(-) strain was sensitive to UV and 4-NQO. Both plasmid pKM101 and pSL4 had a protection effect against UV and 4-NQO. The uvrA^(-) mutation increased the mustagenesis induced by 4-NQO and had no effect on the UV-mutagenesis. Both plasmid pKM101 and pSL4 had no effect on the UV- and 4-NQO mutagenesis in the uvrA^(-) strain. 4. The uvrB strain was sensitive to UV and 4-NQO. Both plasmid pKM101 and pSL4 had a protection effect against UV but only pSL4 showed the protection effect against 4-NQO in the uvrB- strain. The uvrB^(-) mutation sharply increased the 4-NQO mutagenesis and had no effect on the UV-mutagenesis. 5. The DNA lesions caused by the UV and 4-NQO treatment seems to be repaired by the same repair processes involng the functions of the uvrB gene. However, different processes seems to be involved in the mutagenesis induced by these two mutagens. 6. On the basis of results obtained in this work, it was postulated that the mutator effect and the mutagen protection effect of pKM101 may be the results of the plasmid codes one gene function and that the gene product may interact with both the error-free DNA repair and error-prone DNA repair system. The anti-mutator effect of pKM101 seen in the uvrA- and uvrB^(-) strain for certain type of mutagenes may be due to the pKM101 gene product interferring the error-prone repair processes by inducing more error-free DNA repair.

Trichoderma viride 의 변이균주 분리를 위한 Cellulase Semiquantitative Plate Assay

현형환,백형석,이인복,이세영 ( Hyung Hwan Hyun,Hyung Suk Baik,In Bok Lee,Se Yong Lee ) 한국미생물생명공학회 1978 한국미생물·생명공학회지 Vol.6 No.3

SOS repair에 관여하는 umuDC 유전자

이상률,백형석,전홍기 한국생명과학회 1993 생명과학회지 Vol.3 No.3

E. coli에서 UV 및 다른 많은 화학 돌연변이원에 의해서 유발되는 돌연변이는 chromosome의 umuDC operon이 필요하며, 이 유전자는 DNA 손상을 복구하고 UV나 화학물질에 대한 저항성을 증가시카는 DNA repair 기능을 활성화 시킨다. umuDC operon은 chromosome에 산재해 있고 16개의 다른 유전자로 구성된 E. coli SOS regulation의 한 유전자인데, umu 유전자는 한 operon에 의해 조절되는 umuD와 umuC로 구성되어 있다. 본고에서는 SOS repair에 관여하는 유전자들 중에서 umuDC 유전자를 중심으로 분자생물학적인 연구과정 및 연구결과를 서술하였다.