리눅스 클러스터기반 유전자서열분석 병렬처리 모형 개발 및 성능 검증

박미화(Mi Hwa Park),김재우(Jae Woo Kim),박춘구(Chungoo Park),유승식(Seung Sik Yoo) 한국정보과학회 2003 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.30 No.1A

Human Genome Project와 같은 대형 Sequencing 프로젝트와 High-throughput Sequencing 기술의 발전으로 현재 Expressed Sequence Tag(EST)와 같은 대량의 DNA 서열들이 생산되고 있다. 이를 효과적이고 효율적으로 분석해야 할 필요성이 증대되고 있다. 대부분의 실험자들의 서열 분석을 위해 우선적으로 BLAST 검색을 이용하고 있다. 하지만 대량의 서열, 검색 DB의 크기, BLAST 검색 결과의 복잡성에 의해 어려움을 겪고 있다. 이에 빠르고 정리된 결과를 보여줄 수 있는 BLAST 검색 시스템의 필요성이 커지고 있다. 이에 본 논문은 미국생명공학연구소(NCBI)에서 제공하는 유전자 서열 검색 툴인 BLAST(Basic Logical Alignment Tool)를 클러스터수퍼 컴퓨터 구축 기술을 기반으로 한 병렬처리와 Gene Ontology를 이용하여 방대한 양의 서열 검색 결과를 요약하는 모형을 제시한다. 이것은 신약개발 및 유전자 발굴 등의 연구기간을 획기적으로 단축시켜 신약 개발, 농업, 화학, 의료, 환경 등 생명공학 연구에 핵심적인 역할을 할 수 있다. 또한 성능 실험을 통하여 분석결과 대기시간을 최소화하는 병렬처리모형의 효율성을 검증하였다.

전나무 잎 추출물이 알코올 대사 효소활성과 H₂O₂ 및 에탄올로 유도된 HepG2 세포에서의 세포사멸에 미치는 영향

박미화(Mi Hwa Park),최영주(Young Ju Choi),김윤세(Yoon Se Kim),정경임(Kyung Im Jung) 한국식품영양과학회 2022 한국식품영양과학회지 Vol.51 No.6

본 연구에서는 전나무 잎 추출물이 알코올 분해 활성(ADH, ALDH)에 미치는 영향을 알아보고, H₂O₂ 및 알코올로 손상된 간세포의 apoptosis 과정에서 전나무 잎 추출물이 미치는 영향을 확인하기 위해 H₂O₂와 에탄올을 이용하여 HepG2 인간 간암 세포주에 산화스트레스를 유도한 후 항산화 효과와 간세포 보호 효과를 확인하였다. 알코올 분해의 1차 효소인 ADH 활성과 1차 대사산물인 아세트알데하이드를 분해하는 ALDH 활성에 대한 전나무 잎 추출물의 효과를 확인한 결과, 두 가지 효소 모두 전나무 잎 추출물에 농도 의존적으로 증가하였으며(P<0.05), 1 mg/mL 농도에서의 ADH 및 ALDH 활성은 각각 155.53% 및 130.89%로 나타났다. 산화적 스트레스 및 알코올성 간 손상으로부터 전나무잎 추출물의 효과를 검증하기 위하여 H₂O₂ 및 에탄올로 스트레스를 유도한 HepG2 세포에 전나무 잎 추출물을 처리한 결과 H₂O₂ 및 에탄올 단독 처리구에 비해 세포생존율은 유의적으로 증가하였다(P<0.05). H₂O₂ 및 에탄올로 유도된 HepG2 세포의 ROS level은 전나무 추출물에 농도 의존적으로 현저하게 감소하였다(P<0.05). 전나무 잎 추출물이 H₂O₂ 및 에탄올로 유도된 HepG2 간세포의 apoptosis에 미치는 영향을 알아보기 위해 Bax, Bcl-2 및 caspase-3 유전자의 단백질 발현 정도를 측정하였다. H₂O₂ 및 에탄올로 처리된 배지에서 배양한 HepG2 세포에서의 pro-apoptotic gene인 Bax 유전자 발현은 증가하였으나 전나무 잎 추출물의 처리에 의해 발현이 감소하였다(P<0.05). 또한 H₂O₂ 및 에탄올로 처리된 배지에서 배양한 HepG2 세포에서의 anti-apoptotic gene인 Bcl-2 유전자의 발현을 측정한 결과 H₂O₂로 간 손상을 유도했을 때 Bcl-2의 발현은 전나무 잎 추출물의 처리에 의해 증가하였으나(P<0.05), 에탄올로 간독성을 유도했을 때는 전나무 잎 추출물 처리에 의한 발현량 변화는 나타나지 않았다. Caspase-3 단백질 발현을 측정한 결과, H₂O₂ 및 에탄올로 간독성을 유도했을 때는 발현이 증가했으며, 전나무 잎 추출물 처리 시 발현을 감소시켜 산화적 손상 및 apoptosis 보호 효과를 확인하였다. 따라서 본 연구 결과 전나무 잎 추출물은 알코올 분해 활성과 함께 산화적 스트레스 및 알코올성 간독성으로 인한 ROS level을 낮추고 산화적 스트레스 및 알코올에 의한 apoptosis를 효과적으로 억제하여 간독성에 대한 보호 효과가 있는 것으로 판단된다. This study investigated the protective effect of the Abies holophylla leaf extract on the alcohol metabolism enzyme activity and against H₂O₂ and ethanol-induced oxidative stress in HepG2 cells. The effect of Abies holophylla leaf extract on alcohol metabolism was determined by measuring the generation of reduced nicotinamide adenine dinucleotide (NADH) by alcohol dehydrogenase (ADH) and acetaldehyde dehydrogenase (ALDH). ADH and ALDH activities of Abies holophylla leaf extract were increased in a dose-dependent manner (P<0.05), and were determined to be 155.53% and 130.89% at 1 ㎎/mL concentration, respectively. Exposure to the Abies holophylla leaf extract resulted in decreased levels of reactive oxygen species production in H₂O₂ and ethanol-induced HepG2 cells (P<0.05). Moreover, H₂O₂-induced HepG2 cells treated with the Abies holophylla leaf extract showed reduced expression of the pro-apoptotic protein Bax and increased expression of the anti-apoptotic protein Bcl-2 (P<0.05). Furthermore, Abies holophylla leaf extract treatment significantly decreased the protein expression of Bax in ethanol-induced HepG2 cells (P<0.05). However, the protein expression of Bcl-2 remained unaltered. Treatment with the Abies holophylla leaf extract also reduced the caspase-3 protein expression in H₂O₂ and ethanol-exposed HepG2 cells. In conclusion, our results indicate that the Abies holophylla leaf extract exerts a cytoprotective effect against H₂O₂ and ethanol-induced cell damage. We believe that the Abies holophylla leaf extract has the potential to be developed as a natural hepatoprotective agent.

악기놀이 활동이 뇌성마비유아의 감각-운동 및 의사소통에 미치는 효과

박미화 ( Mi Hwa Park ),고승혜 ( Seung Hye Ko ) 한국특수교육문제연구소 2006 특수교육저널 : 이론과 실천 Vol.7 No.4

이 연구의 목적은 악기놀이 활동이 뇌성마비유아의 감각-운동 및 의사소통 발달에 미치는 효과를 알아보는 것이었다. 연구대상은 경기도 G시에 위치한 일반 어린이집에 통합되어 있는 뇌성마비유아 3명이었다. 연구설계는 사례연구로 악기놀이의 효과를 확인하기 위해 사전-사후 설계를 이용하여 8주간 주 5일 매회 30분씩 악기놀이 활동 프로그램을 실시하였다. 악기놀이 활동은 뇌성마비유아의 감각-운동의 하위영역인 자세유지, 이동능력과 조작능력향상에 효과가 있었으며, 의사소통능력 향상에도 효과적인 것으로 나타났다. 악기놀이 활동에 대한 경험은 움직임에 제한을 가지고 있는 뇌성마비유아들에게 신체적, 정서적으로 만족감을 주고 감각-운동발달에도 긍정적인 변화와 발달을 유도한다고 볼 수 있다. The purpose of this study was to investigate the effect of playing instrumental activity to sensory movement and communication development of cerebral palsy. The subject of this study were the children with cerebral palsy, who are attending at a regular pre-kindergarten located in G city, Gyeonggi province. The research design was an one group pretest-posttest. The MEPA-II was used for the pretest. Playing an instrumental activity was applied to the subject for 30minutes a day, 5days a week of 8 weeks. After treatment, the posttest was employed. The major results were as the follows. Playing the instrumental activity positively influenced to enhance sensory motor skill of cerebral palsy such as posture locomotion and manipulation as were as communication. It also highly assistance improve in manipulation domain. * Experience with severe instrumental activity allowed limited several with physically, emotionally, and to induce positive changes and development by direct experiencing, feeling, and perception in the process of playing instrumental activity.

초등학교 통합학급 담임교사의 장애학생 지도에 대한 교사효능감과 수업의 질 향상을 위한 교수적 수정 실행 분석

박미화 ( Mi Hwa Park ),송명숙 ( Myong Suk Song ) 한국특수교육문제연구소 2010 특수교육저널 : 이론과 실천 Vol.11 No.1

이 연구는 초등학교 통합학급 담임교사의 배경변인에 따른 장애학생 지도에 대한 교사효능감과 수업의 질 향상을 위한 교수적 수정 실행정도를 파악하고, 두 변인의 상관관계를 알아보는데 목적이 있었다. 이를 위해 특수학급이 설치된 초등학교 42개교의 통합학급 담임교사166명을 대상으로 교사효능감과 교수적 수정 실행정도를 묻는 설문지를 통해 자료를 수집하였다. 연구 결과는 다음과 같다. 첫째, 통합학급 담임교사의 교사효능감은 전반적으로 보통수준이었다. 둘째, 통합학급 담임교사의 교수적 수정 실행은 물리-사회적 환경조성이 보통 수준으로 실행되고 있고, 교수내용 및 방법수정은 보통이하로 실행하고 있었다. 셋째, 통합학급 담임교사의 교사효능감과 교수적 수정 실행은 정적 상관관계가 있는 것으로 나타났다. 통합학급 담임교사에게 장애학생을 이해할 수 있는 다양한 연수와 장애학생을 접하고 지도해볼 수 있는 다양한 경험을 제공하고, 통합학급 운영을 위해 특수교사와의 협의를 자주 가질수 있도록 그리고 협력교수를 실행할 수 있도록 여건을 마련해 준다면 통합학급 담임교사의 교사효능감이 높아질 것이며, 수업의 질을 향상하기 위한 교수적 수정의 실행정도를 높일 수있을 것이다. The purpose of this study is to determine the self-efficacy of the inclusive classroom teachers in elementary schools and to describe their performance of the instructional adaptations for teaching. The subjects for the study were 166 inclusive classroom teachers drawn from 42 elementary schools which had inclusive classrooms integrating non-regular students into a regular classroom. A questionnaire was used for data collection. It was the first conclusion that the level of self-efficacy among inclusion classroom teachers was neither high nor low. Second, the level of adapting to the physical-social environment was at the average; however the level of adapting to their teaching contents and methods was below the average. Third, the level of the self-efficacy is directly proportional to that of the instructional adaptations. Ergo, in order to enhance the level of self-efficacy of the inclusion classroom teachers. it is necessary to provide inclusive classroom teachers with various in-service training, the opportunities to contact and teach disabled students, and the chances for the teachers to discuss with special teachers for management of inclusive classrooms. Therefore, to the augment quality of the instructional adaptation usage, it is required to have certain conditions that can buttress the teachers’ initiation of using the collaboration teaching method.

간호대학생이 지각한 간호사 이미지에 관한 연구

박미화(Mi Hwa Park),양진주(Jin Ju Yang) 한국간호행정학회 2002 간호행정학회지 Vol.8 No.1

악교정 수술후 근주와 자가통증조절장치(PCA)의 제통효과 비교

박미화(Mi-Hwa Park),김재현(Jae-Hyun Kim),백상흠(Sang-Heum Baek),차두원(Duwon Cha),이상한(Sang-Han Lee) 대한구강악안면외과학회 2005 대한구강악안면외과학회지 Vol.31 No.3

Patient-controlled analgesia (PCA) has been widely used for postoperative pain control in medical surgery parts. Conventional intramuscular analgesia(IMA) is also effective in postoperative pain control, but it has some disadvantages that depend on patients’perception of pain and the anxiety that they endure caused by the delay of the injection time. This study was conducted to assess the efficacy and postoperative outcomes of intravenous PCA compared to IMA injections in 36 patients (BSSRO). Three factors were compared: amount of pain in PCA and IMA group ; amount of pain according to the sex in PCA and IMA group and the amount of pain according to the analgesia use. Results of this study did not demonstrate a statistically significant difference in any of these, using a p value of 0.05. The results of this study were as follows. : 1. There was no statistically significant difference in VAS pain score between IMA group and PCA group. 2. There was no statistically significant difference according to the sex. 3. There was no statistically significant difference according to the amount of PCA. The history of PCA is about 30 years and many literatures have reported about its effects, complications, methods, advantages and disadvantages. So, this study has some limitations of small sample size to conclude the effects of PCA. But when the decision about the method for postoperative pain control has to be made, it should be made based on patient or physician preference and cost factors rather than on the trend.

기혼남녀가 지각한 원가족 건강성과 부부적응의 관계에서 자기자비와 갈등대처방식의 순차적 매개효과

박미화(Park, Mi Hwa),홍지영(Hong, Ji Young) 학습자중심교과교육학회 2019 학습자중심교과교육연구 Vol.19 No.14

본 연구는 원가족 건강성과 부부적응 관계에서 자기자비와 갈등대처방식(이성적 대처, 감정 및 행동표출, 회피)이 순차적으로 매개하는지 검증하고자 하였다. 이를 위하여 J지역에 소재하고 있는 기혼남녀 450명을 대상으로 설문지를 실시하였고 이 중유효한 응답자료 431명을 최종분석자료로 사용하였다. 측정도구는 원가족 건강성 척도(FOS-16), 한국판 부부적응 척도(RDAS), 자기자비 척도(K-SCS), 갈등대처방식 척도를 활용하였다. 변인들 간 관계를 살펴보기 위해 Hayes(2013)의 순차적 중다매 개효과 검증을 실시하고, 부트스트레핑(Bootstrapping) 방법으로 간접효과의 유의성을 검증하였다. 분석 결과 첫째, 원가족 건강성과 부부적응의 관계에서 자기자비의 부분매개효과가 나타났다. 둘째, 원가족 건강성과 부부적응의 관계에서 갈등대처방식의 하위요인으로 이성적 대처, 감정 및 행동표출, 회피에서 각각 부분매개효과가 나타났다. 셋째, 원가족 건강성과 부부적응의 관계에서 자기자비와 갈등대처방식(이성 적대처, 감정 및 행동표출, 회피)의 순차적 매개효과가 유의했다. 이러한 결과는 원가족 건강성과 부부적응의 관계에서 자기자비와 갈등대처방식이 순차적으로 주요한 영향력이 있음을 나타내는 것으로, 부부 적응 수준을 증진하기 위해서는 원가족 건강성을 다루는 전략 뿐 아니라 자기자비의 태도와 합리적인 갈등대처방식을 훈련하는 것이 효과적임을 시사한다. This study aimed to verify that the self-compassion and the conflict coping method(rational coping, emotional and behavioral expression, avoidance) are meditating in sequence in relation to the marital adjustment and the family of origin health. For that this study gave questionnaires to 450 married couples living in J area, of them, used 431 persons as effective answers for a conclusive analysis data. As measuring tools, used the family of origin health scale(Fos-16), marital adjustment scale of Korean version(RDAS), self compassion scale(K_SCS), conflict coping method. For checking a relationships between the variables, surveyed a Hayes(2013)’s sequential multi meditating effects’ verification and through a Bootstrapping’s method, made a verification of the validity of indirect effect. To sum up this study’s results, First, in relations with marital adjustment and home of origin health the self compassion’s partial meditating effects was found. Second, each partial meditating effects was found in the rational coping, emotional and behavioral expression, avoidance as a sub factors of the conflict coping method in relations with the marital adjustment and the home of origin health. Third, from the relations with the family of origin health and the marital adjustment the sequential meditating effects of the self compassion and conflict coping method(rational coping, emotional and behavioral expression, avoidance) was effective. Those result is related to the home of origin health and the marital adjustment, also, suggest there is a path that self compassion and the conflict coping method sequentially undergo, and is expected to contribute in promoting the couple relationship’s adaptation level of the married person oriented consultation.

조선족학교 음악교재에 반영된 다문화 내용 분석 연구

박미화(Park, Mi Hwa) 건국대학교 인문학연구원 2014 통일인문학 Vol.60 No.-

본 연구의 목적은 중국 조선족학교 음악교육의 현황을 살펴보고, 새로운 음악교육과정에서 반영된 다문화적 내용은 어떠한지, 이러한 다문화적 관점을 교과서에서 얼마나 충실히 다루고 있는지를 분석함으로써 향후 바람직한 음악교과서의 개선 방향에 도움을 주고자 하는데 있다. 본 연구의 결과를 정리하면 다음과 같다. 첫째, 조선족학교 음악교육은 초, 중학교를 통합한 “의무교육 음악과정표준”에 준하여 이루어지고 있으며, 음악과정의 내용은 감수와 감상, 표현, 창조, 음악과 관계되는 문화 등 4개 영역으로 나누었으며 각 영역별 내용 표준에서는 다양한 나라와 민족의 음악문화를 체험하도록 하는 다문화적 내용 요소들이 반영되어 있었다. 둘째, 교과서에 수록된 민요곡 수는 전체 게재곡의 13.17%의 극히 낮은 비율을 차지하였고, 조선 민요는 외국 민요에 비해 5.9% 더 높은 차이를 나타냈으며, 수록된 민요들은 대부분 아세아와 유럽의 곡들에 편중되어 있었다. 세계의 다양한 문화권의 음악을 체험할 수 있도록 많은 나라와 지역의 민요를 고르게 수록해야 할 것이다. 셋째, 교과서는 악곡선정 취지에서 다문화적 내용 요소와 활동 요소들을 포함하고 있지만 다른 문화를 이해시킬 수 있는 관련 자료들이 수록되어 있지 않았다. 보다 효율성이 있는 다문화 교육이 이루어지게 하기 위해 교과서에 민요의 배경, 그 지방의 특징 및 역사성과 관련된 설명을 좀 더 상세하게 제시하는 것이 바람직하다. This essay aims to view the situation of Chinese Korean musical education and the multi-culture reflected by the musical education, and analyze the degree of multi-culture embodying in music textbooks to contribute to musical textbook improvement. The consequence of this essay as follows. First, the Chinese Korean musical education includes junior high school musical education and senior high school musical education. And the content includes four aspects, such as appreciation, presentation, creation and the culture about music. Every aspect asks for the cultural experience from different countries and nationalities which could reflect the multi-culture. Second, the folk music in textbooks accounts for 13.17%, a all this musical form. The Koreanfolk music accounts 5.9% more than foreign folk music, and most of them from Asia and Europe. All of different music should be included in order to experience different folk music from different countries and nationalities. Third, the textbooks just include the contents and activities of multi-culture, but don’t include the relative information of multi-culture. The textbooks should include the background, characteristics and the historical explanations of the folk music in order to make the multi-culture education more effectively.

도시 가로공간 가로시설물의 이용실태 개선방안에 관한 연구

박미화(Park, Mi-Hwa),유응교(Yu, Eung-Kyo) 한국생태환경건축학회 2007 한국생태환경건축학회 논문집 Vol.7 No.4

고품질 산머루 와인 제조를 위한 Tannin 강화 조건 확립

박미화(Mi-Hwa Park),이정옥(Jeong-Ok Lee),김은정(Eun-Jung Kim),김종원(Jong-Won Kim),이효형(Hyo-Hyung Lee),김희훈(Hui-Hun Kim),이상인(Sang-In Lee),김영훈(Young-Hun Kim),류충호(Chung-Ho Ryu) 한국식품영양과학회 2008 한국식품영양과학회지 Vol.37 No.7

국내산 산머루 와인의 품질을 향상시키기 위하여 와인의 맛을 결정하는 중요한 기능성 인자인 tannin 성분을 강화시키기 위한 조건을 확립하고 tannin이 강화된 산머루 와인의 품질 특성을 조사하였다. 산머루 와인용 tannin을 강화하기 위한 최적 tannin 추출 조건은 녹차를 40℃에서 주정으로 추출하는 것이 가장 높은 추출율을 나타내었다. 고품질 tannin 강화 산머루 와인 제조를 위한 tannin 첨가 최적 농도는 6.5 ㎎/mL이며 산머루 와인 발효 전에 첨가하는 것이 효율적으로 생각되어 산머루 와인 제조 시 발효 전 최종 tannin 농도를 6.5 ㎎/mL로 조절하여 발효하였다. 최적 발효 조건으로 제조된 tannin 강화 산머루 와인의 pH, 산도, 알코올 함량, 총당, polyphenol, tannin 및 resveratrol 함량을 측정하고 수입 와인 3종과 품질 특성을 비교한 결과, tannin 강화 산머루 와인은 pH 3.69±0.01, 산도 0.96±0.01%, 알코올 함량 12.20±0.01%, 총당 60.00±1.15 ㎎/mL, polyphenol 함량 79.50±0.55 ㎎/mL, tannin 함량 7.40±0.05 ㎎/mL 및 resveratrol 함량 5.00±0.11 ㎎/mL로 기능성 물질 함량이 매우 높아 품질이 우수하고 단맛, 떫은맛과 산머루 자체의 강한 신맛이 균형을 이룬 산머루 와인으로 평가되었다. 본 연구에서 검색된 조건으로 tannin을 추출하여 산머루 와인의 tannin을 강화함으로써 기존의 산머루 와인에 비해 단맛과 떫은맛이 강화되었으며, 머루 자체의 강한 신맛과 잘 어우러져 고급 와인의 평가 기준이 되는 단맛, 떫은맛, 신맛이 적절하게 균형을 이룬 고품질의 산머루 와인을 제조할 수 있을 것으로 사료된다. Wild grapes contain lots of organic acids, vitamins and inorganic salts compared to other fruits. Also, it has known to have excellent effects on preventing cancer and heart disease. Wild grapes are supposed to be superior material for fermentation of wine. Tannin contents of wine, which is an important functional factor in flavor of wine, were enhanced to develop quality of Korean wild grape wine. In this study, we investigated tannin extraction conditions and analyzed quality properties of tannin-enhanced wild grape wine. The most suitable tannin extraction condition for enhancing tannin of wild grape wine was extraction of tannin from green tea using spirits at 4oC. For producing high quality wild grape wine, added concentration and time of tannin extract were 6.5 ㎎/mL before wild grape wine fermentation. Tannin contents of tannin-enhanced wild grape wine was 7.4±0.05 ㎎/mL. Quality properties of tannin-enhanced wild grape wine fermented under optimized fermentation conditions were analyzed. pH, acidity and alcohol contents were 3.69±0.01, 0.95±0.01% and 12.2±0.03%, respectively. Total sugar, tannin, polyphenol and resveratrol contents of tannin-enhanced wild grape wine were 60.00±1.15 ㎎/mL, 79.50±0.55 ㎎/mL, 7.40±0.05 mg/mL and 5.00±0.11 ㎎/mL, respectively showing significantly higher value than that of commercial wine. Production of high quality wild grape wine is expected with the establishment of optimum fermentation condition and tannin-enhancing process of wild grape wine.