Rhizopus속의 histones에 관한 연구

민병례,이은영 한국미생물학회 1990 미생물학회지 Vol.28 No.2

고등한 진핵생물에서 nucleosome 구성에 중요한 역할을 하는 histone 단백질이 하등한 진핵생물에서도 존재하는지의 여부를 알아보기 위하여 실험을 하였다. 하등한 균류에 속하는 Rhizopus 속의 5종(R. acidus, R. arrhizus, R. formosaensis. R R. japoηicus, R. oryzae)을 재료로 하여 15% polyacrylamide acid-urea gel과 18% P이yacηlam ide SDS-gel을 이용하여 전기영동하였다. 분자량을 비교하기 위하여 marker protein으로 Cytochrome C와 함께 15% polyacrylamide SDS-gel을 이용하였으며 모든 gel에서 standard로써 calf thymus histone을 사용하여 electrophoreticmobility를 비교하였고 호 한 속내에서의 종간의 차이가 있는지를 설험하였다 실험결과는 한 속내에서 종에 따른 차이로 볼 수 없었으며 standard인 calf thymus histone HI. H2A, H2B, H3, H4와 유사한 electromobility흘 갖는 protein band를 확인할 수 있었으며 HI histone은 t성확하게 일치되지가않았다.따라서 하등한균류인Rhizopµs에서도고등 진핵생불과유사한단백질이 존재함을 주정할 수가 있었다. The chromatin of all higher eukaryotic cells contains a group of very basic low-mole-cular weight proteins, the histones. But much less is known about histones in lower eukaryotes. Our purpose was to study the histones of the genus Rhizopus. After isolation and purification of nucleoprotein the basic nucleoproteins were analyzed by gel electrophoresis, in sodium dodecyl sulfate as well as acid/urea gels and compared with calf thymus histones. Their electrophoretic mobility in polyacrylamide gel indicate that they are histone homologous, although not identical, to the H2A, H2B, H3 and H4 histones of mammals with the exception of H1. The result suggests that Rhizopus thus appears to contain histone proteins which are homologous to the histones from in higher eukaryotes. The similarity between the calf thymus histone H1 and the Rhizopus high band group remains to be discussed.

Fusarium section Elegans에 속하는 균주들의 핵형 분석

민병례 상명대학교 자연과학연구소 2004 自然科學硏究 Vol.13 No.-

Fusarium moniforme와 F. subglutinans의 Chitinase activity

민병례 상명대학교 자연과학연구소 2004 自然科學硏究 Vol.12 No.-

Fusarium속의 염색체 분석

민병례 한국미생물학회 1989 미생물학회지 Vol.27 No.4

Fusarium 속의 20균주를 PDA 배지에서 배양하고. HCI-Giemsa 염색법을 이용하여 균사 내에서의 영양핵의 핵분열을 관찰하였고, 염색체 수를 세었다. 관찰한 모든 Fusarium 속의 균주들익 염색체 수는 4-8개 사이에 있었다. 그 중에서 3균주인 F. solari S Hongchun D4. F. moniiforme(from banana), F. raphani (from radish)는 n=8개이고, F, solani 7468(from Sydney), F, solani 7475 (from Sydney), F, oxyporum (from tomato), F, oxyporum(from tomato). F F. roseum(from rice), F, sporotrichioides C. Jungsun 1, F. avenaceum C Kosung 6. F, avenaceum46039 등의 7균주에서는 n=7개였다 F. monilzfonne (from rice), F. graminellrum, F. probiferatum 6787(from Sydney), F. anguioides ATCC20351의 5균주는 n=6개 F. moniliforme NRRL2284. F. poae NRRL3287. F. tricintum NRRL 3299의 3균주는 n=5개였고 가장 적은 수의 n=4개인 균주로는 F. sporotrichioides NRRL3510과 F. equiscli KFCC 11843 IFO 030198의 3균주였다. 이상의 균주들의 염색체 수를 비교 고찰할 때 Fusarium 속의 기본 염색체 수는 반수체가 4개이며 종 분화과정에서 이수체와 배수체가 되었을 것으로 추론된다. by use of HCl-Giemsa technique and light microscope, dividing vegetative nuclei in hyphae of Fusarium species were observed and the results are summerized. The chromosome number of these fungi was ranged 4 to 8. Of the 20 strains, the highest haploid chromosome number is 8 in F. solani S Hongchun K4, F. moniliforme (from banana) and F. raphani (from radish). The lowest is 4 in F. sporotrichioides NRRL 3510 and F. equiseti KFCC 11843 IFO 30198. F. solani 7468 (from Sydney), F. solani 7475 (from Sydney), F. oxysporum(from tomato). F. roseum (from rice), F. sporotrichioides C Jngsun 1, F. equiseti C Kosung 1 and F. avenaceum 46039 are n=7. F. moniliforme (from rice) F. graminearum, F. proliferatum 6787 (from Syndey), F. proliferatum 7459 (from Synder) and F. anguioides ATCC 20351 are n=6. F. moniliforme NRRL 2284, F. poae NRRL 3287 and F. trincinctum NRRL 3299 are n=5. From these results, it may be concluded that the basic haploid chromosome number of the genus Fusarium is 4 and mat have been evolutionary variation of chromosome number through aneuploidy and polyploidy.

토양에 존재하는 미생물세포와 포자의 PCR 검출을 위해 소량의 DNA Sample 준비를 위한 방법

민병례,김정은 상명대학교 자연과학연구소 2004 自然科學硏究 Vol.12 No.-

Fusarium 종에서의 RAPD-PCR분석

민병례,양연주,최영길 한국미생물학회 1999 미생물학회지 Vol.35 No.2

Fusarium 균에 속하는 16종 21균주를 대상으로 RAPD-PCR 방법을 이용하여 DNA 다형성을 분석하여 계통 유전학적 유연관계를 검토하였다. 40개의 random primer 로 시험하여 실험한 모든 종에서 다형성을 나타내는 11개의 primer를 선별하였다. RAPD 분석결과 평균 23.9개씩 모두 263개의 크기가 다른 RAPD 밴드들을 조사할 수 있었다. 각 primer에 대해 각각 독특한 DNA 다형성을 나타내었고, 증폭된 DNA 크기는 0.1-3.0 kb 범위에서 형성되었다. 각 균주간의 genetic similarity를 계산하여 유연관계를 dendrogram 으로 나타내었다. Genetic similarity 0.627을 기준으로 하여 크게 4그룹으로 나눌 수 있었다. To assess genetic diversity amoug 21 strains from sixleen Frrsn~i~nn species , we used RAPD(rando1n amplified pol.ymorphic DNA) analysis based on PCR(po1ymerase chain reaction). Eleven primers showing Ule polymorphism were chosen from the 40 random pnmers-tcstcd. A total of 263 polymorphic bands were generated by the primers and the size of amplified DNA fragments ranged from 0.1 lo 3.0 kb. Sirnilku-it), coefficients between strains were calcnlatcd, and UPGMA cluster analysis was used to generate a dendrogram showing relationships among them. The results from RAPD-PCR analysis were grouped into four main groups at the si~nilarity level of 0.627.

Fusarium 속에서 PFGE 를 이용한 Electrophoretic Karyotyping

민병례,정진숙,최영길 ( Byung Re Min,Jin Sook Jung,Yong Keel Choi ) 한국균학회 1998 韓國菌學會誌 Vol.26 No.2

Rhizopus 속내의 2종에 대한 단백질 분석

민병례,이주향 상명대학교 기초과학연구소 1996 기초과학연구 Vol.9 No.-

산업적, 공업적, 경제적, 의학적으로 중요한 균종중의 하나인 Rhizopus에 속하는 2 균종중 phylogeny상 유연관계가 상당히 먼 2종 R acidus 와 R. stolonifer를 택하여 이들의 유전자 발현 산물인 단백질 patterns을 관찰한 결과 SDS-PAGE로 분리한 단백질 patterns은 분자량 14,400 daltons에서 97,400 daltons사이에 30개 이상의 polypeptide bands를 볼 수 있었고, 2종간의 bands에서는 큰 차이를 볼 수 없었다. 등전점을 이용한 IEF-gel에서는 pH 3.5~10의 ampholine을 사용하였으나, 주로 pH6~pH8 사이에서 6~9개의 bands를 보았다. 전체적으로 R.stolonifer의 pH가 R.acidus의 pH보다 낮았는데, 이는 최적 생장 pH가 R.acidus가 더 높은 것과 일치하는 결과였다. The paper reports on soluble-protein patterns using SDS-PAGE and IEF-gel for two species, R, acidus and R stolonifer, in the genus Rhizopus. There are over 30 polypeptide bands ranged from molecular weight 14,400 ddtons to 97,400 daltons on SDS-PAGE and no obvious differences between two species. On IEF-gel using ampholine pH 3.5-10 as canier ampholytes, all of polypeptide bands are over pH 6, ranged from pH 6.5 to pH 7.9. Polypeptide bands of R. acidus are slightly more basic than in R. stolonifer. This result coincides with optimum pH of growth.

RAPD 분석을 이용한 Fusarium 속(Genus)내 13종간의 분류학적 위치 규명

민병례,류지숙 상명대학교 기초과학연구소 1998 기초과학연구 Vol.11 No.-

Fusarium 13종의 분류학적 위치를 규명하기 위하여 arbitrary decamer primers를 사용하여 polymerase chain reaction-random amplified polymorphic DNA (RAPD) 방법을 사용하여 유전적인 다양성을 조사하였고, 증폭된 DNA의 PCR band patterns를 기초로 하여 UPGMA 방법으로 dendrogram을 그려 각 종간의 유사도를 구하였다. 선별한 8개의 primer에서는 평균적으로 1-9개의 bands가 0.1-3.0kb의 범위에서 나타나는 양상을 보였다. 13종간의 계통 분류학적 유사도는 0.58-0.85 사이로 나타났고, 가장 높은 유사도는 0.85로 section Elegans에 속하는 F. oxysporum과 section Liseola에 속하는 F.subglutinans 간에서 관찰되었다. To clarify the taxonomical classification of the genus Fusarium 13 species, genetic variation among them was assessed by RAPD using 8 arbitrary decamer primers. Similarity values were calculated from PCR patterns and based on these values a dendrogram was constructed by UPGMA method. We confirmed that the use of the RAPD procedure make it possible to distinguish among different species. The range of genetic similarity value among selected 13 species is 0.58 - 0.85, and the highest clustered value was 0.85 between F. subglutinans and F. oxysporum, which were belonged to different section.

Section Dlaminia에 속하는 균주들의 Chitinase isozyme 분석

민병례 상명대학교 자연과학연구소 2004 自然科學硏究 Vol.13 No.-