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        몽골 출토 옛사람 뼈와 치아에서 유전자 분석을 이용한 혈연관계조사

        문흐체첵 바좌라그촤(Munkhtsetseg Bazarragchaa),김기정(Kijeong Kim),김재현(Jae-Hyun Kim),가와치멛 르학와수렝(Gavaachimed Lkhagvasuren),박애자(Ae-Ja Park),이광호(Kwang-Ho Lee),김대진(Dae-Jin Kim),정윤희(Yoon-Hee Chung),김성수(Sung-Su Kim),이원 대한체질인류학회 2009 해부·생물인류학 (Anat Biol Anthropol) Vol.22 No.4

        몽골의 2000년 전의 한 고분군에서 발굴된 세 예의 옛사람뼈와 치아를 대상으로 유전자 분석을 이용해 혈연관계를 조사하였다. 각각의 옛사람에서 채취한 뼈와 치아의 처리는 오염방지시설인 청정실험실에서 실행하여 현대인 DNA에 의한 오염을 방지하였다. 핵산추출의 방법으로 ion-exchange column kit (Qiagen G-tip 20G, USA)를 이용하였다. 분리 정제한 옛사람뼈와 치아의 핵산에서 부계 반수체군(haplogroup), 모계 반수체군, 그리고 보통염색체 다형성표지자인 short tandem repeat (STR)을 대상으로 중합효소반응(polymerase chain reaction, PCR)을 하였다. 두 예에서 모계는 모두 D형이었으며, D형은 특히 현대 동북아시아지역에 흔한 유형 중의 하나였다. 이중 한 사람은 남성으로 부계는 C형으로 역시 현대 동북아시아 지역에 흔한 유형 중의 하나였다. 나머지 한 사람은 다른 두 사람의 것과는 달리 현대 유럽에서 가장 흔한 R형의 부계, 유럽과 동부지중해연안에 나타나는 U형의 모계이었다. 보통염색체 STR의 반복된 결과들이 동일한 값을 보여줘 DNA-VIEW 프로그램 (http://www.dna-view.com)을 이용해 STR 분석하였다. 두 예에서 모계의 반수체군은 같았으나, 세 예의 옛사람들 사이에 가까운 혈연관계는 없는 것으로 나타났다. 본 연구자들은 극히 일부의 연구자에서만 가능했던 옛사람뼈와 치아 DNA에서 보통염색체 STR의 연구의 가능한 방법을 이 연구를 통해 밝히고, 이 분야의 많은 연구자들이 보다 나은 연구결과를 도출해 낼 수 있기를 기대한다. The kinship was analyzed genetically on the three 2000 year old ancient human bones and teeth excavated in Mongolia. The samples were processed in a clean room to prevent the contamination from modem human DNA. The DNA extraction and purification was done with ion-exchange column kit (Qiagen G-tip 20G, USA). The PCR was done with purified DNAs from ancient human bones for paternal Y-SNP haplogroup, maternal mtDNA haplogroup, and autosomal short tandem repeats (STR). Two samples belonged to the maternal D major haplogroup, which is one of the most frequent types in the present North East Asia. One of them, showing male genotype, belonged to the paternal C major haplogroup, which is also one of the most frequent types in the present North East Asia. The remaining one belonged to the paternal R major haplogroup, frequent in the present Europe, and the maternal U haplogroup, frequent in the present Europe and East Mediterranean. The repeated results were consistent in the autosomal STR PCR. The STR data were analyzed with DNA-VIEW program (http://www.dna-view.com). which showed no close kinship among the three ancient humans. Our method was successful in the analyzing kinship among ancient human bones, which has been possible in few restricted laboratories in the World. Authors anticipate that many researchers could do their research in a better way to get the genetic information from ancient human bones.

      • KCI등재

        옛사람뼈 DNA에서 HLA-DRB1 염기서열의 분석

        우지영(Ji-Young Woo),김기정(Kijeong Kim),바좌라그촤 문흐체첵(Bazarragchaa Munkhtsetseg),김재현(Jae-Hyun Kim),가와치멛 르학와수렝(Gavaachimed Lkhagvasuren),손동섭(Dong-Suep Sohn),박애자(Ae-Ja Park),이광호(Kwang-Ho Lee),김대진(Dae-Jin Kim), 대한체질인류학회 2010 해부·생물인류학 (Anat Biol Anthropol) Vol.23 No.2

        옛사람 시료의 DNA 분석은 인류학 및 사람 진화 연구에서 최근 세계적으로 널리 이용되고 있는 추세이다. 인류의 유전자 연구에 있어서 사립체 DNA 및 Y 염색체 DNA와 더불어 널리 이용되고 있으나 옛사람으로부터 HLA 분석은 드문 형편이다. 본 연구에서는 고대 사람 시료로부터 HLA 유전자의 염기서열의 분석을 위해 PCR 증폭할 수 있는 방법을 개발하고자 하였다. 연구자들은 염기서열에 기초한 HLA-DRB1 분석을 위한 방법을 개발하였고, 3000년 전부터 500년 전에 해당하는 한국과 몽골 지역에서 출토된 옛사람뼈로부터 HLA-DRB1의 염기서열을 밝혀 대립유전자의 유형을 분석하였다. 유전자형은 HLA database (http://www.ebi.ac.uk/Tools/blast2/nucleotide.html)에서 염기서열을 비교하여 대립유전자형을 결정하였다. 한국인과 몽골인의 HLA-DRB1의 대립유전자는 유형별로 분리하여 구분하였고, 이외에도 몽골의 지형적 분류를 근거로 서부, 중부, 동부, 그리고 북부로 구분하여 각 대립유전자형의 빈도를 나타내었다. 종합하면 옛사람뼈에서 분리 정제한 DNA로부터 성공적으로 HLA-DRB1을 증폭하여 대립유전자의 유형을 분석할 수 있었다. 이 방법은 앞으로 HLA 염기서열 분석을 통해 개인이나 개체군의 유연관계 분석을 위해 이용될 수 있을 것으로 기대한다. The analysis of ancient human DNA is increasingly used recently in the study of anthropology and human evolution. Although mitochondrial DNA and Y chromosomal DNA has commonly been the target in the field of human DNA study, HLA analysis of ancient human DNA is extremely rare. This study aimed to develop the PCR method of ancient human DNA for analyzing the sequence of HLA. Authors established a new method for HLA-DRB1 analysis by sequence-based typing. Alleles of HLA-DRB1 were analyzed and typed by sequencing with DNA of ancient human skeletons from Korea and Mongolia 3000-500 years ago. The types of HLA-DRB1 were determined by comparing the sequences with those of HLA database (http://www. ebi.ac.uk/Tools/blast2/nucleotide.html). The alleles of HLA-DRB1 of ancient human DNA from Korea and Mongolia were classified by types. The frequencies of HLA-DRB1 types of Mongolia were also presented according to the geography such as West, Central, East, and North. In summary, our method was successful in the analyzing the type of HLA-DRB1 from DNA of ancient human bones. Authors anticipate that many researchers could do their research in a better way to get the genetic information for the kinship analysis between individuals or communities from ancient human bones.

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