큰느타리버섯의 자실체 생육특성

류재산 ( Jae San Ryu ),김민근 ( Min Keun Kim ),권진혁 ( Jin Hyeuk Kwon ),조숙현 ( Sook Hyun Cho ),김낙구 ( Nak Ku Kim ),노치웅 ( Chi Wong Rho ),이춘희 ( Chun Hee Lee ),노현수 ( Hyeon Su Ro ),이현숙 ( Hyun Sook Lee ) 한국균학회 2007 韓國菌學會誌 Vol.35 No.1

큰느타리버섯 재배의 최적 CO₂ 조건

류재산,김민근,조숙현,윤용철,서원명,이현숙,Ryu, Jae-San,Kim, Min-Keun,Cho, Sook-Hyun,Yun, Young-Chul,Seo, Won-Myung,Lee, Hyun-Sook 한국버섯학회 2005 한국버섯학회지 Vol.3 No.3

$CO_2$는 버섯의 발이를 촉진하고 갓의 생성을 억제해서, 담자포자를 가지는 주름(gill)의 발달을 억제하여 버섯의 품질을 결정하는데 영향을 미친다. 본 실험에서는 큰느타리버섯의 생육에 가장 적합한 $CO_2$농도를 구명하려고 1,600, 2,400, 3,200ppm 이하의 농도에서 버섯생육 실험하였다. 방임처리구에서 수확율은 방임조건 1,600, 2,400, 3,200ppm에서 각각 98.6, 99.3, 93.8%로 2,400ppm이 가장 우수하였고, 병당 무게에서도 2,400ppm이 가장 우수한 102.5g이 수확되었다. 품질은 2,400ppm이 6.1, 1,600ppm에서 5.5로 111% 우수하였다. 솎음처리구에서 품질은 1,600, 2,400, 3,200ppm에서 9.4, 9.5, 8.0로 2,400ppm이 가장 높았다. 병당 수확량은 1,600, 2,400, 3,200ppm에서 각각 90.7, 98.2, 77.3g 이어서 방임처리구와 마찬가지로 2,400ppm에서 많은 수확량을 보였다. 이러한 결과를 놓고 볼 때 방임과 솎음처리구의 최적 $CO_2$ 농도는 2,400ppm으로 사료된다. Carbon dioxide($CO_2$) promotes development of primordia and depress differentiation of sporophore and gill containing basidia, have an effect on quality. This experiments were conducted to elucidate optimal level of $CO_2$ for king oyster mushroom(Pleurotus eryngii). King oyster mushroom was cultivated under 1,600, 2,400, and 3,200ppm $CO_2$. Harvest ratio in normal plot were 98.6, 99.3, and 93.8% at 1,600, 2,400, 3,200ppm, respectively, so 2,400ppm is optimal. The yield per bottle was 102.5g at 2,400ppm, better than 99.7g at 1,600ppm, The $CO_2$ concentration of 2,400ppm was also the best condition for quality, 6.1 at 2,400ppm was 115% of 1,600ppm's. In thinning treatment plot, quality at 2,400ppm was 9.5 better than 1,600ppm whose quality was 9.4. The yields per bottle were 90.7, 98.2, 77.3g at 1,600, 2,400, 3,200ppm respectively. These results show that 2,400ppm was optimal $CO_2$ concentration for quantity of King Oyster mushroom as well as quality.

Development of PCR-based DNA markers for identification and detection of Trichoderma species associated with the green mold disease of oyster mushroom

박명수,서건식,류재산,김민경,이용국,Park, Myung Soo,Seo, Geon Sik,Ryu, Jae San,Kim, Min Kyung,Lee, Yong Kuk Korea National University of Agriculture and Fishe 2022 현장농업연구지 = Journal of practical agricultural resear Vol.24 No.3

Trichoderma is known as pathogen caused serious green mold disease on commercial production. T. pleuroti and T. pleuroticola were common species in various mushroom media. Many strains of T. pleuroti, known as aggressive species causing major economic losses in Korea, showed benomyl resistance. Accurate identification and detection of Trichoderma species associated with oyster mushrooms is very important for disease control. We developed species-specific primers for T. pleuroticola, T. pleuroti, T. harzianum, and T. atroviride based on species-specific fragments isolated from amplified fragment length polymorphism analysis. PCR products corresponding to the predicted fragment of 500bp, 230bp, 180bp, and 410bp were amplified from T. pleuroticola, T. pleuroti, T. harzianum, and T. atroviride, respectively. Multiplex PCR assay using species-specific primers quickly and accurately identified and detected T. pleuroti from mushroom media in which various species co-exist. Our results can be useful for the effective control of mushroom disease.

보문 : 천연배지 열수추출물을 이용한 큰느타리버섯 균사배양 적합 배지 개발

김민근 ( Min Keun Kim ),류재산 ( Jae San Ryu ),이영한 ( Young Han Lee ),이성태 ( Seong Tae Lee ),허재영 ( Jae Young Heo ),권진혁 ( Jin Hyeuk Kwon ) 한국균학회 2012 韓國菌學會誌 Vol.40 No.1

보문 : 단핵균주간 교잡에 의한 큰느타리버섯 신품종 "단비"의 특성

김민근 ( Min Keun Kim ),류재산 ( Jae San Ryu ),유영복 ( Young Bok Yoo ) 한국균학회 2011 韓國菌學會誌 Vol.39 No.1

A new cultivar "Dan Bi" of Pleurotus eryngii was developed by the method of mono-mono crossing between monokaryotic strains derived from KNR2312 and KNR2596. The parental strains, KNR2312 and KNR2596, are characterized by the property of high quality and a small number of primordia formation, respectively. The optimum temperature of mycelial growth was 25 and that of fruiting body development was 15~16℃. The period of harvesting including primordia formation was 0.7~1.3 days later than that of control strain Knneutari No. 3 in the culling cultivation. The color of pileus and stipe surface was neutral-brown and pure white, respectively. The shape of pileus was dome and has a scale like as cobweb. The yield was 93±9.7 g per 850 cc of plastic bottle. Analysis of the genetic characteristics of the new commercial variety "Dan Bi" showed a different profile as that of the control strain, Knneutari No. 3, when RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) primer #8005 was used. This new variety "Dan Bi" of Pleurotus eryngii is characterized by a small number of primordia formation after scratching.

베타글루칸 함량이 높은 큰느타리버섯 선발을 위한 SCAR marker 개발

김수철,김혜수,조용운,류재산,조수정,Kim, Su Cheol,Kim, Hye Soo,Cho, Yong Un,Ryu, Jae-San,Cho, Soo Jeong 한국버섯학회 2015 한국버섯학회지 Vol.13 No.1

본 연구는 큰느타리버섯의 베타글루칸 고함유 형질에 관련된 SCAR marker를 개발하기 위해 수행되었다. operon사의 OPA(20개), OPB(20개), OPL(20개), OPP(20개), OPR(20개), OPS(20개) 등 총 120개 primer를 random primer(10 mer)로 사용하여 대립 계통 9종과 베타글루칸 고함유 계통 9 종을 대상으로 RAPD를 이용한 bulked segregant analysis를 실시하여 OP-R03 primer로부터 대립 계통에는 나타나지 않고 베타글루칸 고함유 계통에만 나타나는 특이적인 RAPD 밴드를 얻었다. OP-R03 primer를 이용한 RAPD 결과, 약 91 bp 부근에서 베타글루칸 고함유 계통에 특이적인 DNA 밴드가 관찰되었으며 이 DNA 밴드의 염기서열 말단을 근거로 SCAR 마커로 사용할 specific primer인 OP-R03-1-F와 OP-R03-1-R를 디자인하였다. SCAR 마커 OP-R03-1-F/-1-R primer를 이용하여 PCR을 수행한 결과에서도 91 bp 부근에서 대립 계통과 구별되는 DNA 밴드가 베타글루칸 고함유 계통에서 확인되었으며 random primer인 OP-R03 primer를 이용하여 PCR을 수행했을 때보다 재현성이 높고 진한 DNA 밴드임을 확인할 수 있었다. In this study, SCAR marker that differentiates Pleurotus eryngii strains with higher ${\beta}$-glucan from control strain was developed. Genomic DNAs of 9 control strains of Pleurotus eryngii and 9 Pleurotus eryngii strains with higher ${\beta}$-glucan were analyzed by bulked segregant analysis (BSA) using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD). One-hundred twenty RAPD primers were screened on bulked DNA samples and a unique DNA fragment with the size of 91 bp was yielded by OP-R03 primer from the Pleurotus eryngii strains with higher ${\beta}$-glucan. A sequence characterized amplified region (SCAR) marker, designated as OP-R03-1-F and OP-R03-1-R, was designed on the basis of the determined sequence. The PCR analysis with the OP-R03-1 primer showed that this SCAR marker can clearly distinguish the Pleurotus eryngii strains with higher ${\beta}$-glucan from the control strains.

산느타리(Pleurotus pulmonarius) 품종의 초위성체(simple sequence repeats) 특성구명

최종인,나경숙,오민지,류재산,Choi, Jong In,Na, Kyeong Sook,Oh, Min-Ji,Ryu, Jae-San 한국버섯학회 2021 한국버섯학회지 Vol.19 No.4

국내의 주요 산느타리 품종인 호산47(일핵, 산타리 배우자), GB19(일핵, 산타리 배우자), 호산, 여름느타리1호, 삼복, 강산, 약산, 자산, 향산, 여름느타리2호의 유전체를 Hiseq을 이용하여 해독하였고 이 서열 정보에서 SSR을 분리하여 특성구명을 하였다. 일핵균사인 호산 47, GB19의 유전체의 크기는 각각 37.3와 37.2 Mbp이고, 이핵균사인 나머지 산느타리 품종의 유전체 크기는 47.1~61.1 Mbp인 것으로 밝혀졌다. 품종별 총 SSR의 수는 HS47이 711개로 가장 적고, 강산이(GS)이 1.5배 많은 1,106개로 최다를 기록하였다. SSR의 repeat motif 중에서 hexanucleotide와 octanucleotide가 가장 많은 빈도로 관찰되었고, 가장 많이 관찰되는 반복서열은 CGA/TCG, A/T, CTC/GAG이었다. SSR의 길이는 모든 품종에서 변이가 많아 유용성이 높은 20~30 nt가 가장 높은 비중인 70%를 차지하였다. Simple sequence repeats (SSRs) were isolated from major Pleurotus pulmonarius cultivars in Korea, namely 'HS47' (monokaryon, gamete of 'Santari'), 'GB19' (monokaryon, gamete of 'Santari'), 'Hosan,' 'Yeoleumneutali1,' 'Sambok,' 'Gangsan,' 'Yaksan,' 'Jasan,' 'Hyangsan,' and 'Yeoleumneutali2,' and characterized via HiSeq genome sequencing and bioinformatic analysis. The genome sizes of the monokaryons 'HS47' and 'GB19' were estimated to be 37.3 and 37.2 Mb, respectively, and those of the other dikaryotic cultivars ranged from 47.1 to 61.1 Mb. A total of 711 (smallest) and 1,106 (1.5 times the smallest) SSRs were found in the 'HS47' and 'Gangsan' genomes, respectively. Hexanucleotide and octanucleotide motifs accounted for the top two fractions of all SSRs. CGA/TCG, A/T, and CTC/GAG were the most frequently detected nucleotides in the SSRs. Most of the SSRs were 21~30 nucleotides long (hypervariable for application), accounting for 70% of all lengths of SSRs.

딸기 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커 개발

제희정(Hee-Jeong Je),안재욱(Jae-Wook Ahn),윤혜숙(Hae-Suk Yoon),김민근(Min-Keun Kim),류재산(Jae-San Ryu),홍광표(Kwang-Pyo Hong),이상대(Sang-Dae Lee),박영훈(Young-Hoon Park) 한국원예학회 2015 원예과학기술지 Vol.33 No.5

딸기 흰가루병은 Podosphaera aphanis에 의해 발병되며 수확기에 가장 큰 피해를 주는 병으로 현재 유황, 농약으로 주로 방제 되고 있는 실정이다. 본 연구에서는 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 흰가루병 저항성 특이마커 개발로 내병성 육종효율을 높이고자 하였다. 흰가루병 저항성 계통 선발을 위한 분자마커를 개발하기 위해 아키히메×설향 집단을 대상으로 자가수분을 통해 후대 양성 후 병저항성을 검정하였다. 마커분석은 RAPD primer 200 세트 중 OPE10 331bp에서부터 흰가루병 저항성 특이 마커 선발하였다. 흰가루병 저항성 특이밴드만 선발하기 위하여 클로닝후 유전자정보 분석하여 SP1F/R의 Primer를 제작하였다. 그러나 SP1F/R을 이용하여 PCR한 결과 저항성, 감수성간에 다형성이 확인되지 않아 염기서열을 정렬한 후 SNP, In/del의 다형성 유무를 확인한 결과 6개의 SNP를 확인하였다. 이들 PCR 산물을 해당 사이트와 연관된 제한효소로 절단한 결과 그 중 Eae I(Y/GGCCR)의 절단으로 231bp 위치에서 저항성과 감수성간의 다형성을 확인함으로써 흰가루병 저항성계통선발을 위한 분자마커를 선발하였다. 이러한 과정을 통해 딸기 흰가루병 저항성 품종 육성을 위한 MAS(marker assisted selection) 체계 확립으로 내병성 육종효율 증진에 기여를 할 수 있을 것으로 기대된다. Powdery mildew (PM) caused by Podosphaera aphanis is a major disease that can result in significant yield losses in strawberry (Fragaria × ananassa Duchesne). For preventing PM, pesticides are usually applied in strawberry. In this study, molecular markers were developed to increase breeding efficiency of PM-resistance cultivars by marker-assisted selection (MAS). An F₂ population derived from a cross between PM-resistance ‘Seolhyang’ and PM-susceptibility ‘Akihime’ was evaluated for disease resistance to PM and RAPD (random amplification of polymorphic DNA)-BSA (bulked segregant analysis). Among 200 RAPD primers tested, OPE10 primer amplified a 311bp-band present in with 331bp. Sequence alignment performed for searching polymorphisms and six single nucleotide polymorphism (SNP) were found in amplified regions. To develop polymorphic marker for distinguishing between resistant and susceptible, RAPD was converted to cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) marker. Among restriction enzymes associated with six SNPs, Eae I (Y/GGCCR) was successfully digested to 231bp in susceptible. The results suggest that the selected CAPS marker could be used for increasing efficiency of selecting powdery mildew resistant strawberry in breeding system.

Multiplex SSR마커를 이용한 느타리(Pleurotus ostreatus) 품종 판별

최종인,정화진,나경숙,오민지,김민근,류재산,Choi, Jong In,Jung, Hwa Jin,Na, Kyeong sook,Oh, Min-Ji,Kim, Min-Keun,Ryu, Jae-San 한국버섯학회 2021 한국버섯학회지 Vol.19 No.1

느타리 품종구분을 위한 마커의 개발을 위하여 곤지7호의 어버이 일핵 균사중의 하나인 MT07156-97의 전체 유전자 염기서열을 바탕으로 제작한 251개의 SSR 프라이머를 제작하였다. 우선적으로 수한1호, 곤지7호, 흑타리 품종에 다형성 여부를 관찰하여 20개의 SSR을 선발하고, 이를 10개 품종에 적용하였다. 단일의 프라이머로는 일부 품종이 구분되지 않았으므로, 선발된 프라이머 간의 다양한 조합(multiplex 방식)을 적용한 결과 모든 품종을 판별할 수 있는 분자마커 다형성을 보인 프라이머 "166+115" 조합을 선발하였다. 별도로 프라이머 115와 166가 만들어 낸 산술적인 유전자좌(loci) 31개보다 12개 많은 40개의 유전자좌가 증폭되어 다양한 품종에 특이적인 분자마커를 제공할 수 있었다. 개발된 분자마커는 종균의 품질관리, 품종의 판별, 신품종 보호에 활용될 수 있을 것이다. To develop a method for the differentiation of Pleurotus ostratus cultivars, the multiplex-simple sequence repeat (SSR) primer set based on the SSRs obtained from whole genomic DNA sequence analysis was designed with two polymerase chain reaction (PCR) primer sets. These SSR primer sets were employed to distinguish 10 cultivars and strains. Twenty polymorphic markers were selected based on the genotyping results. PCR with each primer produced 1-4 distinct bands ranging in size from 150 to 350 bp, which was within the expected range. However, since a sole SSR marker was unable to detect polymorphisms in every cultivar, multiplex PCRs with composite PCR primer sets were employed. The multiplex primer, "166+115," completely discriminated 12 cultivars and strains with 40 loci, which were 12 more than the simple arithmetic addition of each locus of the primers 115 and 166. These results might be useful to provide an efficient method for the differentiation of P. ostreatus cultivars with separate PCRs for the quality control of spawn and protection of breeders' rights.

Investigation of the Possibility of Using Functional Material Using Bellflower Buds

Eunheui Han(한은희),Min Keun Kim(김민근),Jae San Ryu(류재산),Byeong Jeong Lee(이병정),Kwang Pyo Hong(홍광표) 한국약용작물학회 2017 한국약용작물학회 학술대회논문집 Vol.2017 No.2